外泌體是一種細胞分泌的微小膜泡,大小為30~150nm的磷脂雙分子結(jié)構(gòu),可在細胞間傳遞物質(zhì)和信號。它在機體內(nèi)廣泛存在,如外周血、腹水、尿液、唾液、腦脊液等各種體液中。
外泌體攜帶有多種蛋白質(zhì)、脂類、DNA和RNA等重要信息,不僅在細胞與細胞間的物質(zhì)和信息傳遞中起重要作用,更有望成為多種疾病的早期診斷標志物。
但外泌體所存在的體液環(huán)境復(fù)雜,在尺寸、形態(tài)和生化特性等方面又存在著較大的差異,因此如何能有效地分離出外泌體以供進一步研究一直是該領(lǐng)域的難題。
本篇跟大家簡單介紹一下,外泌體提取與純化過程中常用到的一些方法,以及各種方法的特點。
六大提取與純化法
1、差速離心法
差速離心法是最常見的外泌體分離技術(shù)之一。這種方法利用外泌體與其他細胞器的沉降系數(shù)不同,將細胞、細胞碎片以及其他細胞器等,通過不同離心速度分離出去,從而得到純凈的外泌體。
優(yōu)點:提取方法簡單,提取過程中不會引入其他的標記物,適合大劑量的樣品處理。
缺點:操作繁瑣,費時費力,操作過程中需要超高速離心,且由于離心力的因素,可能會導(dǎo)致外泌體結(jié)構(gòu)破壞從而對下游實驗造成影響,對于一些具有高粘度的生物樣品(例如血漿和血清樣本),則需要更長的超速離心步驟和更高的離心速度。
2、密度梯度離心法
該方法將超速離心與蔗糖密度梯度相結(jié)合,利用外泌體1.13g/ml-1.21g/ml的密度范圍,實現(xiàn)外泌體與非囊泡顆粒(如蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)/RNA聚集體等)進行分離,從而能夠提取含量低的外泌體。
2018年Li K等人改良了此方案,使用碘克沙醇作為新的一種高效介質(zhì),外泌體回收率更高、純度更高,并且結(jié)構(gòu)和功能保持更好。
3、聚合物沉降法
這種方法是通過高分子的疏水聚合物(如聚乙二醇(PEG))可以改變外泌體溶解性和分散性的特點,使其能夠在比較低的離心力下沉降出來。其原理可能與疏水聚合物競爭性結(jié)合游離水分子以及疏水聚合物本身形成的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)有關(guān)。
優(yōu)點:操作起來較為簡單,不需要超速離心機,得到的外泌體數(shù)量較多,對外泌體理化性質(zhì)影響較小。
缺點:基于聚合物的沉淀方法可能會同時分離非囊泡污染物(如脂蛋白等),從而對下游分析造成一定影響。
4、超濾法
這種方法是將溶劑及小分子物質(zhì)過濾到膜的另一側(cè),而將相對大分子物質(zhì)截留在超濾膜上,以達到分離的目的。外泌體直徑范圍30~150 nm,利用超濾膜經(jīng)過長時間的低速離心就可以分離樣本中的外泌體。
優(yōu)點:操作方便,富集效率比較高,易于搭配其他膜或操作,并且成本較低。
缺點:過膜易損耗變形,導(dǎo)致膜堵塞,純度較低,大顆粒蛋白污染嚴重,并且在洗脫過程中,附著于膜上的外泌體難以回收,導(dǎo)致提取損失。
5、磁珠特異性捕獲法
磁珠特異性捕獲法外泌體表面帶有許多特殊的膜蛋白,如CD9、CD63、CD81等,可將這些外泌體標志蛋白作為分離外泌體的特異性標記。通過將抗體固定于磁珠等基質(zhì)上,利用抗體與這些標志蛋白之間的特異性相互作用,從而得以實現(xiàn)對外泌體的特異性富集。
優(yōu)點:獲得的外泌體純度較高,并且外泌體膜結(jié)構(gòu)不受太大影響。最近的一項研究已應(yīng)用免疫親和超順磁性納米粒子(ISPN)來結(jié)合外泌體,研究人員通過連接抗CD63抗體和納米粒子生成ISPN,并用它們從體液中分離外泌體。
6、尺寸排阻色譜法
這種方法利用多孔的凝膠球,通過分子大小不同將外泌體純化出來。在分離提取過程中,大分子物質(zhì)不能進入凝膠孔,很快沿多孔凝膠間的縫隙被流動相洗脫出來,而小分子物質(zhì)能進入凝膠孔,滯留時間更長,會更慢地被洗脫出來。外泌體的分子粒徑大于一般的蛋白分子,所以外泌體會先被洗脫下來,而粒徑小的蛋白質(zhì)會被后洗脫下來,從而分離出高純度的外泌體。
優(yōu)點:獲得的外泌體純度相對較高,且外泌體結(jié)構(gòu)不易受到破壞。