DNA 編碼化合物庫的構建、合成與篩選技術介紹
DNA 編碼化合物庫（DNA Encoded compound Library，DEL）技術作為新穎、強大的苗頭化合物發(fā)現引擎，可快速從幾千萬至數十億分子中，遴選出結構新穎、具有潛在成藥性的化合物，大大縮短藥物研究周期，降低研發(fā)成本。在 DEL 庫中，每一個分子砌塊（Building Block）都由一段已知唯一的 DNA 序列進行標記，通過 DNA 兼容反應和組合化學模式，歷經數個循環(huán)即可獲得上億 DEL 分子。數十億化合物可以混合在一管中篩選，最終通過高通量測序技術，解碼 DEL 分子的專屬 DNA 標簽，快速獲得針對靶點的苗頭化合物信息。
圖1. DEL 庫的構建和篩選
DNA 編碼化合物庫構建、合成
分子砌塊是 DEL 庫設計、合成的基礎�；� 50000 余種高質量、結構多樣的分子砌塊， MCE 優(yōu)中擇優(yōu)，剔除 DNA 嵌入劑、含 N-鹵代、重金屬等的“不良”化學結構，保留骨架獨特、結構新穎、官能團多樣、化學空間覆蓋范圍廣的化合物。結合 MCE 自主開發(fā)的數百種 DNA 兼容性化學反應，最終構建出化學空間多樣、結構新穎、包含數十億化合物的 DEL 庫。
圖2. DEL 庫的構建
DEL 庫規(guī)格
3 個量級：
DEL A Kit：20 個 DEL 庫，3 億個 DEL 分子，1 管集合
DEL B Kit：50 個 DEL 庫，10 億個 DEL 分子，1 管集合
DEL T Kit：68 個 DEL 庫，20 億個 DEL 分子，1 管集合
Mini DEL 庫：
DEL C Kit 共價庫：5 個 DEL 庫，0.03 億個 DEL 分子，1 管集合
DEL D Kit 環(huán)肽庫：5 個 DEL 庫，0.08 億個 DEL 分子，1 管集合
DEL E Kit 常規(guī)庫：5 個 DEL 庫，1.9 億個 DEL 分子，1 管集合
DEL F Kit 常規(guī)庫：5 個 DEL 庫，1.09 億個 DEL 分子，1 管集合
DEL G Kit 常規(guī)庫：5 個 DEL 庫，1.13 億個 DEL 分子，1 管集合
DEL H Kit 常規(guī)庫：10 個 DEL 庫，5.5 億個 DEL 分子，1 管集合
2 種規(guī)格：
5 nmol、20 nmol
DEL 庫優(yōu)點
?68 個 DEL 庫，數十億 DEL 分子
化學結構新穎，化學空間覆蓋范圍廣，具備類藥分子特性
強大的合成能力
嚴格的質量控制、驗證體系
完善的產品、數據管理系統(tǒng)
緊跟研究趨勢，不斷更新
DNA 編碼化合物庫定制服務
MCE 不僅可以提供一站式的 DEL 篩選服務，更有熱門的光交聯 DEL 庫、共價 DEL庫、環(huán)肽 DEL 庫等 DEL 庫供選擇，同時可提供 DEL 庫定制服務，根據具體化合物結構類型，快速的衍生合成出數以百計的 DEL 分子。MCE 擁有強大而專業(yè)的 DEL 合成團隊，緊跟科學前沿開發(fā)了數百種 DNA 兼容的化合物反應。
相較于傳統(tǒng)的高通量篩選，DEL 篩選可以一次性篩選數以億計的化合物；大大節(jié)約靶蛋白的使用量；篩選周期大大縮短；篩選成本更加低廉。DEL 庫的篩選策略基本流程是將 DEL 庫與靶標進行孵育后，基于小分子-蛋白質的親和結合作用力，經過不同的洗脫方式，除去非結合小分子，實現具有高親和力的小分子配體的高倍富集，結合 PCR 擴增與下一代測序的技術，可根據小分子的 DNA 標簽實現化合物信息的解碼。
圖3. DNA 編碼化合物的篩選策略：固相篩選
DEL 庫篩選流程
a.蛋白固載與孵育：將待篩選的靶蛋白預先固載，隨后將固載的蛋白質與 DEL 庫孵育。
b.洗雜：洗去不與蛋白結合或結合力弱的 DEL 分子。
c.洗脫：將與蛋白結合的 DEL 分子洗脫，實現高親和力小分子的富集。
d.PCR 擴增與蛋白結合 DEL 分子的 DNA 標簽。
e.高通量測序與數據分析：對擴增后的 DNA 標簽進行下一代測序，根據 DEL 小分子的 DNA 標簽實現化合物信息的解碼。
DEL 庫篩選優(yōu)點
一站式服務：DEL 庫合成與 DEL 庫篩選
少量蛋白樣本：約 100 μg 蛋白（具體根據蛋白分子量決定）
4-5 周交付結果
嚴格的數據隱私管理
專業(yè)的技術團隊
