快速基因條碼NextGenPCR和MinION在生態(tài)樣本進行物種級分類的應用

瀏覽次數(shù)：548　發(fā)布日期：2023-9-1　來源：本站　僅供參考，謝絕轉(zhuǎn)載，否則責任自負

DNA 條碼可用于標本樣本的物種級分類，但很少用于需要在數(shù)小時內(nèi)估計物種豐富度或鑒定害蟲或入侵物種的時間比較緊的項目。主要原因是現(xiàn)有的快速條形碼工作流程要么過于昂貴，要么只能由訓練有素的員工在裝備精良的實驗室中執(zhí)行。

德國萊布尼茨進化與生物多樣性科學研究所的綜合生物多樣性發(fā)現(xiàn)中心研發(fā)了一個簡單的工作流程。他們採用HotSHOT對樣本進行快速 DNA 提取、並利用MBS公司的NextGen PCR® 系統(tǒng)進行快速基因條碼及擴增基因片段，以及使用低成本 MinION 測序儀進行測序進行樣本測序。最後，他們在 6 小時內(nèi)為 285 個標本生成和識別 250 個基因條碼來展示該方法的強大功能和高效性。他們們認為使用簡化的基因條碼工作流程使現(xiàn)在的物種級分類可以更快，更準確，并且具有足夠的成本效益。它應該在許多項目中取代形態(tài)物種分類。