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Akoya空間單細(xì)胞蛋白組揭示腫瘤細(xì)胞外基質(zhì)對(duì)腫瘤免疫識(shí)別的調(diào)節(jié)作用

瀏覽次數(shù):824 發(fā)布日期:2023-7-10  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
雖然免疫檢查點(diǎn)阻斷療法已被證明在部分癌癥中非常成功,但這些療法的靶點(diǎn)并不存在于大多數(shù)乳腺癌中。目前的研究仍不能解釋為什么乳腺癌中的免疫檢查點(diǎn)表達(dá)有限,在這類癌癥中如何激活免疫系統(tǒng)仍是一個(gè)沒(méi)有明確答案的問(wèn)題。盡管在乳腺癌中缺乏可用作治療靶點(diǎn)的免疫檢查點(diǎn),轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果顯示大部分乳腺癌顯示出免疫活性,一半以上的乳腺癌顯示出中到高度的淋巴細(xì)胞浸潤(rùn),75%的乳腺癌含有三級(jí)淋巴結(jié)構(gòu)(TLS)。
 
新出現(xiàn)的證據(jù)表明,腫瘤細(xì)胞外基質(zhì) (ECM) 除了在調(diào)節(jié)腫瘤本身功能和周圍基質(zhì)行為方面的已知作用外,還可能在腫瘤-免疫相互作用中發(fā)揮作用。具有高免疫浸潤(rùn)的乳腺腫瘤具有獨(dú)特的 ECM 特征,并且 T 細(xì)胞排斥與特定的 ECM 特征有關(guān)。此外,在乳腺腫瘤中發(fā)現(xiàn)的少數(shù)特定 ECM 或 ECM 相關(guān)分子,包括半乳凝素1和3、TGFβ 和層粘連蛋白332與免疫抑制有關(guān),這表明 ECM 和 ECM 相關(guān)分子可以在抗腫瘤免疫中發(fā)揮調(diào)節(jié)作用。這些證據(jù)提出了靶向調(diào)節(jié)腫瘤-ECM相互作用,以增強(qiáng)免疫治療療效,并增加患者從這些療法中受益的可能性。此外,既往研究表明EMC中的膠原蛋白會(huì)促進(jìn) PD-1/PD-L1 抗性,整合素 αVβ6 和 αVβ8 被認(rèn)為可調(diào)節(jié)免疫逃避。
 
盡管一系列的研究表明免疫浸潤(rùn)和腫瘤基質(zhì)之間存在聯(lián)系,但尚不清楚 ECM 是否可以直接影響免疫系統(tǒng)清除腫瘤的最終步驟。為了研究ECM底物是否具有控制 T 細(xì)胞清除惡性乳腺癌細(xì)胞的能力,來(lái)自美國(guó)勞倫斯利弗莫爾國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的研究人員對(duì)此進(jìn)行了研究,并將研究成成果“Extracellular matrix modulates T cell clearance of malignant cells in vitro“發(fā)表在的Biomaterials雜志上。 
 
在文章中,研究者比較了培養(yǎng)的惡性細(xì)胞與來(lái)自健康動(dòng)物的不匹配的 T 細(xì)胞的存活率,結(jié)果顯示雖然纖連蛋白或玻連蛋白促進(jìn)了有效的腫瘤清除,但膠原蛋白 4 (Col4) 抑制了 T 細(xì)胞介導(dǎo)的殺傷。RNAseq 顯示 T 細(xì)胞相關(guān)基因的表達(dá)被培養(yǎng)基加入Col4后抑制,免疫抑制細(xì)胞因子被培養(yǎng)基加入Col4后上調(diào)。體內(nèi)數(shù)據(jù)也顯示,與 Col4 高劑量區(qū)的 T 細(xì)胞相比,Col4 貧乏區(qū)的 CD8+ T 細(xì)胞更可能接觸非分裂期腫瘤細(xì)胞,提示該基質(zhì)蛋白可能在乳腺癌的“免疫冷”表型中起關(guān)鍵作用。
 
 
 為了確定 Col4膠原蛋白與體內(nèi) T 細(xì)胞功能之間的關(guān)系,研究人員對(duì)在 BALB/c 同基因宿主中原位生長(zhǎng)的 MCC 腫瘤的組織切片進(jìn)行了PhenoCycler(原CODEX)10個(gè)標(biāo)志物免疫熒光原位成像實(shí)驗(yàn)。通過(guò)Akoya空間單細(xì)胞蛋白組(PhenoCycler)技術(shù)觀察到 CD4+ 和 CD8a+ T 細(xì)胞與腫瘤周圍和腫瘤實(shí)質(zhì)中的血管結(jié)構(gòu)高度關(guān)聯(lián),如 CD4和 CD8a 與 CD31 的共定位所示(圖A)。研究發(fā)現(xiàn),平均而言CD4+ 或 CD8+ 細(xì)胞比 CD4- 和 CD8- 細(xì)胞更高的更傾向于出現(xiàn)在 Col4 染色周圍(圖B)。進(jìn)一步通過(guò)使用無(wú)偏聚類來(lái)識(shí)別腫瘤內(nèi)的非T細(xì)胞群,研究人員發(fā)現(xiàn)了兩個(gè) CD31 血管系統(tǒng)群和三個(gè) Ki67 和 MHC 表達(dá)不同的腫瘤細(xì)胞群(圖D和E)。之后進(jìn)行了空間分析以確定細(xì)胞群之間的接觸頻率(圖 G 和 H)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與 Col4Hi T 細(xì)胞相比,Col4Lo T 細(xì)胞更可能顯示 Ki-67 染色并且不太可能接觸復(fù)制的腫瘤細(xì)胞,這與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果一致。

 
 本研究結(jié)合了體外實(shí)驗(yàn)與體內(nèi)實(shí)驗(yàn),應(yīng)用了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,Akoya空間單細(xì)胞蛋白組技術(shù)(PhenoCycler進(jìn)行超多重?zé)晒獬上褚约皢渭?xì)胞測(cè)序等多種方法,對(duì)細(xì)胞外基質(zhì)對(duì)腫瘤-免疫細(xì)胞相互作用的影響進(jìn)行研究,補(bǔ)充了腫瘤微環(huán)境研究中細(xì)胞外基質(zhì)作用的研究,為復(fù)雜的腫瘤微環(huán)境研究提供了新的視野。使用PhenoCycler單細(xì)胞原位空間組學(xué)技術(shù)進(jìn)行超多重免疫熒光原位成像,可以在組織原位標(biāo)記多種研究靶標(biāo),并對(duì)靶標(biāo)的表達(dá)強(qiáng)度,其所代表的細(xì)胞亞型的空間位置關(guān)系和相互作用進(jìn)行深入研究。
 
 
PhenoCycler空間單細(xì)胞蛋白組學(xué)
華盈生物提供服務(wù)的Akoya的PhenoCycler(原CODEX)技術(shù)平臺(tái),采用專利的DNA偶聯(lián)抗體檢測(cè)技術(shù)結(jié)合自動(dòng)化高分辨熒光顯微鏡,可還原蛋白質(zhì)和特定細(xì)胞在組織中的真實(shí)分布?蓪(shí)現(xiàn)近百種蛋白質(zhì)的空間原位檢測(cè)。
 
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
● 分辨率高,精確到0.251μm。
● 相比IMC,可實(shí)現(xiàn)全片掃描,無(wú)需預(yù)先限定感興趣區(qū)域(ROI)。
● >70種已驗(yàn)證的DNA偶聯(lián)抗體可供自由選擇組合。
● 定制化更加靈活,可與商品化panel聯(lián)合使用。
 
相關(guān)文獻(xiàn)
1.Extracellular matrix modulates T cell clearance of malignant cells in vitro. Biomaterials. Volume 282, March 2022, 121378.
 
該文章轉(zhuǎn)自:AkoyaBio微信公眾號(hào)
 
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