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非靶代謝組及脂質(zhì)組檢測(cè)分析在三陰性乳腺癌鐵死亡異質(zhì)性揭示中的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):527 發(fā)布日期:2023-4-18  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

文章標(biāo)題:Ferroptosis heterogeneity in triple-negative breast cancer reveals an innovative immunotherapy combination strategy
發(fā)表期刊:Cell Metabolism

影響因子:31.373
作者單位:復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院
發(fā)表時(shí)間:2022年10月
百趣生物提供服務(wù):非靶代謝組+脂質(zhì)組檢測(cè)分析

項(xiàng)目背景介紹
三陰性乳腺癌(Triple-negative breast cancer ,TNBC)是臨床上一種異質(zhì)性疾病,約占確診乳腺癌的15%。因異質(zhì)性高、預(yù)后差、復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)高等特點(diǎn),成為乳腺癌研究中亟需攻克的頑固“堡壘”。2019年邵志敏/江一舟團(tuán)隊(duì)根據(jù)分子特征、代謝重編程和腫瘤微環(huán)境方面的異質(zhì)性提出三陰乳腺癌的“復(fù)旦分型”,隨后又針對(duì)不同亞型進(jìn)行了系列精準(zhǔn)治療臨床試驗(yàn)。與傳統(tǒng)化療相比,新的療法治療效果水平呈上升趨勢(shì),但是低于預(yù)期。


鐵死亡(Ferroptosis)是一種非凋亡性和鐵依賴性細(xì)胞死亡方式,近年來在腫瘤研究領(lǐng)域表現(xiàn)活躍。在Fe2+或酯氧合酶的作用下,含多不飽和脂肪酸鏈的磷脂(PE-PUFAs)發(fā)生脂質(zhì)過氧化,誘導(dǎo)細(xì)胞鐵死亡,這一過程受多種代謝途徑的調(diào)控,然而TNBC鐵死亡的特性仍未揭示。因此TNBC“復(fù)旦分型”仍需進(jìn)一步的研究,探尋新的治療靶點(diǎn),以發(fā)現(xiàn)TNBC新的治療突破口。

技術(shù)路線


研究結(jié)果
1.TNBC“復(fù)旦分型”各亞型鐵死亡具有異質(zhì)性
本研究通過對(duì)TNBC轉(zhuǎn)錄組、非靶代謝組及脂質(zhì)組數(shù)據(jù)集分析和驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)證實(shí)“復(fù)旦分型”中各亞型鐵死亡存在異質(zhì)性。代謝組學(xué)分享,間質(zhì)樣亞型(Mesenchymal-like, MES)呈現(xiàn)HAMP(鐵穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)因子,圖1C)低表達(dá)和鐵代謝的失調(diào)(圖1E);腔面雄激素受體亞型(luminal androgen receptor, LAR)與鐵死亡相關(guān)的代謝途徑被激活(圖1A),鐵死亡相關(guān)基因、蛋白及代謝物出現(xiàn)高度活躍(圖1B-F);與LAR亞型相比,免疫調(diào)節(jié)亞型(immunomodulatory, IM)和基底樣免疫抑制亞型(basal-like and immune-suppressed, BLIS)鐵死亡相關(guān)通路變化水平較低,未出現(xiàn)顯著鐵死亡相關(guān)特性(圖1A)。這一結(jié)果表明LAR亞型是TNBC中鐵死亡敏感性最高的亞型。
 


圖1. TNBC各亞型中鐵死亡相關(guān)特征的異質(zhì)性


2.谷胱甘肽(GSH)代謝中的GPX4是調(diào)控LAR亞型腫瘤鐵死亡的關(guān)鍵靶點(diǎn)

代謝組通路富集分析顯示,LAR亞型腫瘤GSH代謝顯著上調(diào),GPX4在LAR亞型腫瘤中表達(dá)量高且對(duì)鐵死亡高度敏感(圖1F、圖2)。代謝組學(xué)分享,基于以上發(fā)現(xiàn)進(jìn)行細(xì)胞和類器官的藥敏實(shí)驗(yàn),進(jìn)一步探索了針對(duì)LAR亞型腫瘤鐵死亡的最佳治療策略,結(jié)果表明GPX4抑制劑RSL3對(duì)LAR亞型抑制效果更加明顯(圖3)。

 


圖2. GSH代謝是抑制LAR亞型腫瘤鐵死亡的關(guān)鍵
 

圖3. 不同敏感性的鐵死亡誘導(dǎo)劑突顯了GPX4在LAR亞型腫瘤中的重要性


3. 雄激素受體(AR)與GPX4啟動(dòng)子結(jié)合,雙向調(diào)控LAR亞型腫瘤鐵死亡
為了探索LAR亞型腫瘤中GPX4表達(dá)增加的機(jī)制,作者首先對(duì)多組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,結(jié)果顯示AR信號(hào)通路密切相關(guān)的FA代謝、雄激素反應(yīng)等通路與GPX4的表達(dá)呈現(xiàn)正相關(guān)(圖4A)。免疫印跡和qPCR的結(jié)果表明,AR對(duì)LAR亞型腫瘤中的GPX4起到調(diào)控作用(圖4B)。代謝組學(xué)分享,進(jìn)一步的熒光素酶報(bào)告基因及ChIP-qPCR發(fā)現(xiàn)AR與GPX4-2500~-2000bp啟動(dòng)子區(qū)的AR結(jié)合位點(diǎn)(AR binding sites, ABSs)結(jié)合并驅(qū)動(dòng)GPX4的表達(dá),從而調(diào)控LAR亞型中的GPX4高表達(dá)(圖4C)。
 


圖4. AR是LAR亞型腫瘤中GPX4表達(dá)的關(guān)鍵調(diào)控因子


基于AR對(duì)GPX4的調(diào)控作用,作者對(duì)AR抑制劑是否與GPX4抑制劑一樣,可以作為促進(jìn)LAR亞型腫瘤鐵死亡的潛在抑制因子這一問題進(jìn)行探究。代謝組學(xué)分享,通過免疫印跡、脂質(zhì)過氧化檢測(cè)和BODIPY581/591C11染色對(duì)AR抑制劑和GPX4抑制劑誘導(dǎo)的LAR亞型腫瘤細(xì)胞系鐵死亡進(jìn)行對(duì)比,AR抑制劑并未明顯提高腫瘤細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)過氧化水平(圖5A-C),究其原因是AR在細(xì)胞中的調(diào)控作用是雙向的,AR既可以促進(jìn)鐵死亡相關(guān)多不飽和脂肪酸的生物合成,又可以上調(diào)GPX4的表達(dá),減少引起鐵死亡的脂質(zhì)過氧化(圖5D-E)。相較于抑制AR,GPX4抑制劑誘導(dǎo)LAR腫瘤鐵死亡的效果更佳。
 


圖5. AR具有雙重作用來調(diào)節(jié)鐵死亡


4.GPX4抑制劑抑制腫瘤生長(zhǎng)、對(duì)腫瘤微環(huán)境進(jìn)行重編
基于以上的體外研究,確定了LAR亞型的鐵死亡敏感性和GPX4抑制劑具有誘導(dǎo)鐵死亡作用。代謝組學(xué)分享,作者通過建立LAR亞型乳腺癌小鼠模型進(jìn)行體內(nèi)實(shí)驗(yàn)(圖6A-B),發(fā)現(xiàn)無論是沉默Gpx4基因還是使用GPX4抑制劑都可以顯著誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞的鐵死亡,抑制腫瘤生長(zhǎng),增加CD8+、CD4+等不同亞群T細(xì)胞數(shù)量,觸發(fā)腫瘤微環(huán)境獲得炎癥表型,使LAR亞型腫瘤微環(huán)境由“冷”轉(zhuǎn)“熱”(圖6 C-F)。
 


圖6. GPX4抑制劑在體內(nèi)抑制腫瘤生長(zhǎng)并重新編程腫瘤微環(huán)境


5. GPX4抑制劑聯(lián)合ICB療法為L(zhǎng)AR亞型腫瘤治療帶來新方向
為了測(cè)試GPX4抑制劑和免疫檢查點(diǎn)阻斷(immune checkpoint blockade,ICB)治療是否起到協(xié)同作用,通過TS/A小鼠乳腺癌細(xì)胞系來建立TS/A異種移植瘤進(jìn)行體內(nèi)實(shí)驗(yàn)(圖7A),結(jié)果顯示與單一治療相比,GPX4抑制劑和PD-1抗體聯(lián)合治療顯著抑制腫瘤生長(zhǎng),雖然未引起免疫細(xì)胞浸潤(rùn),但PRF1+CD8+T細(xì)胞和GZMB+CD8+T細(xì)胞的比例顯著增加,出現(xiàn)明顯免疫反應(yīng)(圖7)。代謝組學(xué)分享,以上結(jié)果表明GPX4抑制劑與ICB聯(lián)合療法治療LAR亞型腫瘤是一種理想的治療策略,臨床免疫治療及小鼠細(xì)胞系免疫治療隊(duì)列研究也證實(shí)這一結(jié)果。
 


圖7. GPX4抑制劑與ICB聯(lián)用療法對(duì)LAR亞型腫瘤有顯著治療效果


結(jié)論
本研究通過多組學(xué)數(shù)據(jù)集分析和體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證系統(tǒng)地揭示了TNBC“復(fù)旦分型”各亞型具有鐵死亡異質(zhì)性,其中LAR亞型腫瘤細(xì)胞ROS積累,F(xiàn)A代謝富集,脂氧合酶過度表達(dá),并操縱GSH代謝防止鐵死亡的發(fā)生。代謝組學(xué)分享,且LAR亞型腫瘤對(duì)鐵死亡抑制劑、尤其是GPX4抑制劑敏感,是鐵死亡治療最為敏感的亞型;谶@些特征,靶向鐵死亡抑制劑與免疫檢查點(diǎn)阻斷相結(jié)合的療法,為L(zhǎng)AR亞型腫瘤提供了精準(zhǔn)治療新方向,為三陰性乳腺癌患者帶來新希望。

來源:上海百趣生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
聯(lián)系電話:021-61531195
E-mail:chengyichun@biotree.cn

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