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點突變細(xì)胞模型的構(gòu)建的方法與注意事項

瀏覽次數(shù):642 發(fā)布日期:2023-3-23  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

全球有超過50,000種人類相關(guān)的遺傳疾病,其中大部分是由基因組的點突變(point mutation, PM)引起的。而對于罕見病而言,80%是由基因缺陷引起的,同時這些基因缺陷中點突變又占了60%。研究表明,點突變能使人類對癌癥、聽力疾病、精神病等多種疾病的易感性增加。

研究點突變相關(guān)遺傳疾病,免不了要構(gòu)建細(xì)胞模型。點突變細(xì)胞模型可以直接研究細(xì)胞信號傳導(dǎo)、代謝和分化等機制,是研究基因功能和調(diào)控、癌癥、遺傳疾病等生物學(xué)和醫(yī)學(xué)問題的重要工具,具有精確模擬基因變異、可控性高、安全省時等優(yōu)點。
 

點突變細(xì)胞模型的構(gòu)建

構(gòu)建細(xì)胞點突變細(xì)胞模型時的理論基礎(chǔ)是基因的同源重組修復(fù)。當(dāng)細(xì)胞基因組DNA雙鏈由于外部因素而斷裂時,細(xì)胞中存在著的DNA修復(fù)機制就會被激發(fā),對斷裂位點的DNA雙鏈進(jìn)行修復(fù),根據(jù)修復(fù)方式的不同可分為同源重組修復(fù)和非同源重組修復(fù)。顧名思義,同源重組是指DNA在修復(fù)的過程中以同源的DNA序列作為模板完美修復(fù),而非同源重組修復(fù)是指細(xì)胞內(nèi)的相關(guān)蛋白直接將斷裂的DNA兩端重新連起來,同時可能會隨機引入新的堿基。
 

罕見病基因治療峰會
DNA雙鏈斷裂修復(fù)途徑。(A. 同源重組修復(fù),B. 非同源重組修復(fù))


根據(jù)這個理論基礎(chǔ),點突變細(xì)胞模型的構(gòu)建分為三個部分:

1.定點切割DNA
由于在自然界中DNA的斷裂是隨機的、不確定的,因此我們需要人為定點對DNA產(chǎn)生切割。在這個過程中,CRISPR-Cas9技術(shù)給我們提供了極大的便利。我們可以通過人為設(shè)計sgRNA,并將Cas9蛋白與sgRNA一起轉(zhuǎn)染到目的細(xì)胞中。在sgRNA的引導(dǎo)下,Cas9蛋白對靶位點處的DNA進(jìn)行切割,產(chǎn)生DNA雙鏈斷裂。

2.同源重組修復(fù)DNA
我們通過CRISPR-Cas9技術(shù)使細(xì)胞內(nèi)的基因組DNA產(chǎn)生了雙鏈斷裂后,同時引發(fā)了細(xì)胞內(nèi)的DNA修復(fù)機制。因此,為了使DNA在修復(fù)過程中能通過同源重組的方式修復(fù)DNA并引入突變位點,我們需要為細(xì)胞提供額外的同源修復(fù)模板。這個模板的本質(zhì)是人為合成的DNA序列,由5’端同源臂、突變位點和3’端同源臂組成。值得注意的是,這種同源模板序列是隨sgRNA和Cas9蛋白一起轉(zhuǎn)染進(jìn)細(xì)胞的。

3.陽性細(xì)胞篩選
這部分是細(xì)胞模型構(gòu)建的關(guān)鍵部分。試想下,我們通過細(xì)胞轉(zhuǎn)染技術(shù)將CRISPR-Cas9系統(tǒng)和模板DNA序列轉(zhuǎn)入細(xì)胞中后,由于細(xì)胞內(nèi)部機制的作用,我們得到的細(xì)胞池中既包含純合子陽性細(xì)胞和雜合子細(xì)胞,又包含沒有發(fā)生堿基突變的野生型細(xì)胞。那么,我們該如何挑選出目的細(xì)胞呢?對于點突變模型來說,由于沒有引入抗性基因,常用的方法便是通過稀釋法將細(xì)胞池的細(xì)胞稀釋轉(zhuǎn)移到96孔板中,形成單克隆細(xì)胞,然后收集單克隆細(xì)胞進(jìn)行大量測序,以得到預(yù)期的純合子細(xì)胞。
 

點突變細(xì)胞模型推薦

由于人類疾病中基因產(chǎn)物并非總是如轉(zhuǎn)基因一樣的高表達(dá),也不是像基因敲除一樣完全不表達(dá),很多情況下只是因單個或者少數(shù)幾個堿基的改變而造成的蛋白結(jié)構(gòu)改變,表現(xiàn)為非正常激活或抑制。因此,構(gòu)建精細(xì)的、與疾病對應(yīng)的點突變細(xì)胞模型便成為了疾病臨床前研究的最佳方案,而CRISPR-Cas9技術(shù)則使得我們能夠以更低的成本和更高的效率實現(xiàn)這一目標(biāo)。

經(jīng)大量測試和實驗工藝優(yōu)化,賽業(yè)生物開發(fā)了Smart-CRISPR™細(xì)胞基因編輯系統(tǒng),實現(xiàn)更深度的基因信息分析和更合理的gRNA設(shè)計。基于該系統(tǒng),我們能提供準(zhǔn)確快速的點突變細(xì)胞模型構(gòu)建服務(wù),通過優(yōu)化的α-donor體系將人源化的Cas9蛋白、gRNA和donor三組分轉(zhuǎn)染至目的細(xì)胞,產(chǎn)生高效同源重組,實現(xiàn)純合子交付,快至八周。現(xiàn)在下單,HEK293T、A549、HCT 116、HEK293等多種細(xì)胞的點突變項目均可享受3.98萬的優(yōu)惠價格。

 

基因編輯細(xì)胞系實用指南

基因敲除的sgRNA要如何設(shè)計?又要如何檢測脫靶?為什么篩選出了很多單克隆雜合子,但無法篩選出純合子?對于這些問題,做基因編輯細(xì)胞系的小伙伴們應(yīng)該不會感到陌生。這本基因編輯細(xì)胞系常見問題解答將為你答疑解惑,掃碼免費下載領(lǐng)取電子版,距你理想的研究目標(biāo)又近了億點點!

來源:賽業(yè)(蘇州)生物科技有限公司
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