如何降低血清蛋白分離的成本
瀏覽次數(shù):999 發(fā)布日期:2023-3-10
來(lái)源:賽多利斯
患者樣本中存在的一些生物分子能夠?yàn)榧膊≡\斷提供關(guān)鍵的檢測(cè)指標(biāo),例如疾病代謝物和蛋白質(zhì)標(biāo)記物,F(xiàn)有的分離方法通常采用沉淀法,費(fèi)時(shí)昂貴且要條件優(yōu)化。本文中,我們通過(guò)使用 NMR 和 Off-Gel 方法來(lái)進(jìn)行評(píng)估,展示了如何通過(guò)超濾快速、精確、高效地分離血清中生物分子。
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下載本篇《Vivaspin® Turbo 4 PES: 一種分離疾病代謝物和蛋白質(zhì)的經(jīng)濟(jì)方法》應(yīng)用說(shuō)明,了解超濾系統(tǒng)如何在經(jīng)濟(jì)效益,具有同樣的有效性質(zhì),簡(jiǎn)單易操作的前提下完成該過(guò)程。
目前,人們普遍采用多重親和去除系統(tǒng)(Multiple Affinity Removal System, MARS)從人血清、血漿和其他生物液體中分離高豐度蛋白質(zhì)(白蛋白、IgG、抗胰蛋白酶、IgA、轉(zhuǎn)鐵蛋白和結(jié)合珠蛋白)。去除這些高豐度蛋白質(zhì)可以有效地?cái)U(kuò)大動(dòng)態(tài)范圍,從而改善血清樣本的LC/MS和電泳結(jié)果。但是,使用該系統(tǒng)會(huì)給用戶帶來(lái)高昂的成本(4×w.r.t.超濾)。
我們通過(guò)超濾的方式,以蛋白質(zhì)的大小和結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ),在驅(qū)動(dòng)力(通常由離心或壓力條件產(chǎn)生)下將樣品通過(guò)膜分離。
具體步驟如下
1 濃縮管制備
用 0.1NHCl沖洗Vivaspin® Turbo 4,重復(fù)沖洗 3 到 4 次。
2 樣品采集、超濾和分析
- 從患者身上抽取血樣并提取血清
- 使用 Vivaspin® Turbo 4,50kda MWCO PES(4000g,7min)高豐度血清蛋白
- 使用 Vivaspin® Turbo 4,3kDa MWCO PES 濃縮濾液(4000g,7min)
- 濃縮物的Off-Gel進(jìn)行區(qū)帶分離分離(蛋白質(zhì)>3kDa)
- 超濾透過(guò)液的核磁共振(代謝產(chǎn)物<3kDa)
以上步驟即可實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)從代謝物中分離,但是需要注意的是用去離子水進(jìn)行預(yù)沖洗無(wú)法有效去除干擾物,因此在核磁共振圖譜中觀察到雜質(zhì)峰(圖1)。因此使用0.1NHCl溶液進(jìn)行預(yù)沖洗(一個(gè)濃縮管的預(yù)沖洗量為12 ~ 14 mL,是Vivaspin® Turbo 4PES的 3 ~ 4 倍)。
圖1. 核磁共振圖譜
結(jié)論
通過(guò)Off-Gel分離對(duì)濃縮物進(jìn)行分析(圖2),含有小代謝物的濾液則通過(guò)核磁共振進(jìn)行分析(圖3)。因此超濾方式是簡(jiǎn)單高效的,對(duì)一個(gè)樣本的分析成本估計(jì)會(huì)是MARS的四分之一。
(左)圖2. 對(duì)健康個(gè)體(頂部)和患病個(gè)體(底部)的 血清中蛋白質(zhì)進(jìn)行的Off-Gel分離分析
(右)圖3. 對(duì)健康個(gè)體(頂部)和患病個(gè)體(底部)血清中代謝物進(jìn)行的核磁共振分析
客戶感言
基于超濾的蛋白質(zhì)分離法是一種非常有用的方法,無(wú)需任何化學(xué)處理即可獲得所需的蛋白質(zhì)。它耗時(shí)很少,經(jīng)濟(jì)耐用。獲得的結(jié)果也可重現(xiàn)?蓪⑵溆糜诎邢蚧蚍前邢虻姆椒,從而去除所需的蛋白質(zhì)和小分子量分子。與使用MARS系統(tǒng)的步驟相比,該方法節(jié)省了很多成本。我感謝賽多利斯團(tuán)隊(duì)在正確的時(shí)間為我的應(yīng)用提供了超濾濃縮管,從而幫助我提高了效率。
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