圖 1. 腫瘤類器官概括了患者特異性腫瘤異質(zhì)性的典型特征[1]
圖 2. 2D 細(xì)胞模型、PDXs、患者來源的腫瘤類器官 (PDOs) 的比較[2]
2D 細(xì)胞:因易于增殖、維護(hù)成本低、易于進(jìn)行功能測(cè)試而被廣泛使用。但從根本上說,它們不能準(zhǔn)確的代表體內(nèi)腫瘤。其主要限制在于無法準(zhǔn)確復(fù)制體內(nèi)癌細(xì)胞的表型和遺傳學(xué)特征。更重要的是,它們無法準(zhǔn)確概括癌癥的復(fù)雜性和動(dòng)態(tài)性,尤其是耐藥機(jī)制 (這仍然是癌癥患者治愈的主要限制因素)。
患者來源的異種移植 (PDXs):能夠概括人類腫瘤的生物學(xué)特征,但使用起來耗時(shí)且昂貴,此外,PDX 還表現(xiàn)出小鼠特異性腫瘤進(jìn)化的能力,并且引發(fā)了關(guān)于使用動(dòng)物模型進(jìn)行實(shí)驗(yàn)的各種倫理問題。PDX 不適合高通量藥物篩選 (HTS),主要用于實(shí)驗(yàn)室研究。
腫瘤類器官:與 PDX 相比,腫瘤類器官成本更低、并具有較高效率,能夠模擬正常組織及不同階段的癌變過程的組織,既反映了真實(shí)世界患者癌癥的生理特征,又能應(yīng)用高通量藥物篩選。此外,體外基因修飾比體內(nèi)更容易: 例如通過 CRISPR/Cas9 技術(shù)對(duì)腫瘤抑制因子 Trp53 和 Stag2 進(jìn)行基因敲除的基因操作類器官。
類器官與腫瘤微環(huán)境:最初,腫瘤類器官因無法再現(xiàn) TME 使腫瘤類器官被打上“不完美”標(biāo)簽,但隨著類器官技術(shù)的發(fā)展,腫瘤類器官再度升級(jí):將類器官植入高度血管化的組織或者通過基因編輯或結(jié)合混合細(xì)胞共培養(yǎng) (使用微流體平臺(tái)) 來實(shí)現(xiàn)腫瘤血管化建模。通過腫瘤類器官細(xì)胞和免疫細(xì)胞的共培養(yǎng)實(shí)現(xiàn)腫瘤-免疫相互作用的建模,可以更好地模擬腫瘤中的免疫系統(tǒng)功能。
已經(jīng)有很多不同癌癥患者來源的樣本建立的類器官模型,如結(jié)腸、食管、胃、大腦、前列腺、胰腺、肝臟、乳腺癌等類器官。
圖 3. PDOs 建立的主要步驟和主要應(yīng)用[1]
(A) 包含癌細(xì)胞、成體干細(xì)胞、多能干細(xì)胞或腫瘤干細(xì)胞的人類癌癥組織,首先通過機(jī)械和化學(xué)方法分解成非常小的碎片、細(xì)胞簇或單細(xì)胞,并在適當(dāng)?shù)?3D 條件下在具有 ECM 成分的水凝膠中培養(yǎng)。(B) 腫瘤類器官能模仿原發(fā)組織組織病理學(xué)特征、遺傳圖譜、突變情況,甚至對(duì)治療的反應(yīng),并且可以建立腫瘤類器官生物庫。
PDOs 可用于研究耐藥性、代謝、分化和癌癥基因功能,近年來,多種不同組織的 PDOs 模型已經(jīng)被用于藥物發(fā)現(xiàn)探索候選治療藥物的細(xì)胞毒性和實(shí)現(xiàn)個(gè)性化的癌癥治療,Zilong Zhou 等人總結(jié)類器官培養(yǎng)平臺(tái)在藥物篩選中的應(yīng)用,見表 1。
此外,類器官用于癌癥藥篩的臨床相關(guān)性和預(yù)測(cè)有效性在多篇研究中都已經(jīng)得到了較為充分的證實(shí),并且基于 PDOs 模型的臨床試驗(yàn)集中在發(fā)病率和死亡率較高的腫瘤,如結(jié)直腸癌、肺癌、膠質(zhì)瘤、乳腺癌、肝癌和胰腺癌。Vlachogiannis G 團(tuán)隊(duì)在 Science 發(fā)表了 PDOs 模型對(duì)轉(zhuǎn)移性胃腸癌的藥敏測(cè)試結(jié)果,他們從 71 例晚期結(jié)直腸癌患者中提取出癌細(xì)胞樣本建立 PDOs,測(cè)試了 55 種抗癌藥物,研究結(jié)果顯示,這些 PDOs 在預(yù)測(cè)患者對(duì)靶向藥物或化療的反應(yīng)方面達(dá)到 100% 的敏感性,93% 的特異性,88% 的陽性預(yù)測(cè)率和 100% 的陰性預(yù)測(cè)率,展現(xiàn)了極高的臨床相關(guān)性。
類器官培養(yǎng)基中需要一些生長因子和抑制劑,培養(yǎng)基中生長因子和抑制劑的不同組合有助于在類器官中產(chǎn)生不同的成分譜系。
表 2. 常見腫瘤類器官培養(yǎng)系統(tǒng)
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參考文獻(xiàn)
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7. Georgios Vlachogiannis, Nicola Valeri, et al. Patient-derived organoids model treatment response of metastatic gastrointestinal cancers. Science. 2018 Feb 23;359(6378):920-926.