文獻解讀:高性能基因編碼的乳酸探針的開發(fā)與應用
瀏覽次數(shù):1445 發(fā)布日期:2022-11-17
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文獻精讀第40期
乳酸最初被認為是糖酵解產(chǎn)生的無用產(chǎn)物,然而現(xiàn)有的研究表明,乳酸不僅是一種代謝燃料,同時也是一種重要的信號分子。乳酸參與了組蛋白修飾、缺氧反應、自噬、神經(jīng)活動、胚胎發(fā)育、衰老、免疫和癌癥代謝等多種生理和病理過程,在機體代謝過程中發(fā)揮了重要作用。在體內(nèi),乳酸在不同亞細胞間室、細胞種類、組織和體液中呈現(xiàn)動態(tài)空間分布。因此,在體動態(tài)監(jiān)測乳酸的分布和變化情況,對于探討乳酸代謝的生物學意義至關(guān)重要。
2022年10月28日,華東理工大學藥學院趙玉政教授、楊弋教授聯(lián)合上海市第四人民醫(yī)院王從容教授在國際權(quán)威學術(shù)期刊Cell Metabolism發(fā)表題為“Ultrasensitive sensors reveal the spatiotemporal landscape of lactate metabolism inphysiology and disease”的論文,該文章展示了團隊在乳酸監(jiān)測成像領(lǐng)域的最/新研究成果。為了在體監(jiān)測乳酸的時空動態(tài)變化,研究團隊開發(fā)出一系列超靈敏、高響應、基因編碼的乳酸熒光探針(命名為FiLa)。FiLa能夠?qū)罴毎、亞細胞以及小鼠體內(nèi)的乳酸代謝進行實時動態(tài)追蹤。此外,F(xiàn)iLa還能夠?qū)θ说难搴湍蛞簶颖局械娜樗崴竭M行快速分析。這些證據(jù)提示,F(xiàn)iLa在乳酸的實時動態(tài)監(jiān)測和定量分析中的卓越性能,將為乳酸代謝相關(guān)的基礎(chǔ)和臨床研究提供極大助力。
目前,研究人員主要依靠酶循環(huán)測定法、色譜法或質(zhì)譜法等手段來測定細胞外或細胞裂解液中的乳酸。然而,這些方法不僅耗時、成本高,而且也難以確定乳酸的時空動力學特征。利用基因編碼的熒光探針可以很好的解決上述問題,但是現(xiàn)有的乳酸熒光探針存在諸多問題。比如,這些探針在體外和/或活細胞中具有相當小的動態(tài)范圍、對鈣的反應不理想、或者具有不適當?shù)挠H和力,這些限制使得它們難以量化體外和體內(nèi)乳酸的細微波動。
在該研究中,作者開發(fā)了一系列基于“環(huán)化重排熒光蛋白”(circularly permuted fluorescent protein, cpFP)的超靈敏、高響應性的基因編碼的乳酸熒光探針FiLa。FiLa家族在體外顯示出1500-2700%的熒光反應,其靈敏度為目前所有乳酸探針中最高。并且FiLa對乳酸的選擇性高于其他相關(guān)代謝物,受到鈣的干擾小。此外,F(xiàn)iLa對乳酸有適當?shù)挠H和力,在活細胞研究中,其解離常數(shù)為130mM,并且具有1000%的動態(tài)范圍,涵蓋了大多數(shù)乳酸的生理或病理濃度。值得注意的是,F(xiàn)iLa傳感器本質(zhì)上是比率傳感器,具有能夠定量、較少受成像偽影或探針表達程度影響的優(yōu)點,因此,F(xiàn)iLa滿足了接近理想分子探針的大部分要求。
圖1.高性能的基因編碼的乳酸熒光探針FiLa
隨后,作者展示了FiLa在研究中的應用潛力。在活細胞中,利用FiLa,作者意外地發(fā)現(xiàn)乳酸在線粒體中高度富集。線粒體是否擁有乳酸庫和線粒體乳酸代謝一直是一個存在爭議的問題,因為沒有令人信服的證據(jù)能夠可靠地確定乳酸在活細胞中的原位分布。FiLa提供了首/個視覺證據(jù),證實了乳酸在不同細胞的線粒體中高度富集。并且,作者利用FiLa進一步繪制了亞細胞的乳酸圖譜,亞細胞乳酸對各種代謝途徑的干擾反應良好,這意味著亞細胞乳酸和細胞信號通路緊密交織,表明乳酸是感知各種代謝活動的關(guān)鍵樞紐。
圖2.利用FiLa觀察到乳酸在哺乳動物線粒體中高度富集
此外,為了進一步驗證FiLa應用能力,作者將FiLa應用到活體小鼠以及臨床樣本的乳酸檢測中。乳酸與糖尿病的發(fā)生密切相關(guān),為此作者利用FiLa對糖尿病小鼠的乳酸水平進行了監(jiān)測。結(jié)果證實,F(xiàn)iLa可以直接成像監(jiān)測糖尿病小鼠體內(nèi)乳酸水平的升高,表明FiLa是實時追蹤體內(nèi)乳酸代謝細微波動的有力工具。最后,作者還建立了基于FiLa探針的高通量臨床樣本即時檢測技術(shù),對不同類型糖尿病患者血液和尿液中的乳酸水平進行了測定,發(fā)現(xiàn)母系遺傳性糖尿病伴耳聾(MIDD)患者尿液中乳酸水平升高,這一指征或可作為該疾病的潛在篩選標志物,為臨床診斷提供依據(jù)。
圖3.利用FiLa對糖尿病小鼠體內(nèi)乳酸水平成像
總體而言,這項工作提供了一個用于乳酸檢測的高效工具,文章所展示的高性能基因編碼的乳酸熒光探針,解決了以往探針靈敏度低、受干擾嚴重以及親和力不恰當?shù)戎T多問題。該探針能夠廣泛應用于體內(nèi)外的乳酸代謝監(jiān)測,這將為未來乳酸代謝相關(guān)的分子信號研究和疾病機制探討提供強有力的工具。
論文原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.cmet.2022.10.002