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單細(xì)胞核和單細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合生信文章，趕快GET

單細(xì)胞研究中難免會(huì)遇到這樣的問題：有些細(xì)胞不適合制備單細(xì)胞懸液，如肝實(shí)質(zhì)細(xì)胞、成年神經(jīng)細(xì)胞、脂肪細(xì)胞等，也有一些細(xì)胞類型不適合提核檢測(cè)，尤其是免疫細(xì)胞，那可不可以將兩者聯(lián)合起來更全面的解析組織異質(zhì)性呢？這篇文章就是整合了肝臟單核細(xì)胞（snRNA-seq）、單細(xì)胞（scRNA-seq）和bulk RNA-seq數(shù)據(jù)來探究肝細(xì)胞癌的細(xì)胞類型差異，首先從單細(xì)胞水平解析肝臟細(xì)胞的類型，發(fā)現(xiàn)增殖性Prol細(xì)胞在腫瘤細(xì)胞中顯著富集，然后在TCGA和LCI的數(shù)據(jù)解卷積，發(fā)現(xiàn)8種細(xì)胞類型只有Prol顯著增加，為了確定該細(xì)胞類型對(duì)生存預(yù)后的臨床意義，通過COX回歸發(fā)現(xiàn)高Prol細(xì)胞類型占比與較差的生存結(jié)果相關(guān)，最后，作者還發(fā)現(xiàn)腫瘤抑制基因TP53和RB1的體細(xì)胞突變與肝細(xì)胞癌中Prol細(xì)胞類型的增加有關(guān)。為深入了解肝細(xì)胞癌相互依賴的生物學(xué)機(jī)制提供依據(jù)。

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軍事醫(yī)學(xué)研究院王常勇課題組與清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院那潔課題組繪制人多譜系心臟類器官單細(xì)胞圖譜

類器官培養(yǎng)結(jié)合組織工程給器官移植帶來了希望，但對(duì)不同類型細(xì)胞在形成類器官過程中如何相互作用以及它們的狀態(tài)和命運(yùn)變化所知甚少，限制了心臟類器官在再生醫(yī)學(xué)和藥物研發(fā)中的應(yīng)用。該研究從單細(xì)胞水平揭示了多譜系細(xì)胞形成心臟類器官過程中的細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)變及潛在的基因調(diào)控機(jī)制，通過比較單層分化的2D-CM、僅由CM構(gòu)成的MCO-CM和由CM、EC、SMC構(gòu)成的MCO-Mix，發(fā)現(xiàn)3D微環(huán)境能促進(jìn)心肌成熟，多種類型細(xì)胞混合互作后能產(chǎn)生新的細(xì)胞類型——DLK1+成纖維細(xì)胞，并在心肌梗死的大鼠心臟中有效逆轉(zhuǎn)病理重塑和改善心臟功能，具備潛在的免疫調(diào)控和組織修復(fù)功能。這些發(fā)現(xiàn)為進(jìn)一步優(yōu)化hiPSC衍生的心臟類器官構(gòu)建和心臟修復(fù)提供了新的線索。

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PD患者的福音：新型分子標(biāo)記物實(shí)現(xiàn)可預(yù)測(cè)的帕金森病細(xì)胞治療結(jié)果

中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心（神經(jīng)科學(xué)研究所）、靈長類神經(jīng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、上海腦科學(xué)與類腦研究中心陳躍軍研究組在期刊The Journal of Clinical Investigation上發(fā)表了研究成果，課題組通過重建人中腦多巴胺能神經(jīng)細(xì)胞的分化軌跡，發(fā)現(xiàn)了代表早期或晚期多巴胺能神經(jīng)祖細(xì)胞的特異性表面蛋白分子，CLSTN2和PTPRO，同時(shí)研究者建立了一種獲得高度純化的供體細(xì)胞的方法，分選該特征的神經(jīng)祖細(xì)胞進(jìn)行移植，可產(chǎn)生高度富集的中腦多巴胺能神經(jīng)元，比例可高達(dá)80%，其中大部分（約90%）的多巴胺能神經(jīng)元為黑質(zhì)中腦多巴胺能神經(jīng)元亞型——PD患者腦內(nèi)主要缺失的多巴胺能神經(jīng)元亞型，并且分選的細(xì)胞具備高治療效力。這一研究為實(shí)現(xiàn)更有效更安全的帕金森病細(xì)胞替代療法邁出了重要的一步。

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單核轉(zhuǎn)錄組助力發(fā)現(xiàn)感染引起的發(fā)熱機(jī)制

發(fā)燒時(shí)人體為什么會(huì)發(fā)冷和沒食欲？到底是誰引起的呢？這篇文章有答案，該研究者通過對(duì)細(xì)菌和病毒感染小鼠模型進(jìn)行研究，發(fā)現(xiàn)下丘腦腹側(cè)內(nèi)側(cè)視前區(qū)VMPO中存在VMPOLPS神經(jīng)元群體，在脂多糖或聚肌胞的誘導(dǎo)下激活，然后作者們通過單細(xì)胞核RNA測(cè)序?qū)�這些神經(jīng)元以及局部非神經(jīng)元群體進(jìn)行了詳細(xì)地刻畫及深入分析，發(fā)現(xiàn)炎癥相關(guān)的分子可以調(diào)控VMPOLPS神經(jīng)元的激活，因此推測(cè)感染引起的炎癥信號(hào)可能以小膠質(zhì)為中間體進(jìn)行了放大，進(jìn)而激活VMPOLPS神經(jīng)元，導(dǎo)致機(jī)體出現(xiàn)發(fā)熱，也通過動(dòng)物實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步揭示了VMPOLPS神經(jīng)元作為控制樞紐，集成免疫信號(hào)、協(xié)調(diào)多種疾病癥狀以應(yīng)對(duì)感染的生理基礎(chǔ)。

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Science綜述：三級(jí)淋巴結(jié)構(gòu)在腫瘤進(jìn)展中“是敵是友”？

三級(jí)淋巴結(jié)構(gòu)（TLSs）是非淋巴組織中形成的免疫細(xì)胞的有組織聚集體，在不同生理及病理?xiàng)l件下均可能出現(xiàn)，其結(jié)構(gòu)一般為被CD3+T細(xì)胞包圍的CD20+B細(xì)胞，類似于次級(jí)淋巴器官，腫瘤中的TLS與免疫治療的預(yù)后和臨床結(jié)局密切相關(guān)，這篇綜述詳細(xì)討論了目前對(duì)于TLSs在癌癥中作用的了解，具體包括：1）TLSs形成的驅(qū)動(dòng)因素；2）TLSs對(duì)抗腫瘤免疫反應(yīng)的功能和貢獻(xiàn)，以及3）TLSs在人類癌癥中作為治療靶點(diǎn)的潛力。更詳細(xì)地了解TLS功能及其在自身免疫毒性中的潛在作用將有助于了解其作為治療靶點(diǎn)的價(jià)值。

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