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單細(xì)胞測(cè)序運(yùn)用實(shí)踐—細(xì)胞懸液制備經(jīng)驗(yàn)分享

瀏覽次數(shù):1872 發(fā)布日期:2022-4-21  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

單細(xì)胞檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展將生命科學(xué)研究推向了一個(gè)全新的維度;趩渭(xì)胞技術(shù),我們對(duì)生命體的理解,對(duì)疾病組織的了解上升到了最基本的單元—細(xì)胞。通過對(duì)組織中的各類細(xì)胞的基因特征檢測(cè)與分析,增進(jìn)了我們對(duì)細(xì)胞的本身特性及細(xì)胞與細(xì)胞之間互作關(guān)系的理解。正是基于單細(xì)胞檢測(cè)技術(shù)在各類疾病中的研究運(yùn)用,使得我們對(duì)疾病的發(fā)生發(fā)展和抗藥等的了解更加深入,更加明確,也更能找到最核心、影響最大的某類細(xì)胞和基因?梢哉f,正是單細(xì)胞檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展和運(yùn)用,極大地加速了科學(xué)研究往臨床的轉(zhuǎn)化和運(yùn)用。

單細(xì)胞技術(shù)用于腫瘤研究。

引自:Cancer Cell. 2020 Apr 13;37(4):456-470.

雖然我們進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序的研究目的不盡相同,但絕大多數(shù)研究是以組織樣本作為研究材料。目前單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)首先要將組織解離為單細(xì)胞懸液,再上機(jī)進(jìn)行油包水、建庫、測(cè)序、數(shù)據(jù)分析。而我們知道生命體是相當(dāng)復(fù)雜的,以人體為例,人體是由四大組織系統(tǒng)組成的,包括上皮組織、結(jié)締組織、肌肉組織、神經(jīng)組織。不同組織的細(xì)胞構(gòu)成、細(xì)胞特性、細(xì)胞間質(zhì)組成可能有很大的差異。比如,上皮組織由密集的上皮細(xì)胞和少量細(xì)胞間質(zhì)構(gòu)成。結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是細(xì)胞結(jié)合緊密,細(xì)胞間質(zhì)少;結(jié)締組織由細(xì)胞和大量細(xì)胞間質(zhì)構(gòu)成,細(xì)胞間質(zhì)包括基質(zhì)、細(xì)絲狀的纖維和不斷循環(huán)更新的組織液,細(xì)胞散居于細(xì)胞間質(zhì)內(nèi);肌細(xì)胞間有少量結(jié)締組織,并有毛細(xì)血管和神經(jīng)纖維等;神經(jīng)組織是神經(jīng)系統(tǒng)的主要組成成分,由神經(jīng)細(xì)胞和神經(jīng)膠質(zhì)組成,神經(jīng)細(xì)胞會(huì)有很長(zhǎng)的突起。

人體組織分類圖

這些組織差異使得單細(xì)胞懸液制備沒有統(tǒng)一的protocol,而單細(xì)胞測(cè)序?qū)渭?xì)胞懸液質(zhì)量要求也比較高。因此需要根據(jù)組織類型,甚至是相同組織的不同疾病狀態(tài)等摸索特定的實(shí)驗(yàn)條件,比如組織剪碎方式、酶種類和濃度選擇、酶解時(shí)間選擇、酶解條件選擇等等。

上海生物芯片深耕科研服務(wù)20年,也緊隨單細(xì)胞檢測(cè)技術(shù)的推廣為廣大科研工作者提供優(yōu)質(zhì)的單細(xì)胞檢測(cè)服務(wù)。經(jīng)過多年的摸索與實(shí)踐,我們已對(duì)包括人、大鼠、小鼠等在內(nèi)的各類組織成功進(jìn)行單細(xì)胞制備實(shí)驗(yàn),為單細(xì)胞后續(xù)實(shí)驗(yàn)的成功開展打下了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。包括人,大、小鼠及其他模式生物。

--部分單細(xì)胞懸液制備結(jié)果--

 

人-膽管癌

 

人-胃癌

 

人-肝癌


人-腸息肉

--部分人,大、小鼠制備消化經(jīng)驗(yàn)一覽--

成功率非常高

人-癌癥腦轉(zhuǎn)移

人-結(jié)腸息肉

人-牙乳頭

人-賁門癌

人-口腔鱗癌

人-牙周/牙周膜

人-鼻腔腫瘤

人-卵泡液

人-胰島

人-鼻上皮

人-腦部淋巴瘤/癌旁

人-粘液腺瘤

人-鼻息肉

人-尿路上皮癌/癌旁

人-直腸癌

人-鼻咽癌

人-膀胱

人-腫瘤異種移植物(PDX)

人-扁桃體

人-培養(yǎng)原代細(xì)胞

人-子宮內(nèi)膜間質(zhì)肉瘤

人-腸道

人-前列腺癌/癌旁

人-PBMC

人-腸息肉

人-乳腺癌轉(zhuǎn)移/腋窩淋巴

人-乳腺癌穿刺

人-腸粘膜

人-軟骨肉瘤

人-骨髓

人-肺癌穿刺/氣管鏡

人-軟組織肉瘤

人-卵巢

人-肝外膽管癌

人-腎癌穿刺

人-食管癌

人-肝臟腫瘤

人-腎上腺

人-腦組織

人-甲狀腺癌

人-腎臟

人-腸癌

人-結(jié)腸癌

人-胃癌穿刺

人-肌肉

人-結(jié)腸癌腹腔轉(zhuǎn)移

人-胃癌骨轉(zhuǎn)移

人-子宮內(nèi)膜

成功率較高

人-腦髓母細(xì)胞瘤

人-黑色素瘤

人-淋巴癌/癌旁

人-舌

人-腦膠質(zhì)瘤

人-膀胱癌

人-子宮肌瘤

人-腎癌

人-組織

人-腹水

人-心臟

人-腦血管

人-腸癌腹膜轉(zhuǎn)移/癌旁

人-聽神經(jīng)瘤

人-半月板

人-肝癌穿刺樣本

人-心臟

人-膽管囊腫

人-分選白細(xì)胞

人-淋巴結(jié)

人-息肉

人-肝母細(xì)胞瘤

人-肝癌

人-椎間盤

成功率高

人-甲狀腺

人-肺動(dòng)脈

人-胃炎

人-乳腺癌

人-關(guān)節(jié)膜

人-眼部

人-膽管癌

人-軟骨

人-子宮骶韌帶腫瘤

人-滑膜

人-脂肪

人-子宮蛻膜

人-膝關(guān)節(jié)滑膜

人-食管

人-肝內(nèi)膽管癌

人-胎盤

人-牙齦

人-唾液腺

人-肺癌

人-腎

人-肺癌腦轉(zhuǎn)移

人-肺

人-淋巴癌

人-肺泡灌洗液

人-結(jié)腸

人-甲狀旁腺

人-動(dòng)脈內(nèi)膜

人-胃癌

人-肝臟

人-骨膜

人-脊柱關(guān)節(jié)突

人-腸韌帶

人-肌腱

人-腦動(dòng)靜脈

人-骨肉瘤

人-胸腺

人-縱膈

人-腦動(dòng)脈血管瘤

人-血管

人-前列腺

人-腎臟腫瘤

人-皮膚

人-腎臟穿刺

人-視網(wǎng)膜

人-類器官

有一定挑戰(zhàn)性

人-主動(dòng)脈

人-宮頸癌/癌旁

人-淚腺

人-頰部

人-口腔癌

人-牙根尖周

人-后腹膜

人-胃

人-陰道壁

人-舌癌

人-腦脊液

人-胰腺

人-動(dòng)脈

人-疤痕

 

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人-胰腺癌肝轉(zhuǎn)移

人-靜脈/大隱靜脈

 

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成功率非常高

大鼠-大腦皮層

小鼠-宮頸癌

小鼠-胸腺

大鼠-口腔黏膜

小鼠-骨骼肌

小鼠-血管動(dòng)脈瘤

大鼠-皮膚

小鼠-頜骨

小鼠-胰島

大鼠-全血

小鼠-淋巴結(jié)

小鼠-原代培養(yǎng)巨噬細(xì)胞

大鼠-神經(jīng)節(jié)

小鼠-脈絡(luò)膜

胎鼠-腦

大鼠-腎臟

小鼠-腦膜

胎鼠-心臟

大鼠-食管

小鼠-胚胎

小鼠-肺

大鼠-心臟

小鼠-皮下瘤分選淋巴細(xì)胞

大鼠-肺

小鼠-鼻腔

小鼠-脾臟

小鼠-腎臟

小鼠-耳膜基底膜

小鼠-乳腺腫瘤

 

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小鼠-肺纖維化

小鼠-胎盤

 

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成功率較高

小鼠-骨髓

小鼠-組織

大鼠-心肌

小鼠-腦

小鼠-肝臟

小鼠-脛骨/盆骨

大鼠-肝臟

大鼠-胚胎

 

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小鼠-全血

小鼠-卵巢

 

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成功率高

小鼠-子宮

小鼠-主動(dòng)脈瘤

小鼠-胃粘膜

小鼠-視網(wǎng)膜

小鼠-海馬

小鼠-耳蝸

小鼠-心臟

大鼠-胰島

小鼠-胰腺癌/癌旁

小鼠-皮膚

小鼠-腸壁

 

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有一定挑戰(zhàn)性

小鼠-結(jié)腸

大鼠-牙齦

小鼠-造血干細(xì)胞

大鼠-脊髓

小鼠-黑色素瘤

小鼠-血管

小鼠-肌肉

小鼠-回腸

小鼠-腸系膜

小鼠-腫瘤

小鼠-腦皮層

小鼠-膈肌

大鼠-腦

小鼠-椎間盤

 

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大鼠-下丘腦

小鼠-腸道

 

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聯(lián)系電話:400-100-2131
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