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高通量流式技術(shù)應(yīng)用紀(jì)要-Cell新冠免疫研究新進(jìn)展

瀏覽次數(shù):1987 發(fā)布日期:2021-4-29  來源:賽多利斯
2020年11月Cell上發(fā)表了一篇新冠病毒研究文章,題為Compromised Humoral Functional Evolution Tracks with SARS-CoV-2 Mortality,來自麻省總醫(yī)院(MGH)、麻省理工學(xué)院(MIT)和哈佛大學(xué)的Ragon研究所等研究人員,揭示了SARS-CoV-2死亡率相關(guān)的體液免疫應(yīng)答。
 
 
文章指出,對于新冠病毒的疫苗開發(fā),目前仍然缺乏明確的免疫相關(guān)性研究支持。在其他病原體感染中,中和作用能產(chǎn)生保護(hù)作用,但不清楚在更為廣泛的人群中,只靠中和作用是否足以對抗SARS-CoV-2產(chǎn)生保護(hù)作用。因此,為了充分定義保護(hù)性體液免疫,研究人員分析了193名中重度住院患者體液反應(yīng)的早期演變。
  
iQue
在本項(xiàng)研究中,研究人員采用iQue高通量流式細(xì)胞平臺,結(jié)合基于微球的蛋白定量方法,對大批量的患者血漿樣本中的免疫球蛋白(IgG1、IgG3、IgM、IgA1和IgA2)進(jìn)行快速高通量檢測和定量分析。
 
下面小編就帶大家看看這項(xiàng)研究是如何進(jìn)行的。
 
圖1:本文圖解摘要,來自Cell
 
193名住院患者分為三組,在感染出現(xiàn)癥狀后1個月內(nèi)采樣1-8次,共計392份血漿樣本(如圖A所示):
  • 中度感染后痊愈的住院病人,共82例,采集血漿樣本累計122份
  • 重度感染后痊愈的住院病人,共76例,采集血漿樣本累計196份
  • 重度感染死亡的住院病人,共35例,采集血漿樣本累計74份
 
對這193名SARS-CoV-2感染患者的392份血漿樣本進(jìn)行5種免疫球蛋白定量分析。在該檢測中采用的是基于微球的蛋白定量法,結(jié)合iQue高通量流式細(xì)胞技術(shù)實(shí)現(xiàn)快速、高通量檢測和自動定量分析。具體來說,首先將感興趣的目的抗原(S蛋白)與熒光標(biāo)記的微球進(jìn)行共價結(jié)合,然后將偶聯(lián)抗原的微球進(jìn)行清洗和阻斷,之后加入適當(dāng)稀釋的病人血漿樣本,孵育一定時間后清洗,最后加入另一種熒光標(biāo)記的檢測抗體,最后用iQue 高通量流式細(xì)胞儀采集血漿樣本,用Forecyte軟件分析數(shù)據(jù)獲得抗原特異性抗體的每個亞類和同型(IgG1、IgG3、IgA1、IgA2和IgM)的滴度數(shù)據(jù)。
 

圖2:在不同臨床病程中,SARS-CoV-2特異性體液免疫反應(yīng)的每周演變。來自Cell原文。
 
檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn)(如圖B所示):
  • 癥狀出現(xiàn)1周內(nèi),三組患者均觀察到類似的SARS-CoV-2抗原特異性IgM和IgA滴度,嚴(yán)重疾病幸存者的特異性IgA1滴度略高。同樣,IgG3滴度也未觀察到明顯的組間差異。然而,抗S特異性IgG1滴度在中度和重癥患者間有顯著差異,而且重癥死亡病人的IgG1滴度更低。
  • 到第2周時,與中度疾病患者和死亡患者相比,在重癥患者中觀察到幾乎所有S蛋白特異性抗體同型和亞類的滴度顯著升高,所有抗原的滴度也顯著升高。在死亡患者和中度疾病的患者中,S特異性IgG1滴度增高較慢。
  • 到第3周,所有組的IgA和IgM水平幾乎相當(dāng)。然而,與死亡組相比,患有中重度疾病的幸存?zhèn)體在第三周都產(chǎn)生了更高的IgG亞類滴度,這表明在幸存者中IgG免疫力發(fā)展是一致的,而在非幸存者中則是延遲和受損的。
 
因此,盡管非幸存者在早期都產(chǎn)生了有力的IgG抗體和IgM抗體,但其IgG發(fā)展存在潛在的選擇性缺陷,與COVID-19死亡率相關(guān)。
 
事實(shí)上,研究人員不僅分析了針對S蛋白的特異性抗體免疫反應(yīng)變化。作者在補(bǔ)充數(shù)據(jù)中還展示了這些患者血漿中針對RBD、N、S1 trimer、S1、S2蛋白的特異性抗體各種亞型(IgG1、IgG2、IgG3、IgA1、IgM)在出現(xiàn)癥狀后1周、2周和3周以上的動態(tài)發(fā)展變化。
 
圖片
圖3:出現(xiàn)癥狀后每周抗體的演變。來自Cell原文。
 
小編初略一算,392份樣本,6種目的蛋白,5種抗體亞型,每個樣本要獲得30個讀數(shù),共計11,760個數(shù)據(jù)點(diǎn),這么高的通量,無怪乎研究人員選擇iQue——在最快的時間內(nèi),從少量的珍貴樣本中獲得盡可能多的信息,加快新冠研究進(jìn)程!
 
隨后,考慮到IgG類別轉(zhuǎn)化的差異,研究人員還檢測了這種受損的類別轉(zhuǎn)化帶來的功能性結(jié)果,如SARS-CoV-2特異性抗體與低親和力IgG-Fcɣ受體(FcɣRs)和IgA-Fc -α受體(FcαR)結(jié)合的能力(結(jié)果如圖C所示),這對引起抗體效應(yīng)功能至關(guān)重要,以及抗體介導(dǎo)的固有免疫效應(yīng)功能,如抗體依賴的細(xì)胞吞噬(ADCP)、抗體依賴的中性粒細(xì)胞吞噬(ADNP)和抗體依賴的補(bǔ)體沉積(ADCD)效應(yīng)(結(jié)果如圖D所示)。所有流式檢測均在iQue高通量流式細(xì)胞儀上完成。
 
為了進(jìn)一步研究在SARS-CoV-2感染后重癥存活或未存活的個體之間,特異性抗體特性或抗原特異性是否存在差異,研究人員基于上述所有分析指標(biāo)(抗體滴度、與不同IgG受體結(jié)合水平,及抗體介導(dǎo)的各種固有免疫效應(yīng))生成了極坐標(biāo)圖(polar plot)來分析癥狀出現(xiàn)后1、2和3周體液免疫特征的潛在模式。
 

圖4:體液免疫架構(gòu)的每周演變。來自Cell原文。
 
如上圖所示,早在出現(xiàn)癥狀后的第一周,重癥存活患者中即觀察到體液免疫增強(qiáng)。雖然兩組患者的反應(yīng)總體上都有所增強(qiáng),但存活患者的反應(yīng)比未存活患者的上升更為一致和強(qiáng)勁。雖然兩組的IgA、IgM反應(yīng)類似,但總體而言,未存活患者組的IgG3水平、FcR結(jié)合和Fc功能呈現(xiàn)減弱趨勢。這在癥狀出現(xiàn)后第二周后可觀察到,在第三周這種趨勢進(jìn)一步放大,與之前單變量分析中觀察的結(jié)果類似。尤其是,幸存者表現(xiàn)出整體較高的吞噬反應(yīng)。為了闡明不同組間體液免疫應(yīng)答的總體差異,每類特性單變量差異的非參數(shù)組合揭示,與死亡患者相比,重癥幸存患者的FcR結(jié)合水平早在癥狀出現(xiàn)后一周總體顯著增高,F(xiàn)c功能性反應(yīng)在第3周增高。這些數(shù)據(jù)突出了與COVID-19死亡率相關(guān)的體液免疫反應(yīng)缺陷。
 
 
欲了解更多詳情,請點(diǎn)擊文獻(xiàn)原文《Compromised Humoral Functional Evolution Tracks with SARS-CoV-2 Mortality》,小編的分享就到這里啦!
 
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