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基因基本信息
DMD 基因研究概況
杜氏肌營養(yǎng)不良癥(Duchenne muscular dystrophy, DMD)是最常見的單基因遺傳性疾病之一,該疾病發(fā)現(xiàn)于19世紀,也是如今大熱的基因治療領(lǐng)域中最受關(guān)注的疾病之一。這是由于該疾病的致病基因十分明確,有且只有一個,就是dystrophin,中文名既可以是肌營養(yǎng)不良蛋白,又可以叫做抗肌萎縮蛋白。該基因在保證人類正常肌肉結(jié)構(gòu)和功能中是不可或缺的。
DMD基因位于X染色體上,造成的疾病屬于X染色體連鎖疾病。杜氏肌營養(yǎng)不良會引起骨骼肌衰弱,并最終造成心肌衰弱,導(dǎo)致死亡,患者在呼吸機和重度護理的輔助下最多能活到30多歲。部分患者還會出現(xiàn)認知障礙和腸道問題。此外DMD還有一種弱化版的形式,叫做貝克爾肌營養(yǎng)不良癥(Becker muscular dystrophy, BMD),雖然也是DMD基因的突變,但由于突變位點的不同,仍能產(chǎn)生少量具備功能的蛋白。DMD是一個超大基因,長度超過2.2M bp。巨大的長度也導(dǎo)致了該基因潛在發(fā)生突變位點的數(shù)量大大增加。
圖1. DMD蛋白結(jié)構(gòu)和位置。圖中顯示人類的DMD蛋白的基本結(jié)構(gòu)及在細胞膜附近的定位,NT表示氨基末端,CT表示羧基末端,CR表示亮氨酸重復(fù)區(qū)域,豎向橄欖狀區(qū)域表示24個血影蛋白重復(fù)區(qū)域(spectrin-like repeats, SLR),此外還有4個標注為H1-H4的鉸鏈結(jié)構(gòu)。Dystrophy在N端和中間區(qū)域各有一個Actin結(jié)合域,1-3號SLR能與細胞膜結(jié)合;16-17號SLR則可以結(jié)合nNOS;20-23號SLR可以與微管相互作用;H4和CR則能結(jié)合β亞基營養(yǎng)不良聚糖(β-subunit of dystroglycan, βDG);最后的CT則能同時與互養(yǎng)蛋白及小肌營養(yǎng)蛋白結(jié)合。信息來源:10.1242/dmm.018424.
雖然完整的Dystrophy蛋白早就被證明了具有在動物模型中治療DMD的作用,但由于DMD的全長cDNA本身已經(jīng)接近14kb,無法裝載到常用的病毒載體中,從而造成其在臨床上的應(yīng)用非常困難。臨床發(fā)現(xiàn)BMD中截短了的Dystrophy仍然具有大部分全長Dystrophy的功能,這提示了要緩解DMD,可能并非需要執(zhí)著于全長蛋白。因此,6kb片段的mini Dystrophy和3.6kb的micro Dystrophy被相繼開發(fā)出來,用于DMD的治療,雖然功能肯定不及完整的蛋白,但其效果仍然是喜人的。
圖2. 治療性DMD的探索。
信息來源:10.1016/j.ymthe.2017.02.019.
前文已經(jīng)對DMD蛋白進行過描述,圖3A所示為DMD的mRNA結(jié)構(gòu),其中ABD表示Actin結(jié)合域編碼區(qū)。在該基因上可能發(fā)生刪除、重復(fù)、插入以及各種點突變。如果發(fā)生移碼突變或者無義突變,就發(fā)展為DMD,如果沒有移碼突變,則大概率發(fā)展為癥狀較輕的BMD。人們可以通過反義核苷酸(antisense oligonucleotide, ASO)使得蛋白表達時跳過部分突變的外顯子(寧可丟失部分結(jié)構(gòu),也要杜絕移碼突變)或者直接用病毒裝載Micro-或者Mini-DMD進行治療。
圖3B展示的則是DMD相關(guān)模型的突變位點,其中mdx小鼠于上世紀80年代就已經(jīng)開發(fā)了出來,該小鼠的23號外顯子上的C突變成了T,產(chǎn)生了無義突變,導(dǎo)致蛋白結(jié)構(gòu)損失大半,但這種小鼠的癥狀卻并沒有達到預(yù)期,壽命也僅僅比野生型小鼠縮短1/4。因此,人們也嘗試了對很多其他位點進行突變造模,有在外顯子上的,也有在內(nèi)含子上的,都獲得了一定的表型。但總體而言,小鼠受DMD突變的影響要小于人類。
圖3. DMD的基因治療和Dystrophy的相關(guān)模型
信息來源:10.1242/dmm.018424。
在過去的幾十年里,基因治療在治療遺傳性疾病方面取得了重大進展。以基因組學(xué)或蛋白組學(xué)的方式找到致病基因,再結(jié)合細胞水平或動物水平驗證,用這種模式產(chǎn)出的高質(zhì)量文章層出不窮。
賽業(yè)生物過去十年來,已為數(shù)百課題組提供了數(shù)百種用以驗證基因治療療法的基因編輯模式動物和病毒包裝服務(wù)。截至2020年底,賽業(yè)產(chǎn)品和服務(wù)引用文獻總數(shù)達到4750篇,IF合計達20854,文獻被引用次數(shù)累計25043次,其中不乏Nature、Cell、Science等頂級期刊。
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推薦文獻:
1. McGreevy JW, Hakim CH, McIntosh MA, Duan D. Animal models of Duchenne muscular dystrophy: from basic mechanisms to gene therapy. Dis Model Mech. 2015 Mar;8(3):195-213. doi: 10.1242/dmm.018424.
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2. Chamberlain JR, Chamberlain JS. Progress toward Gene Therapy for Duchenne Muscular Dystrophy. Mol Ther. 2017 May 3;25(5):1125-1131. doi: 10.1016/j.ymthe.2017.02.019. Epub 2017 Apr 15.
PMID: 28416280; PMCID: PMC5417844.