最近很多小伙伴向我們咨詢各種Caspase的底物,今天小艾就來跟大家好好聊聊Caspase家族及各類Caspase酶對應的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依賴性天冬氨酸定向蛋白酶)是一類蛋白酶家族,其功能與凋亡(程序性細胞死亡),壞死和發(fā)燒(炎癥)的過程密切相關(guān)。
什么是胱天蛋白酶?
胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它們是為細胞凋亡的主要介質(zhì)。多種受體,例如TNF-α 受體,F(xiàn)asL受體,TLR和死亡受體,以及Bcl-2和凋亡抑制劑(IAP)蛋白家族參與并調(diào)節(jié)該caspase依賴性凋亡途徑。一旦Caspase受到上游信號(外部或內(nèi)在)刺激被激活,即會參與執(zhí)行下游蛋白底物的水解作用,并觸發(fā)一系列事件,導致細胞分解,死亡,吞噬作用和細胞碎片的清除。
人Caspases酶
人的Caspases家族基于序列相似性和生物學功能等共性主要可分為三大類:第一類由具有長胱天蛋白酶募集結(jié)構(gòu)域的“炎癥”胱天蛋白酶組成,他們對P4位上的較大的芳香族或疏水性殘基具有親和力。第二類由具有短的前體結(jié)構(gòu)域的“細胞凋亡效應”胱天蛋白酶組成,而第三類由具有長的前提結(jié)構(gòu)域的Pap位置具有亮氨酸或纈氨酸底物親和力的“凋亡引發(fā)劑”胱天蛋白酶組成(表1)。
表1. 人胱天蛋白酶的功能分類:
細胞死亡途徑 |
半胱天冬酶類型 |
酵素 |
物種 |
細胞凋亡 |
啟動器 |
Caspases 2 |
人與鼠 |
細胞凋亡 |
啟動器 |
Caspases 8 |
人與鼠 |
細胞凋亡 |
啟動器 |
Caspases 9 |
人與鼠 |
細胞凋亡 |
啟動器 |
Caspases 10 |
人的 |
細胞凋亡 |
效應器 |
Caspases 3 |
人與鼠 |
細胞凋亡 |
效應器 |
Caspases 6 |
人與鼠 |
細胞凋亡 |
效應器 |
Caspases 6 |
人與鼠 |
細胞焦亡 |
炎性的 |
Caspases 1 |
人與鼠 |
細胞焦亡 |
炎性的 |
Caspases 4 |
人的 |
細胞焦亡 |
炎性的 |
Caspases 5 |
人的 |
啟動器Caspase和效應器Caspase酶
根據(jù)其在凋亡胱天蛋白酶途徑中的作用,胱天蛋白酶可分為兩類:啟動器和效應器Caspase酶。啟動器和效應器Caspas酶都具有由小亞基和大亞基組成的催化位點,Caspase酶的識別位
凋亡啟動器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以啟動caspase激活級聯(lián)反應。Caspase-8對于形成死亡誘導信號復合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效應子Caspase(例如Caspase 3)并介導線粒體中細胞色素c的釋放。Caspase-8已被證明對IETD肽序列具有相對較高的底物選擇性。凋亡效應胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7雖然不負責啟動級聯(lián)途徑,但是當被激活時,它們在級聯(lián)的中間和后續(xù)步驟中起著不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是關(guān)鍵效應器,因為它放大了來自啟動器Caspase的信號,使用對Caspase-3有選擇性的DEVD肽序列對活化的Caspase-3進行檢測,可以檢測Caspase-3的活性。
Caspase酶底物和抑制劑
Caspase底物和抑制劑由兩個關(guān)鍵成分組成:Caspase識別序列和信號產(chǎn)生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase識別序列不同,一般由三個或四個氨基酸組成(表2)。Caspase酶識別序列的N端通常有乙;ˋc)或碳苯甲氧基(Z)基團修飾,以增強膜的通透性。對應的Caspase識別特定的肽序列為其酶促反應切割位點,釋放產(chǎn)生信號或抑制信號的基序。Caspase的顯色和熒光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信號或顏色強度與蛋白水解活性成正比。
Caspase酶的顯色底物
Caspase的顯色底物是有Caspase識別序列及生色基團組成,常見的生色團有pNA(對硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶標儀或分光光度計在405 nm處進行光密度檢測。
Caspase的熒光底物
Caspase的熒光底物的結(jié)構(gòu)包含與半胱天冬酶識別相關(guān)的熒光團,例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed™620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于兩步裂解過程,其動態(tài)范圍更窄。 建議將R110標記的Caspase底物用于終點法測定,而將AMC和AFC標記的 Caspase底物用于動力學測定。
Caspase的熒光底物
圖.從左到右,分別是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed™620的激發(fā)和發(fā)射光譜。
注意:
ε=在其最大吸收波長處的摩爾消光系數(shù)(單位= cm -1M -1)。
Φ=水性緩沖液(pH 7.2)中的熒光量子產(chǎn)率。
Caspase抑制劑
Caspase抑制劑能與Caspase的活性位點結(jié)合并形成可逆或不可逆的連接,通常,Caspase抑制劑的結(jié)構(gòu)由Caspase識別序列,諸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能團組成。具有醛官能團的胱天蛋白酶抑制劑是可逆的,而具有FMK的抑制劑是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制劑都具有較小的細胞毒性作用,因此,它們是研究半胱天冬酶活性的有用工具。
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