常規(guī)樣本的核酸提取
想必已不再是實(shí)驗(yàn)黨們頭疼的對(duì)象了吧
然鵝,糞便基因組DNA提取步驟實(shí)在繁瑣
還可能遇到提取濃度低,純度差等問(wèn)題
簡(jiǎn)直天崩地裂啊
沒(méi)關(guān)系,這點(diǎn)小事MP幫你解決!
拿好這份指南
讓你的糞便DNA提取實(shí)驗(yàn)事半功倍
預(yù)洗操作
1.向Lysing Matrix E管中加入樣本,再加入1mL Pre-wash Buffer,用渦旋震蕩儀渦旋至糞便樣本被完全重懸起來(lái)。
2.因糞便狀態(tài)而異,渦旋時(shí)間控制在1min以內(nèi),時(shí)間過(guò)長(zhǎng)會(huì)導(dǎo)致一部分細(xì)胞或菌體破裂,損失一部分DNA。
3.12000rpm,離心5min,棄去上清,保留沉淀。
裂解:樣本預(yù)洗后,向Lysing Matrix E中依次加入裂解液的三種成分:Lysis Buffer F1、Lysis Buffer F2、RNase A,渦旋混勻。
使用FastPrep-24TM 5G研磨儀,5 m/s,研磨40s或用渦旋震蕩儀以最大速度渦旋10 min,離心后保留上清液,棄去沉淀。
去雜質(zhì):將上清液轉(zhuǎn)移到新的離心管中,添加去雜劑:PPS,主要用于去除蛋白等雜質(zhì)。在4℃放置5 min能提高效果,離心后,保留上清液,棄去沉淀。
【 PART 03-結(jié)合-漂洗-洗脫 】
圖 |磁珠法提取
這三個(gè)步驟可以手工操作,也可以配合自動(dòng)化核酸提取儀實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化批量操作。一般來(lái)說(shuō),手工提取預(yù)計(jì)在40-45 min左右完成,采用MP公司的24孔磁力架(貨號(hào) 116570413),可以一次處理24個(gè)樣本。而采用自動(dòng)化儀器提取,隨著樣本數(shù)量的增加,操作時(shí)間并不延長(zhǎng),樣品處理量成倍增加,效率大大提高,從此解放雙手。
圖 |24孔磁力架
手工操作
自動(dòng)化操作
1. 將400 µL上清液轉(zhuǎn)移至 96 孔板從左至右的第二列中,并按照下表在各添加其他試劑。
2. 按照下表設(shè)置程序,運(yùn)行自動(dòng)化核酸提取儀。
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