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核酸定量哪家強(qiáng)?熒光探針VS分光光度法

瀏覽次數(shù):1570 發(fā)布日期:2020-10-22  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

DNA編碼所有的遺傳信息,是創(chuàng)造所有生物生命的藍(lán)圖。它充當(dāng)允許遺傳物質(zhì)在世代之間傳遞的存儲設(shè)備。而RNA充當(dāng)讀取DNA中存儲信息的讀卡器。DNA中存儲的遺傳信息由RNA攜帶,同時(shí)RNA充當(dāng)核糖體的信使,并在核糖體中合成蛋白質(zhì)。分子生物學(xué)這整個(gè)過程稱為“中心法則”。

 

 

基于核酸的檢測的范圍繼續(xù)擴(kuò)大,關(guān)于選擇核酸檢測方法有很多。

 

目前常用的是分光光度法,分光光度法利用了核酸的紫外吸收特性。核酸,包括DNA和RNA,均由脫氧核糖或核糖、磷酸基及含氮堿基構(gòu)成。其中,由于堿基含有芳香環(huán)結(jié)構(gòu),因此具有紫外吸收的特性。通過測定260nm處的吸光度,對DNA和RNA進(jìn)行定量。與此同時(shí),還能通過計(jì)算OD260/OD280估計(jì)核酸的純度。由于此法不具有選擇性,無法區(qū)分DNA、RNA或蛋白質(zhì)。檢測數(shù)值極易受到其他污染物(如游離核苷酸、鹽和有機(jī)化合物)和堿基組成差異的影響。

 

今天給大家介紹熒光染料法,AAT開發(fā)的多款熒光染料可以特異地與雙鏈DNA、單鏈DNA、RNA相結(jié)合,并在特定波長光源的激發(fā)下,發(fā)出熒光,這一系統(tǒng)不會檢測到樣本中可能存在的其他雜質(zhì)分子,熒光強(qiáng)度與樣品中的靶分子濃度相對應(yīng)。

 

DNA和RNA定量試劑

 

Helixyte Green dsDNA定量試劑(17597)和StrandBrite Green RNA定量試劑(17611)分別對雙鏈DNA和單鏈RNA進(jìn)行了優(yōu)化。它們對核酸有很高的親和力,對結(jié)合核酸有極大的熒光增強(qiáng)作用,使得在幾分鐘內(nèi)直接檢測復(fù)雜溶液中微量核酸成為可能,而且一般不會受到其他生物分子的干擾。

圖1.小牛胸腺DNA中使用Helixyte 綠色和PicoGreen進(jìn)行DNA定量。由圖看出Helixyte 綠色和PicoGreen  具有幾乎相同的性能。

 

Helixyte Green是一種出色的核酸定量試劑,與dsDNA結(jié)合后可顯著增強(qiáng)熒光。它具有與PicoGreen®相同的光譜特性,因此是PicoGreen®的絕佳替代品(PicoGreen®是Invitrogen的商標(biāo))。它是可用于定量溶液中DNA的最敏感的染色劑之一。使用Helixyte Green,您可以在ssDNA,RNA和游離核苷酸存在的情況下選擇性地檢測低至25 pg / ml的dsDNA。該測定法在三個(gè)數(shù)量級上是線性的,并且?guī)缀鯖]有序列依賴性,使您能夠準(zhǔn)確地測量來自多種來源的DNA,包括基因組DNA,病毒DNA,微量制備DNA或PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。

 

在進(jìn)行Northern雜交分析、S1核酸酶分析、RNase保護(hù)分析、cDNA文庫制備、反轉(zhuǎn)錄PCR之前,檢測和定量少量RNA對于多種分子生物學(xué)過程非常重要,例如測量體外轉(zhuǎn)錄RNA的產(chǎn)量和測量RNA濃度。測量核酸濃度最常用的技術(shù)是在260nm處測定吸光度,吸光度法的主要缺點(diǎn)是蛋白質(zhì)、游離核苷酸和其他紫外線吸收化合物的干擾,但使用敏感的熒光核酸試劑可以緩解這種干擾問題。StrandBrite RNA定量試劑是一種用于溶液中RNA定量的超靈敏熒光核酸染料。StrandBrite RNA定量試劑可以用熒光酶標(biāo)儀或熒光分析儀檢測到低至5ng/mL的RNA。

 

Helixyte Green dsDNA和StrandBrite Green RNA探針的優(yōu)勢:

 

  • 高靈敏度:Helixyte Green和StrandBrite Green的靈敏度比UV吸收率測定法高10,000倍
  • 選擇性高:與紫外吸收的測量不同,這些檢測不受蛋白質(zhì),游離核苷酸或非常短的寡核苷酸的影響,從而使完整的寡核苷酸和核酸的定量在復(fù)雜混合物(例如血清或全血)中更加準(zhǔn)確。
  • 操作簡單:這些檢測方法非常簡單,不需要分離步驟,因此非常適合自動化,高通量篩選
  • 檢范圍廣:對于Helixyte Green的檢測,定量在四個(gè)數(shù)量級內(nèi)都是準(zhǔn)確的。基于StrandBrite 的熒光檢測在三個(gè)數(shù)量級上都是準(zhǔn)確的。

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