背景
膜蛋白是生物膜功能的主要執(zhí)行者,在生物體內(nèi)參與許多重要的生理過程。但是,由于很難獲得穩(wěn)定均勻且維持膜蛋白正確構(gòu)象的膜模擬環(huán)境,膜蛋白研究遠(yuǎn)遠(yuǎn)滯后于水溶性蛋白。磷脂納米盤(Nanodisc)是由高密度脂蛋白發(fā)展而來的用于膜蛋白研究的新類型膜結(jié)構(gòu)。將膜蛋白與Nanodisc組裝起來,是膜蛋白研究的有效方法。制備納米盤的一種常用方法是將苯乙烯-馬來酸(SMA)添加到完整的細(xì)胞膜上,從而自發(fā)地生成SMA-脂質(zhì)顆粒(SMALP)的納米盤1。
微流體擴(kuò)散分級(jí)(MDS)使用微流控分析芯片將蛋白質(zhì)樣本送入一個(gè)通道,在這個(gè)通道中,蛋白質(zhì)樣本與輔助流體一起以穩(wěn)定的層流狀態(tài)流動(dòng),沒有混合。蛋白質(zhì)從一個(gè)流層轉(zhuǎn)移到另一個(gè)流層的唯一途徑是擴(kuò)散,擴(kuò)散的速率與蛋白質(zhì)的大小流體動(dòng)力學(xué)半徑Rh成正比。Rh的改變表明分子結(jié)合事件的發(fā)生。
摘要
在本應(yīng)用中采用MDS技術(shù)的Fluidity one-W檢測到了SMALP納米盤的形成,而且揭示了SMA與脂質(zhì)體的比例是如何影響SMALP納米盤的大小,這是表征嵌入膜蛋白的一個(gè)關(guān)鍵參數(shù)。
低SMA/脂質(zhì)體比例下,SMALP納米盤開始形成。隨著SMA/脂質(zhì)體比例的升高,單層囊泡開始降解,大的異質(zhì)性SMALP逐漸形成。在更高的SMA/脂質(zhì)體比例下,SMALPs的平均流體動(dòng)力學(xué)半徑(Rh)縮小了4.5倍,這使得其內(nèi)嵌的脂質(zhì)大大減少了。
納米盤這種大小變化極大地改變了內(nèi)嵌膜蛋白周圍的環(huán)境,因此在生物物理和生化應(yīng)用中需要加以考慮。
因此,對于研究或使用SMALPs,以根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求調(diào)整SMALP大小的研究人員來說,F(xiàn)luidity one-W是一個(gè)理想的工具。
方法
1.制備熒光標(biāo)記的脂囊泡
1-棕櫚;-2-油酰-SN-甘油-3-磷酰膽堿(POPC)和1-棕櫚酰-2-(二吡啶甲基硼二氟)十一烷基酰-SN-甘油-3-磷酸膽堿(TopFluor® PC; both Avanti Polar Lipids)混合,得到1 mol% 的TopFluor PC。
氯仿蒸發(fā),脂質(zhì)膜干燥過夜,加入PBS緩沖(pH值7.4),得到總脂質(zhì)濃度10mM。10 mM脂質(zhì)(POPC / TopFluor PC 1 mol%)穿過孔隙大小100 nm的聚碳酸酯膜30次,得到熒光標(biāo)記大單層囊泡(LUVs)。
通過動(dòng)態(tài)光散射分析得到的熒光標(biāo)記LUVs,其z-平均流體動(dòng)力學(xué)直徑為118±7 nm,多分散性指數(shù)為0.2±0.08。
2.制備SMALP納米盤
PBS (pH7.4)稀釋苯乙烯-馬來酸(SMA 3:1)共聚物原液。為分析納米盤的形成,將LUVs與SMA以不同比例混合,在21℃溫度下孵育至少2小時(shí)。Fluidity One-W檢測樣品。
結(jié)果
在微流控芯片上,當(dāng)樣品通過芯片時(shí),記錄未擴(kuò)散樣品(Fundiffused)和擴(kuò)散樣品(Fdiffused)的熒光強(qiáng)度。
沒有加入SMA時(shí),完整LUVs的熒光信號(hào)比(SR),SR=Fdiffused/Fundiffused,為~0.15,為低擴(kuò)散水平。
相比之下,在SMA存在的情況下,熒光SR值為0.75,表明大的LUV轉(zhuǎn)化為小得多的微小納米盤,引起了更高水平的擴(kuò)散。
為了分析SMA與脂質(zhì)的比例如何影響SMALP納米盤的大小,不同濃度(25 µM, 50 µM 和100 µM)的熒光標(biāo)記LUVs與SMA混合。
當(dāng)SMA/脂質(zhì)≥0.08時(shí),SR的增加表明SMA從LUVs中提取脂質(zhì),形成小顆粒物,與完整的LUVs共存。
SMA /脂質(zhì)= 0.15時(shí), LUV完全溶液化2。根據(jù)Fluidity one-W檢測結(jié)果,SMA /脂質(zhì)= 0.15時(shí), SMALP納米盤平均Rh是20 nm;隨著SMA比例的提高,最小Rh為4.5 nm 。
根據(jù)測量的Rh值,確定了納米盤的半徑(Rdisc) 3。假設(shè)POPC-雙分子層厚度為4 nm4,那么Rh值為20 nm和4.5 nm時(shí),Rdisc值分別為26 nm和5 nm。
這種Rdisc的變化可直接轉(zhuǎn)化為嵌入的脂質(zhì)的數(shù)量。
結(jié)論
Fluidity one-W利用MDS技術(shù),直接在溶液中檢測分子結(jié)合事件,是一種通過微量樣品檢測SMALP納米盤形成的理想工具。SMALP納米盤的平均流體動(dòng)力學(xué)半徑根據(jù)SMA/脂質(zhì)比例不同從20 nm到4.5 nm不等。這種大小的變化將顯著改變?nèi)魏吻度氲鞍字車闹|(zhì)環(huán)境,因此在納米盤研究中至關(guān)重要。
采用微流控?cái)U(kuò)散(MDS)技術(shù)的Fluidity one-W是一款非常實(shí)用的分子互作儀。研究人員可以在溶液中以及在復(fù)雜的生物學(xué)背景(例如粗裂解液或血漿中)研究蛋白質(zhì)相互作用。還可以分析難以研究的蛋白質(zhì)(例如膜蛋白質(zhì),多蛋白質(zhì)復(fù)合物和固有紊亂的蛋白質(zhì))的相互作用,其中許多蛋白質(zhì)都是重要的藥物靶標(biāo)。此外,由于它報(bào)告了結(jié)合和未結(jié)合物質(zhì)的絕對大小,因此可以與結(jié)合親和力同時(shí)評(píng)估化學(xué)計(jì)量和結(jié)合性質(zhì),從而全面了解結(jié)合事件。
//親和力檢測
//蛋白穩(wěn)定性檢測
//化學(xué)計(jì)量參數(shù)檢測
//直接檢測血清中抗體濃度和親和力
//膜蛋白分子互作最佳檢測方法
//在溶液中直接檢測,更接近天然狀態(tài)
//非表面結(jié)合原理,無需擔(dān)心非特異性結(jié)合
//兼容細(xì)胞裂解液、培養(yǎng)基、血清等復(fù)雜的溶液背景
參考文獻(xiàn)
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