【前情回顧】LifeSensors超全泛素及多聚泛素鏈
泛素-蛋白酶體(ubiquitin-proteasome system,UPS)途徑介導(dǎo)的蛋白降解是機(jī)體調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)蛋白水平與功能的一個(gè)重要機(jī)制。負(fù)責(zé)執(zhí)行這個(gè)調(diào)控過(guò)程的組成成分包括泛素及其啟動(dòng)酶系統(tǒng)和蛋白酶體系統(tǒng)。泛素啟動(dòng)酶系統(tǒng)負(fù)責(zé)活化泛素,并將其結(jié)合到待降解的蛋白上,形成靶蛋白多聚泛素鏈,即泛素化。蛋白酶體系統(tǒng)可以識(shí)別已泛素化的蛋白并將其降解。此外,細(xì)胞內(nèi)還有另一類(lèi)形成反向調(diào)節(jié)的解離泛素鏈分子的蛋白酶——去泛素化酶(Deubiquitinase,DUB)。
在UPS系統(tǒng)中,DUBs主要通過(guò)水解泛素羧基末端的酯鍵、肽鍵或異肽鍵,將泛素分子特異性的從鏈接有泛素的蛋白質(zhì)或者前體蛋白上水解下來(lái)。DUBs對(duì)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和泛素化的方式(如K48、K63、K11等)都具有選擇性,因此不同的DUBs在調(diào)節(jié)泛素化修飾中起到了各種各樣的作用。不斷有研究發(fā)現(xiàn)許多DUBs的功能紊亂與多種疾病相關(guān),包括癌癥、神經(jīng)退行性疾病、血液疾病、以及一些傳染病。并且,DUBs目前也已經(jīng)成為重要的藥物作用靶點(diǎn)。DUBs活性檢測(cè)的難點(diǎn)是合成一種適用于高通量篩選(high-throughput screening,HTS)的生理學(xué)相關(guān)底物以反映DUBs的異肽酶活性。
當(dāng)前,用于測(cè)量泛素/泛素樣蛋白(Ub/Ubl)異肽酶活性的可商購(gòu)試劑和檢測(cè)方法是主要基于對(duì)線(xiàn)性肽-或酰胺鍵的裂解,但是這種裂解方式無(wú)法反映真實(shí)的異肽鍵的幾何類(lèi)型。另外,用于實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)多聚泛素鏈降解的其他基于熒光的均相測(cè)定法需要多個(gè)酶促步驟,或者需要在泛素分子的N末端進(jìn)行特異性修飾,這些處理都會(huì)破壞蛋白構(gòu)象的完整性。目前的這些檢測(cè)試劑和測(cè)定方法無(wú)疑還無(wú)法滿(mǎn)足研究學(xué)者對(duì)DUBs活性檢測(cè)在均一穩(wěn)定性,生物學(xué)相關(guān)和高通量篩選分析上的需求。
作為泛素研究領(lǐng)域的專(zhuān)家,LifeSensors可為您提供一種新型的雙泛素底物,通過(guò)反應(yīng)后的熒光讀數(shù)反應(yīng)DUBs活性。LifeSensors提供的雙泛素分子(Diubiquitin,DiUb)是K48或K63(最廣泛形式的多泛素連接)通過(guò)異肽鍵連接的形式。這些底物可用于確定DUBs對(duì)底物的特異性,監(jiān)測(cè)DUBs介導(dǎo)的異肽裂解的動(dòng)力學(xué)參數(shù),以及研究多泛素化蛋白的選擇性去偶聯(lián)。
這些雙泛素底物是一類(lèi)新的連續(xù)性試驗(yàn)底物,用于研究異肽鍵的裂解。野生型泛素C末端一般是通過(guò)異肽鍵與第二個(gè)泛素分子的Lys48或Lys63連接,其中一個(gè)泛素分子上標(biāo)記了熒光猝滅劑,另一個(gè)泛素分子上標(biāo)記了熒光報(bào)告基團(tuán),這樣就形成了一個(gè)內(nèi)部猝滅的能量轉(zhuǎn)移熒光分子對(duì)(IQF-diubiquitins)。雙泛素分子未裂解時(shí),報(bào)告基團(tuán)的熒光信號(hào)被猝滅基團(tuán)吸收,檢測(cè)不到熒光信號(hào),加入DUBs后,雙泛素分子底物被裂解,導(dǎo)致猝滅熒光基團(tuán)與報(bào)告熒光基團(tuán)分離,熒光信號(hào)增強(qiáng)。每個(gè)雙泛素底物都可以在不同位點(diǎn)(K63-1-2-3-4-5-6或K48-1-2-3-4-5-6)進(jìn)行標(biāo)記,以便對(duì)特定的DUBs形成優(yōu)化的雙泛素底物。重要的是,熒光和淬滅基團(tuán)的引入并不影響泛素分子的天然結(jié)構(gòu)。通過(guò)這種生理底物檢測(cè)泛素異肽酶活性的方法是對(duì)真核蛋白質(zhì)組學(xué)這一重要研究領(lǐng)域的重大突破。
類(lèi)型 |
貨號(hào) |
名稱(chēng) |
描述 |
標(biāo)準(zhǔn)品 |
DU0121 |
Ub-TAMRA Reference Standard |
四甲基羅丹明(TAMRA)標(biāo)記泛素,標(biāo)準(zhǔn)品 |
雙泛素-K48 |
DU4801 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-1) |
在不同位點(diǎn)(1、2、3、4、5、6)標(biāo)記熒光基團(tuán)的雙泛素-K48 |
DU4802 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-2) |
DU4803 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-3) |
DU4804 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-4) |
DU4805 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-5) |
DU4806 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-6) |
雙泛素-K36 |
DU6301 |
Di-Ubiquitin K63 (IQF, Position-1) |
在不同位點(diǎn)(1、2、3、4、5、6)標(biāo)記熒光基團(tuán)的雙泛素-K36 |
DU6302 |
Di-Ubiquitin K63 (IQF, Position-2) |
DU6303 |
Di-Ubiquitin K63 (IQF, Position-3) |
DU6304 |
Di-Ubiquitin K63 (IQF, Position-4) |
DU6305 |
Di-Ubiquitin K63 (IQF, Position-5) |
DU6306 |
Di-Ubiquitin K63 (IQF, Position-6) |
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類(lèi)型 |
貨號(hào) |
名稱(chēng) |
描述 |
標(biāo)準(zhǔn)品 |
DU0121 |
Ub-TAMRA Reference Standard |
四甲基羅丹明(TAMRA)標(biāo)記泛素,標(biāo)準(zhǔn)品 |
雙泛素-K48 |
DU4801 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-1) |
在不同位點(diǎn)(1、2、3、4、5、6)標(biāo)記熒光基團(tuán)的雙泛素-K48 |
DU4802 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-2) |
DU4803 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-3) |
DU4804 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-4) |
DU4805 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-5) |
DU4806 |
Di-Ubiquitin K48 (IQF, Position-6) |
雙泛素-K36 |
DU6301 |
Di-Ubiquitin K63 (IQF, Position-1) |
在不同位點(diǎn)(1、2、3、4、5、6)標(biāo)記熒光基團(tuán)的雙泛素-K36 |
DU6302 |
Di-Ubiquitin K63 (IQF, Position-2) |
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