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PCR疑難問題粉碎機(jī):逆轉(zhuǎn)錄PCR的操作要點(diǎn)與方法

瀏覽次數(shù):1633 發(fā)布日期:2020-6-30  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
     【前情回顧】PCR疑難問題粉碎機(jī)(一)——終點(diǎn)PCR
     【前情回顧】PCR疑難問題粉碎機(jī)(二)——熒光定量PCR
 
       逆轉(zhuǎn)錄 PCR(Reverse TranscriptionPCR, RT-PCR)是一種以 RNA 為樣本,RNA鏈被逆轉(zhuǎn)錄成為互補(bǔ) DNA(cDNA),再以此為模板通過 PCR 進(jìn)行 DNA 擴(kuò)增。在實(shí)際應(yīng)用中,RT-PCR 分為一步法 RT-PCR 和兩步法 RT-PCR。整個反轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程有三個重要的因素,分別是RNA模板、反轉(zhuǎn)錄時所使用的引物類型、反轉(zhuǎn)錄酶 。
 
       RNA模板
 
       高質(zhì)量的 RNA 基本有幾個參數(shù)可供參考,首先是 OD260/280 以及 OD260/230的值應(yīng)該都是 2.0 左右,如果 OD260/280 小于 1.9,說明 RNA 中有一些蛋白質(zhì)的殘留,如果這個值大于 2.1,則很可能樣本中 RNA 有一定的降解。OD260/230如果小于 2.0,說明 RNA 中含有異硫氰酸胍,酚殘留,而這些物質(zhì)對逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)影響是非常大的。另外就是瓊脂糖凝膠電泳檢測 RNA 的完整性,正常的 RNA一般呈現(xiàn)三條帶,即 5s、18s、28s,其各自的亮度呈現(xiàn)遞增狀態(tài),依據(jù)物種不同可逆轉(zhuǎn)錄 PCR能存在些許差異。當(dāng) RNA 出現(xiàn)降解時,反饋?zhàn)蠲黠@的是 5s rRNA 的亮度顯著提高。下圖展示的分別是高質(zhì)量 RNA、稍有降解以及完全降解的實(shí)例:
 

       反轉(zhuǎn)錄引物
 
       提取到了高質(zhì)量的 RNA模板后,下一個需要考慮的問題便是引物的選擇了。通常,反轉(zhuǎn)錄引物有三類,分別是 oligodT、隨機(jī)引物和序列特異性引物:oligodT引物能特異性結(jié)合在含有 polyA 尾的 mRNA 末端起始反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),但這一特性決定了它只能擴(kuò)增含有 polyA 尾的 mRNA,而且對 RNA 模板的質(zhì)量要求較高,一旦 polyA 尾發(fā)生降解,就不能被引物所識別,從而導(dǎo)致產(chǎn)物中沒有相應(yīng)基因的cDNA;隨機(jī)引物一般含有 6-9 個隨機(jī)序列的堿基,能夠隨機(jī)識別結(jié)合在 RNA 模板上,因此這類引物的優(yōu)點(diǎn)在于能同所有類型的 RNA 結(jié)合,而且比較適合于含有二級結(jié)構(gòu)的 RNA 及微量樣本,具有較高的反轉(zhuǎn)錄靈敏度。
 
       但缺點(diǎn)在于,結(jié)合的隨機(jī)性會造成 cDNA小片段較多,有時候還會對微量目的片段造成稀釋;序列特異性引物,顧名思義,針對于特定的序列設(shè)計(jì)的反轉(zhuǎn)錄引物,用于特異性的反轉(zhuǎn)錄某一段序列。在實(shí)際的應(yīng)用中,我們通常會研究同一個個體或細(xì)胞中不同基因表達(dá)水平的變化,因此序列特異性基因相對用的少一些。Solis BioDyn 可供的反轉(zhuǎn)錄預(yù)混液中可提供多種不同的引物(oligodT、隨機(jī)引物、以及 oligodT 與隨機(jī)引物的結(jié)合)供您選擇,滿足您的一切實(shí)驗(yàn)需求!
 
 
       逆轉(zhuǎn)錄酶
 
       Solis BioDyn 可提供兩種逆轉(zhuǎn)錄酶:分別是 MMLV(RNase H+)和 SOLIScript(RNase H-)逆轉(zhuǎn)錄酶。RNase H,是一種核糖核酸內(nèi)切酶,可以特異性地水解DNA-RNA 雜合鏈中的 RNA,不能水解單鏈或雙鏈 DNA 或 RNA。
 
 
類型 貨號 名稱
逆轉(zhuǎn)錄酶 06-13-00050 FIREScript KIT RNase H+ 逆轉(zhuǎn)錄酶
06-33-00050 SOLIScript KIT RNase H- 逆轉(zhuǎn)錄酶
cDNA第一鏈合成 06-17-00100 FIREScript RT cDNA syntesis MIX without primers cDNA合成預(yù)混液,無引物
06-18-00100 FIREScript RT cDNA syntesis MIX with Oligo (dT) primer cDNA合成預(yù)混液,Oligo引物
06-19-00100 FIREScript RT cDNA syntesis MIX with Random primers cDNA合成預(yù)混液,隨機(jī)引物
06-20-00100 FIREScript RT cDNA syntesis MIX with Oligo (dT) and Random primers cDNA合成預(yù)混液,Oligo及隨機(jī)引物
miRNA(加尾法) QP113 All-in-OneTM miRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit 2.0 miRNA cDNA 合成試劑盒
QP010 All-in-OneTM miRNA qPCR Kit miRNA qPCR檢測試劑盒
QP115 All-in-OneTM miRNA qRT-PCR Detection Kit 2.0 miRNA qRT-PCR檢測試劑盒
一步法RT-qPCR 染料法 QP071 BlazeTaq One-Step SYBR Green RT-qPCR Kit (with ROX) RT-qPCR試劑盒,ROX
QP081 BlazeTaq One-Step SYBR Green RT-qPCR Kit (without ROX) RT-qPCR試劑盒,無ROX
探針法 QP076 BlazeTaq Probe One-Step RT-qPCR Kit (with ROX) RT-qPCR試劑盒,ROX
QP086 BlazeTaq Probe One-Step RT-qPCR Kit (without ROX) RT-qPCR試劑盒,無ROX
08-65-00250 SOLIScript 1-step CoV Kit RT-qPCR試劑盒
08-59-00250 SOLIScript 1-step Multiplex Probe Kit (ROX) RT-qPCR試劑盒,ROX
08-61-00250 SOLIScript 1-step Multiplex Probe Kit (Purple) RT-qPCR試劑盒,Purple
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       三點(diǎn):
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       六觀:
       價(jià)值觀:激情、敬業(yè)、學(xué)習(xí)、創(chuàng)新、合作、卓越。
 
來源:艾美捷科技有限公司
聯(lián)系電話:400-6800-868 027-59626688
E-mail:sales@amyjet.com

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