4月23日晚上八點(diǎn),賽業(yè)生物開始了第一期課程,需要課件的老師可以關(guān)注賽業(yè)生物微信公眾號,后臺留言“第一期課件”。針對課程中,各位老師提出的問題,我們進(jìn)行了收集整理,下文為課程中的問題與解答。
Q1: 想咨詢下:如果用小鼠篩選藥物的話,是不是還要用真病毒感染?
A:一般用動物模型篩藥,是要用到真病毒感染的或者臨床分離株的。
Q2:可以講一下目前關(guān)于不同冠狀病毒感染宿主受體靶點(diǎn)的研究進(jìn)展嗎?
A:在昨天的課程已經(jīng)有提到,不同冠狀病毒的宿主靶點(diǎn),HCoV-NL63、SARS-CoV、SARS-CoV-2冠狀病毒受體都是ACE2,HCoV-229E、PEDV、PRCV冠狀病毒的人類受體均是APN,MERS-CoV、HKU4特異性受體是DPP4,MHV結(jié)合CEACAM1等等,有些病毒與宿主細(xì)胞表面的糖受體結(jié)合以進(jìn)行病毒附著,這個我會在第三期課程詳細(xì)講到。那么這里肯定有人會問道,關(guān)于不同病毒相同受體結(jié)合的方式是一樣的嗎?回答是不一樣,這里簡單提一下,S蛋白分為S1頭部和與宿主細(xì)胞膜進(jìn)行融合的融合莖S2兩個功能部分,蛋白從融合前到融合后的構(gòu)象改變受到多種因素的影響,比如說PH值、細(xì)胞進(jìn)入細(xì)胞過程中的溶酶體蛋白酶,轉(zhuǎn)化切割酶、彈性蛋白酶以及細(xì)胞表面蛋白酶等等。
PS:昨天有一位同學(xué)對上述回答提出了疑問,
今天就附上回答的出處吧~
參考文獻(xiàn):Adriaan H.de Wilde,Eric J.Snijder et al, Host Factors in Coronavirus Replication, Current Topics in Microbiology and Immunology, 2018.
Q3:你好,請問,我們機(jī)體都存在機(jī)體免疫,為什么病毒還很輕松的感染人機(jī)體,是怎么逃避人的機(jī)體免疫的呢?
A:免疫逃逸大家都知道,就是病原體逃避了機(jī)體免疫系統(tǒng)的識別,抗原發(fā)生突變,逃逸已建立的抗感染抗體的中和和阻斷作用;也有的是病原體通過其結(jié)構(gòu)和非結(jié)構(gòu)產(chǎn)物,拮抗、阻斷和抑制機(jī)體的免疫應(yīng)答;第三種是干擾免疫效應(yīng)。那么對于新冠病毒來說,是哪一種免疫逃避機(jī)制呢?具有正鏈RNA基因組的病毒只能在胞質(zhì)中復(fù)制,精心修飾細(xì)胞內(nèi)膜以形成病毒RNA復(fù)制的細(xì)胞器,也就是說穿上了不是自己的新衣來偽裝自己,逃避免疫系統(tǒng)的識別。同時有文獻(xiàn)報道,SARS-S 蛋白可以誘導(dǎo)TNF-α的產(chǎn)生,以促進(jìn)病毒進(jìn)入細(xì)胞。
Q4:受體在不同組織的分布及在除肺部以外的局部感染中的作用
A:這里的受體應(yīng)該主要是指ACE2,ACE2在各組織的分布情況,我根據(jù)在gene card上調(diào)查的數(shù)據(jù)進(jìn)行解讀,我參考的是第一欄GTEX Illumina RNAseq數(shù)據(jù)來看,ACE2除了在肺部分布,在免疫系統(tǒng)、神經(jīng)系統(tǒng)、肌肉、內(nèi)臟、分泌、生殖系統(tǒng)均有表達(dá),從圖中可以看出,淋巴結(jié)、心臟、小腸、結(jié)腸、脂肪細(xì)胞、腎臟、肝臟、肺、甲狀腺、乳腺、 前列腺、睪丸中相對表達(dá)量要高一些。
因為ACE2是血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2,參與RAS腎素-血管緊張素調(diào)節(jié)系統(tǒng)的功能。ACE將無活性的血管緊張素I轉(zhuǎn)化為調(diào)控血管收縮的血管緊張素II,而ACE2將血管緊張素II又可以裂解成血管舒張肽Ang1-7,保護(hù)心臟、舒張血管、抗生長、抗增殖,還可以增強(qiáng)緩激肽的活性。
在腎臟中,Ang1-7通過與G蛋白偶聯(lián)受體Mas作用,誘導(dǎo)血管舒張和血管保護(hù),發(fā)揮抗纖維化、抗增殖和抗炎作用。在心血管系統(tǒng)中,RAS系統(tǒng)調(diào)節(jié)體液平衡、血壓平衡并維持血管張力。而ACE2是RAS系統(tǒng)中的重要調(diào)節(jié)蛋白,RAS過度激活或者耗盡都會導(dǎo)致血管功能障礙,表現(xiàn)為動脈粥樣硬化、冠心病、猝死、心力衰竭和中風(fēng)等心血管疾病。同時,ACE/AngII/AT1受體途徑的激活與驗證、氧化應(yīng)激、纖維化、胰島素抵抗等過程相關(guān),因此,在糖尿病性心肌病、糖尿病性神經(jīng)疼痛等研究中,ACE2也發(fā)揮著重要的功能。
Q5:COVID—19與SARS在受體識別過程中有沒有差異?與受體結(jié)合后最可能以什么機(jī)制入侵?
A:SARS-CoV-2與SARS-CoV在受體識別過程中是有差異的,參考李放的一篇文獻(xiàn),我們可以發(fā)現(xiàn),受體結(jié)合位點(diǎn)出現(xiàn)了自然變異,SARS-CoV-2在T487/D480/N479/F442/F472位點(diǎn)均出現(xiàn)了適應(yīng)性變異,使病毒與ACE2結(jié)合能力變得更強(qiáng)。與受體結(jié)合以后,病毒怎么入侵呢?S1結(jié)構(gòu)域及其同源受體之間的相互作用觸發(fā)S2構(gòu)象改變,從而促進(jìn)病毒和細(xì)胞膜之間的膜融合。研究表明跨膜絲氨酸蛋白酶2(TMPRSS2)和呼吸道胰蛋白酶樣蛋白酶TMPRSS11D,可以裂解HCoV-229E和SARS的S1/S2位點(diǎn)。那么SARS-CoV-2是以怎樣的方式進(jìn)入細(xì)胞的呢,目前還沒有明確報道,這里以SARS-CoV為例來說明一下,首先SARS-CoV S蛋白在病毒包裝期間不會被原蛋白轉(zhuǎn)化酶切割,因此在成熟病毒體上該結(jié)構(gòu)是完整的,而SARS-CoV通過內(nèi)吞作用進(jìn)入宿主,S蛋白會被溶酶體蛋白酶切割,低PH值在SARS-CoV進(jìn)入細(xì)胞時激活溶酶體蛋白酶,進(jìn)一步激活SARS-CoV刺突蛋白為膜融合做準(zhǔn)備,這里,除了溶酶體蛋白酶外,組織蛋白酶,胞外的彈性蛋白酶和細(xì)胞表面蛋白酶也可以激活S而促進(jìn)膜融合,蛋白酶可能有助于病毒的組織傾向性。而對于SARS-CoV-2來說,目前有研究表明TMPRSS2對病毒的切割并且有利于病毒入侵,我比較傾向于這種入侵方式。
參考文獻(xiàn):Yushun Wan, Jian Shang, Rachel Graham, Ralph S. Baric, Fang Li. Receptor recognition by novel coronavirus from Wuhan: An analysis based on decade-long structural studies of SARS. JVI. 2020.
Q6:目前有哪些突變體的ACE2 受體,突變后的受體與S蛋白的結(jié)合能力有什么變化?
A:一般情況下不是ACE2突變,而是病毒結(jié)合位點(diǎn)突變,這里所說的ACE2突變是不是想說不同物種ACE2的差異?不同宿主物種的ACE2與病毒接觸的關(guān)鍵殘基差異如下表。
參考文獻(xiàn):Yushun Wan, Jian Shang, Rachel Graham, Ralph S. Baric, Fang Li. Receptor recognition by novel coronavirus from Wuhan: An analysis based on decade-long structural studies of SARS. JVI. 2020.
研究者用等離子體共振的方法SPR surface plasMon resonance來研究病毒與宿主之間的相互作用動力學(xué)特性,研究發(fā)現(xiàn)ACE2與S蛋白胞外域結(jié)構(gòu)的親和力為15nM(平衡解離常數(shù)),是ACE2與SARS-S蛋白胞外域結(jié)合親和力的10-20倍。
Q7:冠狀病毒感染宿主的靶點(diǎn)有哪些?
A:HCoV-NL63/SARS-CoV/SARS-CoV-2 靶點(diǎn)為ACE2;TGEV(豬傳染性胃腸炎冠狀病毒)/PEDV(豬流行性腹瀉冠狀病毒)/PRCV(豬呼吸道冠狀病毒)靶點(diǎn)為APN;MERS-CoV/HKU4蝙蝠冠狀病毒 靶點(diǎn)為DPP4;這些都是病毒S蛋白中S1結(jié)構(gòu)部分C末端區(qū)域與靶點(diǎn)發(fā)生結(jié)合。而鼠肝炎病毒MHV結(jié)合CEACAM1(一種黏附分子)靶點(diǎn),還有些是直接與糖結(jié)合。
關(guān)于冠狀病毒小鼠模型相關(guān)的問題,俞曉峰博士將在下周三晚上19:00—20:00為大家?guī)硐嚓P(guān)的直播課程,主題為:基因編輯小鼠在冠狀病毒研究中的應(yīng)用。請大家持續(xù)關(guān)注~
PS:已經(jīng)在答疑群的同學(xué)不需要再報名