近日,中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院羅湘杭團(tuán)隊(duì)的研究成果在國(guó)際頂級(jí)代謝期刊Cell Metabolism(IF = 22.415)刊登,文章標(biāo)題為《Reducing Hypothalamic Stem Cell Senescence Protects against Aging-Associated Physiological Decline》。該研究在下丘腦的神經(jīng)干細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)一種名為Hnscr(htNSCs-related)的長(zhǎng)非編碼RNA(lncRNA)能夠與YB-1(Y-box Protein 1)蛋白結(jié)合,并抑制YB-1蛋白的降解。而YB-1又能抑制衰老相關(guān)的蛋白的表達(dá),而且還能恢復(fù)衰老小鼠的記憶認(rèn)知和肌肉平衡等功能。并且通過(guò)對(duì)YB-1蛋白與Hnscr結(jié)合區(qū)域的結(jié)構(gòu)分析,篩選到了一種叫做TF2A的天然化合物,該化合物能夠模擬Hnscr的功能,通過(guò)抑制YB-1的降解,從而降低衰老相關(guān)蛋白的表達(dá),也能起到對(duì)小鼠衰老表型的恢復(fù)作用。
研究背景
衰老是生物界的法則,任何有生命的個(gè)體都無(wú)法逃脫從一誕生就走向衰老,直至死亡這一過(guò)程。人類從古至今孜孜不倦地尋找長(zhǎng)生不老之法,中國(guó)古代從秦皇漢武,到明清的嘉靖雍正,為此無(wú)不耗費(fèi)了巨大財(cái)力和人力。即便是在現(xiàn)在,人們依然在尋找長(zhǎng)壽的秘訣。但目前能做到的只能想方設(shè)法將這一過(guò)程延緩,提高衰老過(guò)程中的人類的生活質(zhì)量。因此對(duì)衰老的深層生物學(xué)機(jī)制的研究可以幫助我們更好地有的放矢,尋找能夠幫助人類延緩衰老的方案。
目前引起衰老的9大原因:
1. 基因組不穩(wěn)定性增加(genomic instability)
2. 端?s短(telomere attrition)
3. 表觀遺傳學(xué)改變(epigenetic alterations)
4. 蛋白內(nèi)穩(wěn)態(tài)喪失(loss of proteostasis)
5. 營(yíng)養(yǎng)感應(yīng)失調(diào)(deregulated nutrient sensing)
6. 線粒體功能異常(mitochondrial dysfunction)
7.細(xì)胞間信息傳遞改變(altered intercellular communication)
8. 干細(xì)胞枯竭(stem cell exhaustion)
9. 細(xì)胞衰老(cellular senescence)
圖1. 衰老的九大標(biāo)志(引自Lopez-Otin et al., 2013 )
目前有研究發(fā)現(xiàn)下丘腦的功能對(duì)人體的衰老有著重大的影響。下丘腦位于大腦腹面,基本與人的耳朵和眼睛處于同一平面。是調(diào)節(jié)內(nèi)臟,代謝和內(nèi)分泌的重要腦區(qū),能調(diào)節(jié)垂體對(duì)激素的分泌,控制如體溫、飲水,攝食、性活動(dòng)、打斗等行為。2017年,有研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)小鼠下丘腦的神經(jīng)干細(xì)胞隨年齡增長(zhǎng)而逐漸衰老死亡,并伴隨著如肌肉耐力、社交能力以及記憶力等衰老表型的出現(xiàn);如果將新生小鼠的神經(jīng)干細(xì)胞移植到中年小鼠相應(yīng)的腦區(qū),則會(huì)使小鼠重新獲得生命活力。因此,神經(jīng)干細(xì)胞尤其是下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞(hypothalamus Neural Stem Cells, htNSCs)的研究可能幫助人們找到對(duì)抗衰老的利器。
圖2. 人類下丘腦(引自NIH)
目前的研究認(rèn)為,在人類的編碼RNA中,真正編碼蛋白的只占30%左右,其余的非編碼RNA還包括小干擾RNA(miRNA)、小核RNA/核仁小RNA(snRNA/snoRNA)、假基因RNA、雜RNA和長(zhǎng)非編碼RNA (long non-coding RNA, lncRNA)。在這些非編碼RNA中,lncRNA長(zhǎng)度大于200個(gè)核苷酸,占總編碼基因的35~40%左右。和其他的非編碼RNA一樣,有一定的時(shí)空表達(dá)特異性,能夠調(diào)節(jié)編碼蛋白的轉(zhuǎn)錄,在高等生物的發(fā)育和組織分化等過(guò)程中起著重要作用。
圖3. 長(zhǎng)非編碼RNA(lncRNA)(引自Atianand et al., 2014)
相比之下,小鼠的lncRNA數(shù)量較少,但也具有不可忽視的重要作用。總體而言,不同物種之間的lncRNA保守性不是很高,并不是所有的人類lncRNA都能在常用的模式動(dòng)物中找到同源物。
研究?jī)?nèi)容
2.1 影響下丘腦衰老的長(zhǎng)非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)
在實(shí)驗(yàn)室條件下,小鼠的壽命一般為24個(gè)月。研究人員對(duì)比了3個(gè)月(年輕)和18個(gè)月(中年)小鼠下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞的生長(zhǎng)情況,發(fā)現(xiàn)在體外培養(yǎng)7-10天后,年輕小鼠的下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞(神經(jīng)干細(xì)胞在體外培養(yǎng)時(shí)一般會(huì)從單個(gè)細(xì)胞分裂成一團(tuán)細(xì)胞,這些細(xì)胞聚集成球狀,其狀態(tài)可表征神經(jīng)干細(xì)胞的活性)形成神經(jīng)球的數(shù)量和大小都要高于中年小鼠,說(shuō)明年輕小鼠的下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞數(shù)量和活性都要高于中年小鼠。
那么,這種差異是如何產(chǎn)生的呢?使用RNAseq對(duì)這些神經(jīng)球進(jìn)行檢測(cè),發(fā)現(xiàn)一種被命名為Hnscr(htNSCs-related)的lnc-RNA在年輕小鼠的表達(dá)要顯著高于中年小鼠,而且這種lnc-RNA與人類高度同源,選擇其進(jìn)行研究有利于后續(xù)向人類相關(guān)lncRNA研究的轉(zhuǎn)化。通過(guò)RT-PCR檢測(cè)也發(fā)現(xiàn)Hnscr不但在3個(gè)月和18個(gè)月的小鼠中存在顯著差異,而且隨著年齡的增長(zhǎng)表達(dá)逐漸降低。
圖4. 年齡對(duì)htNSCs形成神經(jīng)球的影響及Hnscr表達(dá)隨年齡減少
2.2 Hnscr敲除小鼠抑制htNSCs活性并誘發(fā)衰老表型
這里用到的Hnscr敲除小鼠(賽業(yè)生物科技提供)年輕的時(shí)候(3月齡)在大部分基本表型上與對(duì)照小鼠相比,在體重、行為以及生育等方面沒(méi)有差異。但當(dāng)小鼠到了18個(gè)月的時(shí)候,轉(zhuǎn)基因小鼠的htNSCs出現(xiàn)了明顯的病理表型,包括形成神經(jīng)球的數(shù)量減少,體積減;衰老神經(jīng)元的增加;分化能力變?nèi)酢?/p>
圖5. 敲除hnscr基因?qū)tNSCs的影響
上述的這些研究都是神經(jīng)干細(xì)胞在離體培養(yǎng)中發(fā)生的改變。那么具體到動(dòng)物的表型上又有哪些改變呢?
研究人員通過(guò)一系列的行為實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)Hnscr敲除小鼠的肌肉持久力變?nèi)酰瑒?dòng)作的協(xié)調(diào)性變差,運(yùn)動(dòng)能力降低,與其他小鼠的互動(dòng)減少,同時(shí)空間記憶能力也不如同窩對(duì)照小鼠。這一系列的衰老表型導(dǎo)致了Hnscr敲除小鼠的壽命顯著降低。
圖6. 敲除hnscr基因?qū)π∈蟊硇偷挠绊?/span>
2.3 局部抑制Hnscr抑制小鼠htNSCs活性并誘發(fā)衰老表型
雖然已經(jīng)證實(shí)了Hnscr對(duì)下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞和小鼠認(rèn)知功能的影響,但是由于轉(zhuǎn)基因小鼠的Hnscr缺失是全身性的,具體到下丘腦干細(xì)胞對(duì)衰老的影響還無(wú)法下定論。因此研究人員采用腦定位注射的方法,用腺病毒包裝SOX2啟動(dòng)子和Hnscr-shRNA注射進(jìn)入14月齡小鼠下丘腦內(nèi)側(cè)基底(Mediobasal Hypothalamic,MBH)抑制Hnscr的表達(dá)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)與Hnscr敲除小鼠一樣,htNSCs的神經(jīng)球數(shù)量減少,體積減小;衰老神經(jīng)元增加;分化能力變?nèi)酢?/p>
圖7. 局部注射sh-hnscr抑制Hnscr對(duì)htNSCs的影響
此外,在動(dòng)物行為方面,小鼠除了社交能力沒(méi)有明顯變化以外,其他的注射了sh-hnscr的小鼠發(fā)生了和基因敲除小鼠一致的表型。
圖8. 局部注射sh-Hnscr對(duì)野生型小鼠表型的影響
2.4 YB-1受Hnscr調(diào)節(jié)并參與對(duì)小鼠htNSCs衰老的抑制
那么,Hnscr究竟是怎樣影響小鼠htNSCs的改變并作用到小鼠衰老表型的呢?通過(guò)RNA-pulldown后的質(zhì)譜檢測(cè)(找出與該RNA結(jié)合的豐度最高的蛋白),免疫印跡(用抗體確定就是YB1蛋白),免疫共沉淀(進(jìn)一步證明結(jié)合)等多種方法證明Hnscr是與一種YB-1(Y-box Protein 1)的蛋白具有高度的親和力。并且還發(fā)現(xiàn)Hnscr影響的是YB-1的蛋白水平而非RNA轉(zhuǎn)錄水平。接下來(lái)通過(guò)蛋白酶抑制劑的使用和泛素化實(shí)驗(yàn),研究人員確定了Hnscr能夠抑制YB-1的泛素化降解,從而提高YB-1在神經(jīng)細(xì)胞中的豐度。
注:YB-1是一種能夠結(jié)合DNA和RNA的蛋白,通常在轉(zhuǎn)錄和翻譯過(guò)程中發(fā)揮作用,并作用于pre-RNA的剪切、DNA的修復(fù)以及參與核糖核蛋白的組裝,還有研究發(fā)現(xiàn)YB-1能夠在microRNA的加工中起作用,其不正常表達(dá)跟多種腫瘤的發(fā)生有關(guān)。
圖9. Hnscr抑制YB-1降解
為了進(jìn)一步明確Hnscr和YB-1對(duì)衰老的影響,在Hnscr敲除小鼠中研究人員用RT-PCR的方法檢測(cè)發(fā)現(xiàn)Hnscr或者YB-1減少均會(huì)導(dǎo)致p16INK4A mRNA表達(dá)量的增加。Hnscr的減少會(huì)降低YB-1的表達(dá),反過(guò)來(lái)YB-1的增加卻不會(huì)提高Hnscr的水平,說(shuō)明Hnscr在通路中位于YB-1的上游。對(duì)mRNA的表達(dá)一致,YB-1的增加也會(huì)抑制p16INK4A 蛋白的表達(dá)。研究人員繼續(xù)對(duì)htNSCs的活性和衰老狀態(tài)進(jìn)行了檢測(cè),發(fā)現(xiàn)增加YB-1也能抑制其衰老并提高分化活性。
注:p16INK4A與衰老相關(guān),可以看做是一種衰老標(biāo)志物蛋白,但該蛋白也是一種抑癌基因,其活性的降低在多種腫瘤細(xì)胞中也比較常見(jiàn)。
圖10 . YB-1對(duì)Hnscr缺失小鼠p16INK4A和htNSCs影響
2.5 TF2A抑制YB-1降解并緩解htNSCs及小鼠的衰老
無(wú)論是YB-1還是Hnscr,直接應(yīng)用于對(duì)抗人類的衰老都是相當(dāng)困難的,那么有沒(méi)有一種物質(zhì)能夠模擬Hnscr的作用,抑制YB-1進(jìn)行的降解,從而抑制衰老呢?研究人員從分子化合物庫(kù)中篩選得到了一種名為TF2A(茶黃素3-沒(méi)食子鹽酸,Theaflavin 3-Gallate)的物質(zhì),該物質(zhì)在經(jīng)過(guò)發(fā)酵的紅茶中含量豐富,而紅茶又是中國(guó)南方地區(qū)廣泛流行的飲品。在蛋白合成抑制劑CHX的存在的條件下,實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)TF2A能夠和Hnscr一樣抑制YB-1的降解,并能抑制YB-1的泛素化,而且在一定濃度范圍內(nèi),隨著TF2A濃度的提高,YB-1的豐度逐漸提高。
圖11. TF2A抑制YB-1降解
研究者也補(bǔ)充了細(xì)胞表型和動(dòng)物行為方面的實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示TF2A對(duì)htNSCs起到的恢復(fù)效果基本和外源增加Hnscr與YB-1所產(chǎn)生的效果一致,不過(guò)對(duì)小鼠肌肉和運(yùn)動(dòng)協(xié)調(diào)恢復(fù)有明顯效果,對(duì)認(rèn)知和社交這類高級(jí)認(rèn)知功能也體現(xiàn)出了部分作用,不過(guò)統(tǒng)計(jì)上并沒(méi)有與對(duì)照產(chǎn)生統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著差異。值得注意的是,TF2A是通過(guò)飲用水給小鼠服用的,說(shuō)明該物質(zhì)易用性很好。
圖12. TF2A抑制htNSCs衰老并改善小鼠衰老表型
全文總結(jié)及展望
總結(jié)下來(lái),本文的研究思路十分清晰:
1. 對(duì)比lncRNA在不同年齡之間htNSCs的表達(dá)差異,根據(jù)表達(dá)變化幅度以及與人類的親源關(guān)系等限定條件找到Hnscr;
2. 利用基因編輯敲除小鼠Hnscr,研究Hnscr對(duì)htNSCs以及小鼠表型的影響;
3. 通過(guò)腦定位注射shRNA精準(zhǔn)抑制小鼠下丘腦神經(jīng)干細(xì)胞中的Hnscr,探究該區(qū)域htNSCs的改變,驗(yàn)證Hnscr敲除小鼠中該長(zhǎng)非編碼RNA的功能;
4. 通過(guò)多種方法找到Hnscr高親和力蛋白YB-1,先確定Hnscr抑制YB-1降解,并驗(yàn)證YB-1對(duì)htNSCs和小鼠表型的影響;
5. 通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)和實(shí)驗(yàn)篩選出功能類似于Hnscr的小分子化合物,并驗(yàn)證其在小鼠下丘腦干細(xì)胞和動(dòng)物表型中發(fā)揮的作用。
該研究不僅揭示了下丘腦中神經(jīng)干細(xì)胞影響衰老的深層機(jī)理,加強(qiáng)了人們對(duì)衰老過(guò)程的認(rèn)識(shí),還發(fā)現(xiàn)了一種能夠模擬抗衰老長(zhǎng)非編碼RNA的化合物——TF2A。長(zhǎng)久以來(lái)就有喝茶有益健康,延年益壽的說(shuō)法。TF2A是發(fā)酵紅茶中的一種成分,早在上世紀(jì)50年代就已經(jīng)被分離出來(lái)。該研究采用現(xiàn)代生物學(xué)的方法,通過(guò)多角度的深入研究,發(fā)現(xiàn)了其在抗衰老作用的深層機(jī)理,在人類追求高品質(zhì)的老年生活的道路上邁出了堅(jiān)實(shí)的一步。
參考文獻(xiàn):
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