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鋅指蛋白ZFP217通過(guò)介導(dǎo)m6A mRNA甲基化導(dǎo)致肥胖的原理

瀏覽次數(shù):4115 發(fā)布日期:2019-9-25  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

過(guò)去三十年來(lái),全球肥胖和2型糖尿病的發(fā)病率有所上升,而脂肪組織是肥胖相關(guān)疾病的重要因素,因此,控制脂肪細(xì)胞分化和成熟可能是治療肥胖相關(guān)疾病的一個(gè)有希望的策略(1)。為了闡明轉(zhuǎn)錄和表觀(guān)遺傳調(diào)控在脂肪形成中的作用,并確定一個(gè)主要的關(guān)鍵調(diào)控因子和途徑(1,2),人們做了大量的努力,然而,轉(zhuǎn)錄后調(diào)控在脂肪形成中的作用尚不清楚。

 

鋅指蛋白217(Zfp217,人類(lèi)同源蛋白ZNF217)是一種在多種人類(lèi)腫瘤(4,5)中上調(diào)的已知致癌蛋白,也是胚胎干細(xì)胞分化的關(guān)鍵蛋白(3,7,8)。值得注意的是,Zfp217將基因轉(zhuǎn)錄與新生RNA上的m6A修飾緊密結(jié)合,提示Zfp217在協(xié)調(diào)表觀(guān)遺傳和表觀(guān)轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵作用(3,9)。雖然我們之前確定了一個(gè)新的角色對(duì)于脂肪發(fā)生中的Zfp217,詳細(xì)的Zfp217依賴(lài)機(jī)制尚未得到很好的描述(10,11)。然而,這些研究增加了Zfp217可能通過(guò)調(diào)節(jié)m6A修飾來(lái)加速脂肪生成的可能性。

 

為了闡明Zfp217蛋白在脂肪生成中的作用,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)與飼料科學(xué)系的彭建教授團(tuán)隊(duì),通過(guò)sRNAi、CRISPR/Cas9、Co-IP, OpenSPR  LSPR技術(shù)等實(shí)驗(yàn)方法, 最終確定Zfp217通過(guò)介導(dǎo)m6A mRNA甲基化編排轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié),促進(jìn)了脂肪分化并將該結(jié)果于2019年4月發(fā)表于《Nucleic Acids Research, 2019》(IF 11.5)。

 

 

 

具體實(shí)驗(yàn)內(nèi)容

 

通過(guò)sRNAi、CRISPR/Cas9、流式、Co-IP, LC-MS/Ms、Chip等實(shí)驗(yàn)方法,發(fā)現(xiàn)Zfp217,YTHDF2 , FTO, m6A RNA之間在脂肪生成過(guò)程中形成了一個(gè)調(diào)控環(huán)路, Zfp217缺失會(huì)抑制脂肪生成,并通過(guò)OpenSPR的LSPR技術(shù)檢測(cè)確定了不同因子之間相互作用關(guān)系:

1)提取總RNA定量PCR分析,對(duì)m6A做點(diǎn)雜交及質(zhì)譜分析發(fā)現(xiàn)RNAi及CRISPR/Cas9處理后缺失了Zfp217的細(xì)胞中, m6A修飾水平明顯增加;LC-MS/Ms 發(fā)現(xiàn) m6Am在Zfp217缺失的細(xì)胞中顯著增加,m6A是m6Am的10倍,意示m6A可能是主要的關(guān)注點(diǎn);點(diǎn)雜交實(shí)驗(yàn)顯示,m6A的水平?jīng)]有變化。但是缺失Zfp217的細(xì)胞中,m6A 修飾顯著增加,暗示Zfp217對(duì)m6A RNA甲基化起關(guān)鍵的作用;并且pull-down實(shí)驗(yàn)顯示FTO 和YTHDF2與m6A ssRNA 競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合,CO-IP檢測(cè)發(fā)現(xiàn)Zfp217 與 YTHDF2存在相互作用。

 

 

2)LSPR 檢測(cè):為了確定Zfp217 與 YTHDF2是否是直接相互作用及闡明上述三者之間的關(guān)系,本研究利用Nicoya OpenSPR 的LSPR技術(shù),YTHDF2固定在芯片上,檢測(cè)了Zfp217與YTHDF2、、m6A ssRNA 三者之間的相互作用情況,結(jié)果顯示Zfp217 與 YTHDF2之間親和力很高,是直接相互作用,并且Zfp217會(huì)阻止包含m6A的 ssRNA與 YTHDF2的結(jié)合(圖2),這個(gè)數(shù)據(jù)科學(xué)直觀(guān)的解析了后期關(guān)于Zfp217與YTHDF2相互作用以使FTO 能與m6A結(jié)合 ,從而增強(qiáng)了FTO對(duì)m6A RNA的定位和去甲基化酶活性(圖1)。

 

 

 

總的來(lái)說(shuō),這項(xiàng)研究首次證明了Zfp217在脂肪生成中的復(fù)雜作用。Zfp217與m6A去甲基化酶FTO的啟動(dòng)子直接結(jié)合,并與m6A“閱讀器”蛋白YTHDF2相互作用,從而增強(qiáng)了FTO對(duì)m6A RNA的去甲基化酶活性。最終,Zfp217以依賴(lài)于m6A-YTHDF2的方式促進(jìn)脂肪生成(圖3)。

 

 

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