蛋白酶體是催化蛋白酶的大的多亞基，負(fù)責(zé)大部分細(xì)胞質(zhì)和核蛋白降解，并且它們的結(jié)構(gòu)和功能在真核生物中是保守的。蛋白酶體最初被鑒定為泛素依賴性蛋白水解途徑的蛋白水解模塊。
植物細(xì)胞含有26S和20S蛋白酶體的混合物，其分別介導(dǎo)泛素依賴性和泛素非依賴性蛋白水解。26S蛋白酶體是一種ATP依賴性蛋白酶，它負(fù)責(zé)許多重要細(xì)胞調(diào)節(jié)因子的降解，特別是那些與多種泛素結(jié)合的蛋白酶。26S蛋白酶體含有20S蛋白酶體和一個(gè)或兩個(gè)調(diào)節(jié)顆粒，這是泛素依賴性降解所必需的。 已有研究表明擬南芥26S蛋白酶體生物發(fā)生的減少會(huì)導(dǎo)致熱休克超敏性和降低細(xì)胞分裂速率，其通過(guò)增加的細(xì)胞擴(kuò)增來(lái)補(bǔ)償。26S蛋白酶體功能的喪失還導(dǎo)致20S蛋白酶體生物發(fā)生增加，其反過(guò)來(lái)增強(qiáng)細(xì)胞降解氧化蛋白的能力，從而增加氧化應(yīng)激耐受性。
自噬是真核生物中主要的細(xì)胞降解途徑。研究揭示了自噬在植物生命的許多方面的重要性，包括幼苗建立，植物發(fā)育，抗逆性，新陳代謝和繁殖。這證明了自噬在惡劣環(huán)境條件下進(jìn)行大量降解的雙重能力，同時(shí)高度選擇性地靶向特定區(qū)域和蛋白質(zhì)復(fù)合物以調(diào)節(jié)關(guān)鍵的細(xì)胞過(guò)程，即使在有利的生長(zhǎng)條件下也是如此。細(xì)胞成分被輸送到液泡中使其能夠循環(huán)利用，尤其是在壓力下影響植物代謝組。
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