流式細(xì)胞術(shù)常見問題解答!
今天小編跟大家分享一些流式細(xì)胞術(shù)常見問題解答。快來看看吧!
⒈用于做Western 或ELISA的一抗可否用于流式細(xì)胞術(shù)?
看你說明書上是怎么說的了,如果沒有說就不可以做流式,需要另外買了。
⒉請問流式細(xì)胞術(shù)單抗直接熒光需要幾種對照?
首先確認(rèn)你用的直標(biāo)抗體的熒光染料是什么,再確定該抗體的來源種屬,選擇相應(yīng)的同型對照。如:你現(xiàn)在想檢測小鼠淋巴細(xì)胞表面的CD4抗原, 熒光染料為FITC, 抗體來源為大鼠的IgG1亞型, 即Rat anti Mouse CD4-FITC (IgG1), 你所需要的同型對照就應(yīng)該是Rat IgG1-FITC, 一般的抗體說明上都會寫清。
⒊6孔板的細(xì)胞量能否做流式呀?
對于6孔板而言,每孔的表面積為10 cm2,依細(xì)胞種類不同在長滿時達(dá)到的數(shù)量從5*10的5次方到5*10的6次方不等。6孔板絕對沒問題的!甚至24孔板也可以正常做。不過用于調(diào)試儀器參數(shù)的正常細(xì)胞要多準(zhǔn)備一些。
⒋流式中檢測細(xì)胞表面和細(xì)胞內(nèi)蛋白表達(dá)水平的抗體有何區(qū)別?
抗體只是針對相應(yīng)抗原的,至于是針對胞內(nèi)還是胞膜對你檢測來說并無明顯影響,你只需要查清楚到底是針對哪一個部位的抗原的,應(yīng)該是可以用同一種抗體進(jìn)行檢測的,在流式操作時只需注意:如果是針對胞內(nèi),則需要加破膜劑,讓抗體能和相應(yīng)抗原接觸,否則就不需要了。
⒌只要是熒光抗體就可以用于共聚焦顯微鏡嗎?
一般情況下都是可以的。但有時候強度不夠,需要選擇熒光強度大的染料。
⒍流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞周期是否需要雞紅細(xì)胞作參照?
不用,標(biāo)準(zhǔn)微球做完laser alignment(光路校正)就可以了。盡量把微球的各色CV值控制在1.5以內(nèi)。
⒎流式細(xì)胞儀上的FL2-W FL2-A FL2-H 分別是做什么的?
FL2-W是只檢測熒光的脈沖寬度, FL2-H是指脈沖高度。通常在做細(xì)胞周期分析時應(yīng)用,用于去除粘連細(xì)胞。
⒏細(xì)胞膜蛋白變化是用流氏檢測好,還是要做western?
膜蛋白的提取,好像很費功夫,提取的不好,western結(jié)果也就不可信。流式需要的抗體很少,流式能夠檢測陽性表達(dá)細(xì)胞的比例,western能對總的表達(dá)定量,各有有缺點。
⒐培養(yǎng)細(xì)胞的bcl-2及Bax蛋白的檢測?
首先制成單細(xì)胞懸液,PBS洗滌后用胞內(nèi)染色試劑盒(很多公司都有,其實就是固定劑加增透/打孔劑)進(jìn)行處理,再進(jìn)行抗體孵育標(biāo)記染色,洗滌后上樣。
⒑如何分選原始紅細(xì)胞?
CD71(轉(zhuǎn)鐵蛋白受體)--幼稚細(xì)胞的標(biāo)記
CD235(GPA)--紅細(xì)胞的標(biāo)記(小鼠有Ter119)
雙陽性細(xì)胞即為幼稚紅細(xì)胞,但無法區(qū)分原始及中晚幼紅.
⒒怎樣選擇流式同型對照?
同型對照(Isotype Control):使用與一抗相同種屬來源、相同亞型、相同劑量和相同的免疫球蛋白及亞型的免疫球蛋白,用于消除由于抗體非特異性結(jié)合到細(xì)胞表面而產(chǎn)生的背景染色。如果一抗是多抗,可以用an normal serum(與一抗相同的正常血清) (must be the same species as primary antibody)。This control is easy to achieve and can be used routinely in immunohistochemical staining.這個可以咨詢試劑商。同型對照為免疫熒光標(biāo)記中的陰性對照。由于熒光標(biāo)記單抗的組來源不同,應(yīng)選用相同來源的未標(biāo)記單抗作為同型對照來調(diào)整背景染色。舉個例子:比如檢測一抗為單抗的mouse anti rat CD11b,clone OX-42 purified IgG,那么它的isotype 是mouse IgG2a, 所以可以用purified(純化的) mouse IgG2a來做OX-42的同型對照(Isotype Control)。一般的的生物技術(shù)公司和國內(nèi)的代理都有出售。
同型對照:是指與MoAb相同的、未免疫小鼠的免疫球蛋白亞類,若使用直接免疫熒光染色法,同型對照也應(yīng)標(biāo)記熒光色素,如IgG1 FITC、IgG2a、PE等。主要考慮了細(xì)胞的自發(fā)熒光、FC受體介導(dǎo)的抗體結(jié)合和非特異性抗體結(jié)合等影響因素。此外,同型對照與MoAb所標(biāo)記的熒光色素、濃度、F:P比值(標(biāo)記的熒光色素與免疫球蛋白分子的比值)應(yīng)該相同為最佳,這對準(zhǔn)確設(shè)定陰性與陽性細(xì)胞的界標(biāo)有重要意義,切忌使用與MoAb不相匹配的同型對照,最好為同一實驗室、采用相同工藝或方法制備(如同一品牌)的產(chǎn)品。
⒓流式細(xì)胞技術(shù)測定細(xì)胞內(nèi)游離鈣濃度為何要使用氯化鈣。
在文獻(xiàn)及其他專業(yè)網(wǎng)站中都有測定游離鈣的方法,具體如下:
(1) 鈣熒光探針負(fù)載;
(2)隨機(jī)測定每管細(xì)胞懸液樣品(以下簡稱樣品)的單個細(xì)胞的熒光強度,記為F值。
(3)加入10%Triton X 100,(破膜用);加入1 mmol/L氯化鈣,(問題所在),吹打均勻,孵育1~10min,測定熒光即Fmax值。
(4)加入EGTA,20μl(鈣螯合劑),孵育1~10min,激發(fā)波長488nm測定熒光,即Fmin值。這個過程中的氯化鈣的作用如何, 請高人指點, 謝謝。
因為正常血漿中Ca2+濃度是1mM,細(xì)胞外液的Ca2+對細(xì)胞內(nèi)Ca2+有影響。加0.1%triton是增加膜通透性,使細(xì)胞外Ca2+進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),作為最大值。加EGTA是為了螯合Ca2+,作為最小值.生理環(huán)境中細(xì)胞內(nèi)鈣離子濃度遠(yuǎn)低于細(xì)胞外液(大約1:10000),細(xì)胞膜對鈣的通透性變化對細(xì)胞內(nèi)鈣影響很大。
⒔流式與werstern的區(qū)別有哪些?
(1)Western 是檢測蛋白表達(dá)的金標(biāo)準(zhǔn),可用于檢測細(xì)胞多種類型的蛋白;流式細(xì)胞術(shù)的方法多用于檢測細(xì)胞膜蛋白,雖然也可通過Triton-X100給細(xì)胞打孔的方法來檢測胞內(nèi)蛋白,但對于分泌蛋白卻是無能為力的;
(2)Western測蛋白含量對抗體的量需要很少,一般1:1000左右,而流式對抗體的需要量很大,一般1:50(很浪費抗體);
(3)采用Western方法檢測細(xì)胞蛋白含量的變化一般要有內(nèi)參,而流式一般要把每個樣品分為兩份,同時都做只加二抗(FITC標(biāo)記的)的對照,這樣平均到每個細(xì)胞的發(fā)光就不用內(nèi)參了;
(4)就個人經(jīng)驗而言,流式用多抗不好,單抗標(biāo)出來不錯。
不過流式的應(yīng)用原理主要還是抗原和抗體反應(yīng)和western、免疫組化沒有本質(zhì)差別,但是由于免疫組化和western都有酶催化底物的放大體系,因此,流式不適合檢測低表達(dá)的蛋白,低表達(dá)的還是采用western(尤其是化學(xué)發(fā)光底物更佳)和免疫組化更好。當(dāng)然,流式最大的一個特點就是,可以定量(百分比),如果是高表達(dá)的用流式細(xì)胞儀非常有優(yōu)勢。
⒕FL1, FL2, FL3 的區(qū)別是什么? 是指在不同位置測得的熒光?還是不同波長的熒光?這3個參數(shù)到底測的是什么?有什么意義?
你的理解是正確的,其實FL1, FL2, FL3 是指不同的熒光通道.舉個例子來說吧.我們用FITC/PE雙標(biāo)記的細(xì)胞,在488nm的激光激發(fā)下,這兩種熒光染料分別發(fā)出波長不同的綠色和橙色熒光,然后這發(fā)出的熒光再通過濾光片分開,對應(yīng)的是不同的波長的濾光片,一般在fl1那的是530nm的濾光片,在FL2那的是575nm的濾光片,這樣就可以把在一起的熒光分開了。
⒖MFI和GFI的意義?
Geo Mean,叫做幾何均數(shù)(geometric mean),常用于等級資料和對數(shù)正態(tài)分布資料,和常用的算數(shù)均數(shù)(mean)的計算方法不同。“ %total或者%gate的結(jié)果”代表的是百分率,即細(xì)胞占總體細(xì)胞或者是門內(nèi)細(xì)胞的百分比;用百分比作為統(tǒng)計指標(biāo),適用于熒光表達(dá)較強的指標(biāo)。我看到你的流式圖上,檢測樣本的熒光強度不是很強,屬于弱表達(dá)的指標(biāo),若用百分率統(tǒng)計,就是會失去一部分弱陽性的數(shù)據(jù)。我建議可以用平均熒光強度(也就是mean值)作為統(tǒng)計指標(biāo),比較熒光強度的變化。
⒗流式技術(shù)中的APC,pure 標(biāo)記是什么意思呢?
熒光物質(zhì)通常是指那些在受到一個波長激發(fā)后,處于一個能量不穩(wěn)定的狀態(tài),能發(fā)射一個波長比激發(fā)波長長的光的一類物質(zhì)。當(dāng)然熒光并不都是受激發(fā)后發(fā)射的,如一些生物可以發(fā)射熒光,如熒火蟲,發(fā)光細(xì)菌等,他們發(fā)出的光是通過體內(nèi)的酶促反應(yīng)而產(chǎn)生的,這個酶通常被稱為熒光素酶.EB是一種熒光物質(zhì),它在受到紫外線照射后可以發(fā)出一可見光,常用于DNA、RNA電泳中。
APC英文全名:allophycocyanin;中文名:別藻青蛋白;最大吸收峰:650nm,最大發(fā)射熒光峰:660nm,適用于雙激光流式儀,可被600-640nm波長的激光激發(fā)。
PerCP英文全名:peridinin chlorophyll protein,中文名:多甲藻葉綠素蛋白;最大激發(fā)波峰490nm,被488nm的氬離子激光激發(fā)后,發(fā)射光峰值約為677nm,與FITC、PE進(jìn)行多色熒光染色補償重疊較少,非特異性結(jié)合也較少。雖然較易使用,但量子產(chǎn)量不高,多用于檢測表達(dá)較高的抗原。
⒘怎樣用流式細(xì)胞儀來鑒定小鼠BMDC?
檢測小鼠BMDC主要是從形態(tài)學(xué)和細(xì)胞表面分子兩方面來鑒定我做的時候就做了普通光鏡下形態(tài)、電鏡(掃描和透射),另外檢測了小鼠BMDC表面的共刺激分子如CD86 、CD11、CD80。還做了MHC II類分子的檢測,還有MHCI類分子的檢測,這些分子在DC表面都不是特異存在的,在巨噬細(xì)胞、淋巴細(xì)胞表面也有表達(dá),所以目前并沒有非常特異性的方法檢測你的細(xì)胞一定就是DC,但是從形態(tài)和表面分子的檢測結(jié)合來看,效果就比較好了.一般在幼稚的DC上述分子表達(dá)水平較低,DC成熟過程中,上述分子表達(dá)呈上調(diào)趨勢,你可以在不同的培養(yǎng)時間分別檢測。
⒙血液里的mononuclear cell(除外紅細(xì)胞,血小板和破碎的細(xì)胞碎片),能不能用細(xì)胞大小來gating,只看我關(guān)心的細(xì)胞?
(1)紅細(xì)胞還是小一些,無法100%區(qū)分,但還是可用把大部分紅細(xì)胞gate掉。
(2)溶血也很重要,如果你的紅細(xì)胞多的話。(我猜不少,如果用ficol的話)?梢杂寐然@溶液,如ACK(Lonzo),
(3)CD45是所有白細(xì)胞都表達(dá)的,可以用來區(qū)分RBC vs. WBC
⒚FCM檢測表達(dá)結(jié)果到底是用百分比還是MFI。
我作出是單峰,原本我覺得用MFI表示較好。但我做的2個蛋白很奇怪,一個表達(dá)率高,但MFI值低;另一個表達(dá)率低,但MFI值高。我又作了SYBR GREEN 定量PCR,發(fā)現(xiàn)mRNA 的表達(dá)基本與百分比相符,而與MFI值不太一致。
個人認(rèn)為如果有明顯陰性細(xì)胞群和陽性細(xì)胞群,應(yīng)計算百分比;無明顯分群,僅熒光強度發(fā)生變化的應(yīng)該用MFI。如果是整體峰移(或者叫單峰),那么根本不存在MFI之外的任何合理的指標(biāo),不管MFI跟其它指標(biāo)吻合度如何,這就是客觀數(shù)據(jù)、客觀事實。
⒛流式檢測胞內(nèi)抗原時打孔液的配方?
打孔液有很多種,方法也有很多。與你的實驗方法相關(guān)。我用過酒精固定或Triton X-100(我做的都是培養(yǎng)的細(xì)胞):
(1)70%的酒精固定24小時即可,不再需要再打孔。如在PI染色測細(xì)胞周期或凋亡。
(2)Triton X-100是比較強烈的穿孔劑。0.1% Triton X-100/PBS(再加0.1%BSA) 是比較溫和一點。濃度可適當(dāng)提高。作用時間以幾分鐘為宜。這個時間必須要自己試。時間長了細(xì)胞易破裂,短了則打孔不夠。如果你要染胞漿,則時間適當(dāng)短些,如果要染內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或核內(nèi)等,由于要對兩層膜性結(jié)構(gòu)打孔,時間當(dāng)然會長一些
(3)可以試試0.1% saponin(皂素)
21.標(biāo)本必須在抗體染色后30分內(nèi)檢測嗎?
SOP是這么說的:
(1)Keep samples after staining covered with aluminum foil and at 4 0C (in the refrigerator) until they are run for flow analysis. The samples should be analyzed within 48 hours. Fluorescence loses its brightness if cells are not kept properly: not at 4 0C, or are exposed to light
(2)If cells are not fixed with paraformaldehyde, keep the samples on ice and run them immediately after staining is accomplished
因此,如果你沒有用PBS洗的話,可以用paraformaldehyde固定,放置48小時。洗了后應(yīng)該盡快檢測。如果做好不能及時檢測,我們一般是加入等量的2%的多聚甲醛固定,4度冰箱避光貯存。一般過夜沒有問題,第二天同樣PBS 2ml 洗滌細(xì)胞一次,上機(jī)檢測。
22.請問流式檢測膜蛋白表達(dá)的變化用多克隆抗體出結(jié)果的機(jī)會大嗎?
流式的抗體和WB的抗體是不同的(有部分可以通用),多抗一般是大的變性蛋白為抗原制備的,而WB的中被檢測蛋白就是變性狀態(tài),所以很吻合,而流失中一般蛋白還是保持了天然構(gòu)象,所以產(chǎn)生的多抗可能不太好,而需要用很小特定的決定簇為抗原制備單克隆抗體。
23.在下最近作人外周血流式,作表面及其胞內(nèi)染色,試劑說明書說要先分離外周血單個核細(xì)胞再染色,我有時候分的紅細(xì)胞比較多,其他的方法試過了,都改進(jìn)的不好,我擔(dān)心紅細(xì)胞會有影響,想在分離出PBMC以后如果紅細(xì)胞比較多的話,就用紅細(xì)胞裂解液裂解一下,但是我有如下問題,希望這樣做過的同志指點一下,感激不禁。
(1)有人這樣在分離PBMC以后再裂解的嗎(我知道一般是在全血染色后再裂解紅細(xì)胞)?
(2)這樣會影響流式檢測嗎?
(3)用的裂解液配方是什么(最好是自己用過的)。
(4)用法是什么{我是在如果PBMC分出來以后要是紅細(xì)胞比較多的時候使用,這樣要怎樣把分出的PBMC稀釋,加多少裂解液 裂解多長時間,裂解后洗滌幾次等等}。
我曾做骨髓液分離單個核細(xì)胞而后做流式,一般來說用Ficoll分過之后即便還有紅細(xì)胞殘留,上流式也可通過“設(shè)門”根據(jù)細(xì)胞形態(tài)大小將紅細(xì)胞剔除。若紅細(xì)胞殘留太多,則可通過紅細(xì)胞裂解液進(jìn)一步去除之。我用的裂解液配方是:
碳酸氫鉀(KHCO3) 1.0g
氯化氨(NH4CL) 8.3g
EDTA-Na2 0.037g 加雙H2O至1000ml,為工作液。
配好后4度冰箱保存,使用時效果更好。我是在Ficoll分過之后用的,所以一般根據(jù)離心后EP管里細(xì)胞團(tuán)的大小加紅細(xì)胞裂解液,通常5ml骨髓液分離單個核細(xì)胞后得到的細(xì)胞再加500ul裂解液,震蕩混勻置2-5分鐘紅細(xì)胞就基本上裂解干凈了。洗滌次數(shù)看白細(xì)胞多少而定,因為洗的次數(shù)越多,損失就越多。我一般洗一到兩次就OK了.做了很久沒發(fā)現(xiàn)這樣處理影響結(jié)果。有一點,我是在這樣處理后才標(biāo)記抗體的,樓上的說是標(biāo)記過才溶紅細(xì)胞,所以建議在溶的時候時間不宜過長,洗滌次數(shù)也不宜過多,以免將標(biāo)記上的單抗洗脫。
24.表中流式細(xì)胞儀給出的平均值是什么意思,是怎樣得到的,有些文獻(xiàn)中提到“fluorescence per cell”,是下面的mean值嗎,還是要用mean值除以第1欄的細(xì)胞數(shù)events,才能得到fluorescence per cell ?
mean 值就是每個細(xì)胞的平均熒光強度,不用再除細(xì)胞數(shù)。這只是個相對值,如果求絕對值,應(yīng)用已知熒光劑濃度值對應(yīng)儀器給出的mean值,做標(biāo)準(zhǔn)曲線。以后你得到的mean值,就可以根據(jù)這條標(biāo)準(zhǔn)曲線查出真正的熒光濃度值。
25.運用間接法流式細(xì)胞術(shù),剛買了熒光二抗,是KPL的fluorescein-labeled affinity purified antibody to mouse IgG+IgM(H+L) produced in goat .說明說上提示要用TBS或是BSA或milk diluent/blocking solution液稀釋。稀釋至1:10~1:100。請問BSA是不是小牛血清,要用多少濃度的。TBS液我沒有,還有可否用注射用水稀釋。
BSA:牛血清白蛋白,濃度可以在一定范圍內(nèi)1%~5%,具體可參考其他抗體說明書。
TBS:Tris buffer saline。就是Tris的鹽溶液,很常規(guī)的溶液,配方:20mM Tris-HCl(ph8.0),150mM NaCl。
你說的注射用水應(yīng)該就是生理鹽水吧,這對抗體來說是不利的,雖然在基礎(chǔ)條件很差的情況下會用這個溶液,但是還不如PBS溶液。既然是做流式,按照正規(guī)程序操作抗體,得到的結(jié)果也最能反映真實情況。
26.流式細(xì)胞檢測中怎樣把對照和樣本的檢測結(jié)果放在一張圖中?
分析獲取數(shù)據(jù)是分開進(jìn)行的,不可以混在一起上樣。首先通過陰性對照調(diào)節(jié)基本電壓,固定條件后進(jìn)行樣品檢測,分別保存結(jié)果。利用流式軟件的multigraph中的overlap可以將陰性對照和樣品結(jié)果相應(yīng)圖進(jìn)行疊加,這只是獲取數(shù)據(jù)后對結(jié)果的組合和加工。
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