如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的網(wǎng)站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數(shù)據(jù)庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。
一．根據(jù)LncRNA來源數(shù)據(jù)庫，進入相應(yīng)鏈接。
1. Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2. Ensembl：http://asia.ensembl.org/index.html
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
二．根據(jù)“gene_id”查看LncRNA在所屬數(shù)據(jù)庫的ID號。
1. Genbank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點擊search。假設(shè)gene_id為AK009210。
點擊FASTA鍵，復(fù)制獲取序列。
2. Ensmbl：http://asia.ensembl.org/index.html
選擇物種類別，詳見Report-Sequence_Results-Supplementary（可選項）。紅框內(nèi)輸入gene_id號，點擊GO。假設(shè)gene_id為ENSMUSG00000099021。
轉(zhuǎn)到Genbank，復(fù)制獲取序列。
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點擊search。假設(shè)gene_id為C630043F03Rik。
點擊FASTA，獲取序列信息。
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
Genomes下拉菜單選擇參考基因組，一般人類選擇hg19，鼠選擇mm10。
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點擊search。假設(shè)gene_id為Ivns1abp，點擊go。
點擊下圖的紅框。
點擊下圖的紅框。
選擇mRNA，復(fù)制獲取序列信息。
云序相關(guān)產(chǎn)品推薦：
m6A RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
m5C RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
m1A RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
超微量RNA甲基化測序
比色法檢測整體甲基化水平
RIP
RNA Pull Down
Me-DIP測序
往期精彩回顧：
看表觀新修飾-6mA如何助力IF飆升!
10分以上m6A RNA甲基化測序文章----云序生物助力
不得了，大牛告訴你lncRNA甲基化如何研究
RNA甲基化進入超微量時代
小白必看！RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
20分文章中的RNA甲基化，熱度與實力并存
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
云序生物最新“RNA 甲基化”研究匯總-擬南芥篇
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇
Plant Cell：擬南芥發(fā)現(xiàn)全新m6A RNA去甲基化修飾酶
云序客戶12分頂級文章，教你如何巧用RIP測序玩轉(zhuǎn)分子機制！
2018年Nature雜志重磅級突破性研究成果--m5C RNA甲基化 云序生物
Nature突破性研究—RNA甲基化新修飾m1A 云序生物
Hepatology：m6A RNA甲基化酶METTL3促肝癌發(fā)展新玄機
上海云序生物科技有限公司
Shanghai Cloud-seq Biotech Co., Ltd.
地址：上海市松江區(qū)莘磚公路518號20號樓3樓
電話：021-64878766
傳真：021-64878766
網(wǎng)址：www.cloud-seq.com.cn
郵箱：market@cloud-seq.com.cn
一．根據(jù)LncRNA來源數(shù)據(jù)庫，進入相應(yīng)鏈接。
1. Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2. Ensembl：http://asia.ensembl.org/index.html
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
二．根據(jù)“gene_id”查看LncRNA在所屬數(shù)據(jù)庫的ID號。
1. Genbank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點擊search。假設(shè)gene_id為AK009210。
點擊FASTA鍵，復(fù)制獲取序列。
2. Ensmbl：http://asia.ensembl.org/index.html
選擇物種類別，詳見Report-Sequence_Results-Supplementary（可選項）。紅框內(nèi)輸入gene_id號，點擊GO。假設(shè)gene_id為ENSMUSG00000099021。
轉(zhuǎn)到Genbank，復(fù)制獲取序列。
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點擊search。假設(shè)gene_id為C630043F03Rik。
點擊FASTA，獲取序列信息。
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
Genomes下拉菜單選擇參考基因組，一般人類選擇hg19，鼠選擇mm10。
紅框內(nèi)輸入gene_id號，點擊search。假設(shè)gene_id為Ivns1abp，點擊go。
點擊下圖的紅框。
點擊下圖的紅框。
選擇mRNA，復(fù)制獲取序列信息。
云序相關(guān)產(chǎn)品推薦：
m6A RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
m5C RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
m1A RNA全轉(zhuǎn)錄組甲基化測序
超微量RNA甲基化測序
比色法檢測整體甲基化水平
RIP
RNA Pull Down
Me-DIP測序
往期精彩回顧：
看表觀新修飾-6mA如何助力IF飆升!
10分以上m6A RNA甲基化測序文章----云序生物助力
不得了，大牛告訴你lncRNA甲基化如何研究
RNA甲基化進入超微量時代
小白必看！RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
20分文章中的RNA甲基化，熱度與實力并存
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
云序生物最新“RNA 甲基化”研究匯總-擬南芥篇
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇
Plant Cell：擬南芥發(fā)現(xiàn)全新m6A RNA去甲基化修飾酶
云序客戶12分頂級文章，教你如何巧用RIP測序玩轉(zhuǎn)分子機制！
2018年Nature雜志重磅級突破性研究成果--m5C RNA甲基化 云序生物
Nature突破性研究—RNA甲基化新修飾m1A 云序生物
Hepatology：m6A RNA甲基化酶METTL3促肝癌發(fā)展新玄機
上海云序生物科技有限公司
Shanghai Cloud-seq Biotech Co., Ltd.
地址：上海市松江區(qū)莘磚公路518號20號樓3樓
電話：021-64878766
傳真：021-64878766
網(wǎng)址：www.cloud-seq.com.cn
郵箱：market@cloud-seq.com.cn
- 空間和單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)綜合分析揭示與不良預(yù)后相關(guān)的中間癌細胞群
- 單細胞測序助力揭示右心室容量超荷會通過免疫反應(yīng)重啟心肌細胞的增殖
- BS+ChIP-seq在揭示DNA甲基化調(diào)控非編碼RNA抑制腫瘤侵襲性中的應(yīng)用
- 靶基因甲基化測序(Target-BS)等在揭示特應(yīng)性皮炎新發(fā)現(xiàn)中的應(yīng)用
- ChIP等揭示糖皮質(zhì)激素和TET2共調(diào)控促進癌癥轉(zhuǎn)移的表觀遺傳機制
- 游離細胞DNA（cfDNA）檢測整體研究方案及其應(yīng)用案例
- DNA甲基化修飾整體研究方案技術(shù)介紹及經(jīng)典案例分析
- DNA甲基化詳解
Copyright(C) 1998-2024 生物器材網(wǎng) 電話：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com