焦磷酸測序技術(shù)原理及應(yīng)用
瀏覽次數(shù):13858 發(fā)布日期:2018-11-20
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焦磷酸測序(Pyrosequencing)技術(shù)
焦磷酸測序技術(shù)(pyrosequencing)是由Nyren等人于1987年發(fā)展起來的一種新型的酶聯(lián)級聯(lián)測序技術(shù),焦磷酸測序法適于對已知的短序列的測序分析,其可重復(fù)性和精確性能與SangerDNA測序法相媲美,而速度卻大大的提高。焦磷酸測序技術(shù)產(chǎn)品具備同時(shí)對大量樣品進(jìn)行測序分析的能力,為大通量、低成本、適時(shí)、快速、直觀地進(jìn)行DNA甲基化、SNP等單個(gè)/連續(xù)多個(gè)核苷酸變異進(jìn)行實(shí)時(shí)定量檢測提供了非常理想的技術(shù)操作平臺(tái)。
一. 焦磷酸測序技術(shù)原理
焦磷酸測序技術(shù)是由4種酶催化的同一反應(yīng)體系中的酶級聯(lián)化學(xué)發(fā)光反應(yīng)。焦磷酸測序技術(shù)的原理是:引物與模板DNA退火后,在DNA聚合酶(DNA polymerase)、ATP硫酸化酶(ATP sulfurytase).熒光素酶(1uciferase)和三磷酸腺苷雙磷酸酶(Apyrase)4種酶的協(xié)同作用下,將引物上每一個(gè)dNTP的聚合與一次熒光信號的釋放偶聯(lián)起來,通過檢測熒光的釋放和強(qiáng)度,達(dá)到實(shí)時(shí)測定DNA序列的目的。焦磷酸測序技術(shù)的反應(yīng)體系由反應(yīng)底物、待測單鏈、測序引物和4種酶構(gòu)成。反應(yīng)底物為5’-磷酰硫酸(adenosine- 5’-phosphosulfat,APS)、熒光素(1uciferin)。
1.每次加入一個(gè)dNTP, 在聚合酶作用下產(chǎn)生一個(gè)焦磷酸(PPi);
2. 硫酸化酶轉(zhuǎn)化PPi為ATP,ATP使熒光素酶發(fā)出熒光(產(chǎn)生的光強(qiáng)度與結(jié)合的核苷數(shù)量成正比).
3. 多余的dNTP被降解,開始新一個(gè)循環(huán).
4. 測序結(jié)果
QIAGEN公司PyroMark Q24,PyroMark Q48 Autoprep,PyroMark Q96 ID焦磷酸測序儀
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