基因改造(包括敲除和敲進(jìn))小鼠已經(jīng)成為現(xiàn)代生命科學(xué)基礎(chǔ)研究和藥物研發(fā)領(lǐng)域不可或缺的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型,在生命科學(xué)、人類醫(yī)藥和健康研究領(lǐng)域中發(fā)揮著重要的作用。今天呢,就給大家介紹最傳統(tǒng)最穩(wěn)定的基因改造技術(shù):基于胚胎干細(xì)胞的同源重組技術(shù)。
Capecchi和Smithies早在在1989年根據(jù)同源重組(homologous recombination)的原理,首次實(shí)現(xiàn)了ES的外源基因的定點(diǎn)整合(targeted integration),即基因打靶(gene targeting),如果用外源抗性基因?qū)⒒蛏系囊欢沃匾蛄刑鎿Q掉,就成功將目的基因?qū)崿F(xiàn)了基因敲除(gene knockout),利用這種ES的顯微注射就可以制作出基因敲出小鼠(KO Mice: knockout mice);由于這一工作,Capecchi和Smithies于2007年與Evans分享了諾貝爾醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。
圖片來(lái)源[1]
是不是感覺很高級(jí)?那么,問題來(lái)了:到底什么是同源重組呢?
首先,我們先了解一下什么是同源重組技術(shù):
同源重組(homologous recombination):是指發(fā)生在姐妹染色單體(sister chromatin) 之間或同一染色體上含有同源序列的DNA分子之間或分子之內(nèi)的重新組合。在基因改造小鼠制作過程中,需要針對(duì)目的基因兩端特異性片段設(shè)計(jì)帶有相同片段的重組載體,將重組載體導(dǎo)入到胚胎干細(xì)胞后外源的重組載體與胚胎干細(xì)胞中相同的片段會(huì)發(fā)生同源重組,簡(jiǎn)言之,就是把想改造的部分各制備一段一模一樣的DNA序列(同源臂),然后同源臂之內(nèi)的部分就會(huì)被替換掉了,如圖1所示:
圖1. 基因敲除鼠制作同源重組原理示意圖[2]
了解同源重組技術(shù)的原理,那基于該原理,如何制備出基因改造小鼠呢?接下來(lái)我們以基因敲除為例,為大家詳細(xì)介紹一下基因敲除小鼠的制備流程:
圖2. 基因敲除小鼠制備過程示意圖[3]
01 打靶載體設(shè)計(jì)與構(gòu)建
首先,第一步,要進(jìn)行打靶載體的設(shè)計(jì)及構(gòu)建。是將目的基因、與細(xì)胞內(nèi)靶基因特異片段同源的DNA 片段,都重組到帶有標(biāo)記基因(如neoR 基因,TK 基因等)的載體上,成為重組載體。簡(jiǎn)言之,就是把一個(gè)抗性基因插入到同源臂的兩端,利用“同源重組”把同源臂中的抗性基因替換到基因組對(duì)應(yīng)同源臂中去。
同源臂內(nèi)的抗性基因(我們一般用新霉素抗性基因,即有G418抗性,又名NeoR),我們一般叫“正篩選標(biāo)記”,打靶載體同源臂外部分我們也會(huì)加入一個(gè)致死基因,叫“負(fù)篩選標(biāo)記”。這兩個(gè)篩選標(biāo)記是干什么用的呢?這里我們先賣個(gè)關(guān)子,稍后再做詳解~
圖3. 原理圖[4]
02 電轉(zhuǎn)導(dǎo)入打靶載體
打靶載體制備完成后,將重組載體通過電轉(zhuǎn)的方法,導(dǎo)入同源的小鼠胚胎干細(xì)胞(EScell)中,使外源DNA與胚胎干細(xì)胞基因組中相應(yīng)部分發(fā)生同源重組,用G418篩選轉(zhuǎn)染后的胚胎干細(xì)胞,得到陽(yáng)性克隆 。
03 ES細(xì)胞篩選
由于基因轉(zhuǎn)移的同源重組自然發(fā)生率極低,動(dòng)物的重組概率為10-2~10-5,植物的概率為10-4~10-5。
那么,既然同源重組率這么低,如何確保篩到正確重組的陽(yáng)性克隆呢?
還記得我們上文提到的打靶載體上的“正篩選標(biāo)記”和“負(fù)篩選標(biāo)記”吧?替換目的基因(或重要區(qū)域)的同時(shí),插入一個(gè)抗性基因,即“正篩選標(biāo)記”,可以確保得到ES細(xì)胞克隆中已經(jīng)進(jìn)行了重組;在打靶載體上同源臂外插入一個(gè)致死基因,即“負(fù)篩選標(biāo)記”,可以防止打靶載體隨機(jī)插入造成的假陽(yáng)性。正負(fù)篩選標(biāo)記綜合起來(lái),基本上可以確保拿到的ES克隆是打靶載體兩端通過同源重組插入的了,是不是很聰明呢?
當(dāng)然即使通過正負(fù)篩選標(biāo)記,得到的陽(yáng)性克隆仍然有可能跟理想的插入有個(gè)別堿基或片段的出入,因此就需要進(jìn)一步通過基因組PCR并測(cè)序和southern blot雜交技術(shù)(基因敲除小鼠檢測(cè)金標(biāo)準(zhǔn))對(duì)上一步得到的陽(yáng)性克隆進(jìn)行篩選,最終得到穩(wěn)定整合外源基因的胚胎干細(xì)胞陽(yáng)性克隆,然后,將陽(yáng)性克隆擴(kuò)大培養(yǎng)并液氮保存。
圖4. 挑選出正確重組的ES細(xì)胞克隆是獲得正確陽(yáng)性小鼠的關(guān)鍵步驟[5]
04 ES細(xì)胞囊胚注射得到嵌合體小鼠
經(jīng)歷千辛萬(wàn)苦以后,我們終于得到了正確重組的ES細(xì)胞陽(yáng)性克。
下面就是要將ES陽(yáng)性克隆以囊胚顯微注射的方式將注入特定品系小鼠囊胚中,然后將囊胚移植到代孕的小鼠子宮中。等待后代小鼠出生后,我們就可以通過觀察小鼠的毛色比例(通常我們選用的ES細(xì)胞是黑色C57BL/6小鼠背景,而囊胚供體是白色balb/c背景),來(lái)判斷嵌合程度的高低,以及該小鼠的后代中可能獲得生殖系傳遞能力。
05 得到嵌合鼠,并獲得F1陽(yáng)性雜合子小鼠
將嵌合體小鼠與適當(dāng)品系的小鼠交配,后代小鼠出生后,通過PCR方式來(lái)檢測(cè)小鼠是否含有打靶序列。如有,則該小鼠就是具備生殖遺傳能力的F1代鼠了哦!
經(jīng)過這一番介紹,大家對(duì)基于胚胎干細(xì)胞的同源重組技術(shù)是不是有了初步了解了呢?
百奧賽圖是國(guó)內(nèi)最早使用近交系C57BL/6胚胎干細(xì)胞進(jìn)行基因打靶,并且承諾實(shí)驗(yàn)失敗全額退款的公司,我們自信,在基因改造小鼠方面,我們很專業(yè)!
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參考資料:
[1]https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/2007/summary/
[2] Jun.,2006 Vol.14 No.2中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào)
[3] https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/2007/press-release/
[4] Jun., 2006 Vol.14 No.2中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào)
[5] http://orthodoxnet.com/blog/2011/06/to-be-or-not-to-be-created/
百奧賽圖
百奧賽圖基因生物技術(shù)有限公司(簡(jiǎn)稱“百奧賽圖”),公司總部現(xiàn)位于北京亦莊,在上海張江、江蘇海門、美國(guó)波士頓設(shè)有分公司,同時(shí)在武漢、廣州、成都等地設(shè)有辦事處。
2008年在美國(guó)成立并成功運(yùn)營(yíng),2009年北京百奧賽圖總公司成立,并于2012年將總部遷址到北京亦莊經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)。
百奧賽圖是一家以穩(wěn)定、高效基因編輯技術(shù)平臺(tái)為依托,以模式動(dòng)物定制服務(wù)、重要模式動(dòng)物開發(fā)與規(guī);敝撑c供應(yīng)、體內(nèi)藥理藥效評(píng)價(jià)服務(wù)、抗體藥物研發(fā)外包服務(wù)為一體的高科技生物醫(yī)藥企業(yè)。
公司秉承以追求更好的人類健康為宗旨,旨在為新藥研發(fā)領(lǐng)域提供高品質(zhì)的產(chǎn)品與服務(wù)。
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