南模生物為該研究構(gòu)建了超過15種小鼠模型。
待解決問題:如何排它性地分別標(biāo)記非肌肉細(xì)胞和心肌細(xì)胞?
解決方法:
利用DeaLT 雙同源重組示蹤報告基因系統(tǒng)(Dual-recombinase-activated lineage tracing)將 Dre-rox 重組系統(tǒng)與傳統(tǒng)的 Cre-loxP 重組系統(tǒng)結(jié)合起來,交錯的 loxP 和 rox 位點可以在 Cre-loxP 或 Dre-rox 重組后切除另一套重組系統(tǒng),在可能引起重組酶異位表達(dá)的細(xì)胞中將另一套重組酶的識別位點切除掉,從而有效地阻止異位重組,使細(xì)胞排它性地被標(biāo)記上 ZsGreen 或 tdTomato 熒光,增加譜系示蹤結(jié)果的準(zhǔn)確性。
根據(jù) loxP 和 rox 的位置順序不同,分為 IR 和 NR 兩種報告基因系統(tǒng)。
方案一:IR
先用心肌細(xì)胞Marker的Dre使心肌細(xì)胞被標(biāo)記上tdTomato紅色熒光;
再用誘導(dǎo)型Cre,在藥物誘導(dǎo)后表達(dá)Cre重組酶,將除了心肌細(xì)胞以外的所有非心肌細(xì)胞都永久標(biāo)記上ZsGreen綠色熒光;
如果非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞轉(zhuǎn)化,那么由非肌細(xì)胞轉(zhuǎn)化而成的新生心肌細(xì)胞將是ZsGreen綠色熒光標(biāo)記的。所以只需要在心肌再生過程中尋找是否有帶綠色熒光的心肌細(xì)胞即可。
方案二:NR
首先心肌細(xì)胞Marker的Dre和廣泛型表達(dá)的Cre將細(xì)胞分為兩類,一類是表達(dá)tdTomato紅色熒光的肌細(xì)胞,一類是表達(dá)ZsGreen綠色熒光的非肌細(xì)胞;
如果發(fā)生非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞的命運轉(zhuǎn)化,那么在新肌細(xì)胞生成過程中,心肌細(xì)胞Marker的Dre會介導(dǎo)原來綠色熒光標(biāo)記的細(xì)胞被標(biāo)記上tdTomato紅色熒光,因此會同時存在綠色和紅色兩種標(biāo)記均陽性的新生肌細(xì)胞,產(chǎn)生黃色熒光信號。
心臟作為脊椎動物最重要的器官之一,主要功能是為血液流動提供動力。心臟發(fā)生心肌梗塞后造成心肌細(xì)胞大量死亡,心臟功能受到影響。成體心臟是否存在心肌干細(xì)胞一直存在爭論,之前的研究利用傳統(tǒng)的遺傳譜系示蹤技術(shù)認(rèn)為在成體心臟中存在心肌干細(xì)胞,例如Kit+心肌干細(xì)胞、Bmi1+心肌干細(xì)胞、Scal1+心肌干細(xì)胞、Islet+心肌干細(xì)胞等,但由于這些心肌干細(xì)胞的分子標(biāo)記本身就表達(dá)于部分心肌細(xì)胞中,因此這些假設(shè)的心肌干細(xì)胞向心肌細(xì)胞的分化潛能仍受到質(zhì)疑。
在最新的這篇研究成果中,研究人員利用雙同源重組技術(shù)同時對肌肉細(xì)胞和非肌肉細(xì)胞進(jìn)行譜系示蹤,系統(tǒng)揭示非肌肉細(xì)胞向肌肉細(xì)胞分化的潛能.
為了明確非肌肉細(xì)胞中是否存在假定的心臟干細(xì)胞CSC,研究人員設(shè)計了標(biāo)記所有非肌肉細(xì)胞譜系的新系統(tǒng)。利用DeaLT-IR1報告基因小鼠(見下圖),交錯的loxP和rox位點可以在Cre-loxP或Dre-rox重組后切除另一套重組系統(tǒng),從而使細(xì)胞排它性地被標(biāo)記上ZsGreen或tdTomato熒光。
如何利用該系統(tǒng)來分別標(biāo)記肌細(xì)胞和非肌細(xì)胞呢?需要將 Tnnt2-Dre(Tnnt2是心肌細(xì)胞Marker)、R26-iCre(由R26-rtTA與TRECre交配獲得,可在強(qiáng)力霉素 Dox 誘導(dǎo)下表達(dá) Cre)和 IR1報告基因小鼠3種小鼠交配在一起,獲得 Tnnt2-Dre; R26-iCre; IR1小鼠:Tnnt2-Dre首先標(biāo)記表達(dá)Dre的肌細(xì)胞;并且在強(qiáng)力霉素(Dox)處理后,R26-iCre 標(biāo)記除肌細(xì)胞外的所有細(xì)胞(圖1A,B)。該雙同源重組系統(tǒng)中用tdTomato來標(biāo)記肌細(xì)胞、用ZsGreen來標(biāo)記非肌細(xì)胞。
圖1. A-B
首先,用這套系統(tǒng)研究在胚胎心臟中非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化。在胚胎心臟發(fā)育早期,Isl1+的心肌干細(xì)胞可以貢獻(xiàn)第二心區(qū)的心肌細(xì)胞,例如,心臟的流出道,右心室部分的心肌細(xì)胞,以及左心室和心房非常少量的心肌細(xì)胞均來自于Isl1+的心肌干細(xì)胞(圖1C)。Isl1-CreER;R26-tdTomato小鼠在E8.0天給予他莫昔芬誘導(dǎo),在E13.5天右心室被標(biāo)記上紅色熒光(圖1D)。
圖1. C-D
Tnnt2-Dre; R26-iCre; IR1小鼠在E8.0天給予Dox誘導(dǎo)標(biāo)記非肌細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)在E8.5天時在其他組織中被標(biāo)記上ZsGreen綠色熒光,心肌為紅色熒光標(biāo)記(圖1E)。接下來收集E13.5天的心臟組織,發(fā)現(xiàn)dTomato、ZsGreen和TNNI3(肌細(xì)胞marker)的免疫染色顯示E13.5天右心室中的大多數(shù)肌細(xì)胞是被ZsGreen綠色熒光標(biāo)記的,說明在胚胎心臟發(fā)育早期,非心肌細(xì)胞具有分化形成心肌細(xì)胞的能力,這些非心胞可以貢獻(xiàn)形成第二心區(qū)的心肌細(xì)胞(圖1F),證明了新的示蹤系統(tǒng)可以有效檢測發(fā)育中的心臟非肌細(xì)胞向心肌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化。
圖1. E-F
策略1 Tnnt2-Dre;R26-iCre;IR1 非肌細(xì)胞對成體心臟中的肌細(xì)胞沒有貢獻(xiàn)
使用Tnnt2-Dre;R26-iCre;IR1小鼠來同時追蹤成體心臟中的心肌細(xì)胞和非心肌細(xì)胞。tdTomato、ZsGreen和TNNI3的免疫染色顯示tdTomato+細(xì)胞是TNNI3+心肌細(xì)胞,而ZsGreen+細(xì)胞不是TNNI3+心肌細(xì)胞(圖1G)。 分離Tnnt2-Dre; R26-iCre; IR1的心肌細(xì)胞進(jìn)行體外觀察也沒有檢測到ZsGreen+心肌細(xì)胞(圖1H)。 因此,Tnnt2-Dre;R26-iCre;IR1系統(tǒng)用兩種不同的熒光標(biāo)記了肌細(xì)胞和非肌細(xì)胞(圖1I)。
圖1.G-I
非肌細(xì)胞在成體心臟中是否會分化成肌細(xì)胞呢?如果是,那么源自非肌細(xì)胞的新心肌細(xì)胞將是ZsGreen+的。而實驗結(jié)果是:在Dox誘導(dǎo)后,對Tnnt2-Dre; R26-iCre; IR1小鼠進(jìn)行結(jié)扎左前降支冠狀動脈誘導(dǎo)MI造模(圖2A)。心肌梗塞后,造成心肌細(xì)胞大量死亡,心臟功能受損,在損傷后2-4周,對心臟切片進(jìn)行ZsGreen、tdTomato和TNNI3免疫染色,結(jié)果沒有發(fā)現(xiàn)ZsGreen+TNNI3+的心肌細(xì)胞(圖2B)。在5個心梗組織的600多個切片中,都沒有檢測到ZsGreen+tdTomato-心肌細(xì)胞。流式細(xì)胞分析(圖2D)和熒光顯微鏡(圖2E)也證實在Tnnt2-Dre;R26-iCre;IR1小鼠的MI造模后的心臟中也沒有觀察到ZsGreen+心肌細(xì)胞。RT-PCR結(jié)果也只有tdTomato的表達(dá),沒有ZsGreen的mRNA表達(dá)(n=5,圖2F)。這些數(shù)據(jù)表明,非心肌細(xì)胞在成體心臟的心臟損傷后對肌細(xì)胞沒有貢獻(xiàn)。
圖2. A-F
平行地,將骨骼肌損傷后骨骼肌中非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞的細(xì)胞命運轉(zhuǎn)化作為陽性對照。骨骼肌在穩(wěn)態(tài)維持過程中,肌纖維細(xì)胞與非肌肉細(xì)胞發(fā)生融合,肌纖維細(xì)胞處于多核狀態(tài),因此在正常骨骼。偈中g(shù)組)中,可以檢測到tdTomato+ ZsGreen+肌細(xì)胞(圖2G)。而當(dāng)對Tnnt2-Dre;R26-iCre;IR1小鼠的脛骨前肌(TA。⿲嵤〣aCl2損傷后,骨骼肌中肌纖維細(xì)胞大量死亡,TA肌損傷后可以檢測到弱tdTomato熒光信號和強(qiáng)ZsGreen表達(dá),表明在BaCl2造模后ZsGreen+細(xì)胞逐漸取代tdTomato+細(xì)胞(圖2G)。與假手術(shù)組相比,在受損TA肌中可以檢測到ZsGreen+tdTomato-肌細(xì)胞(箭頭,圖2G),說明非肌細(xì)胞重新形成肌細(xì)胞。
圖2. G
綜合上述結(jié)果,通過Tnnt2-Dre;R26-iCre;IR1(策略1)的雙同源重組譜系示蹤技術(shù)揭示了在胚胎心臟和成體骨骼肌中非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化,但在成體心臟中非肌細(xì)胞對肌細(xì)胞沒有貢獻(xiàn)。
策略2 Tnnt2-Cre;R26-DreER;IR3 反向Cre/Dre 系統(tǒng)在非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞轉(zhuǎn)化研究中標(biāo)記兩種細(xì)胞
設(shè)計第2個雙同源重組譜系示蹤系統(tǒng)用來驗證非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化。該系統(tǒng)由Tnnt2-Cre(肌細(xì)胞中表達(dá)Cre)、他莫昔芬誘導(dǎo)型 R26-DreER 和IR3報告小鼠組成。利用IR3報告小鼠(見下圖)可排它性地將非肌細(xì)胞標(biāo)記上tdTomato紅色熒光,將肌細(xì)胞特異性地標(biāo)記上ZsGreen綠色熒光。
Tnnt2-Cre;R26-DreER;IR3小鼠就可以同時標(biāo)記肌細(xì)胞(ZsGreen+)和非肌細(xì)胞(tdTomato+)(圖3A)。
圖3. A
胚胎E8.0天心臟中ZsGreen主要標(biāo)記原始心管(圖3B)。E8.0天給予他莫昔芬誘導(dǎo),在E13.5天的右心室中發(fā)現(xiàn)tdTomato+非肌細(xì)胞對肌細(xì)胞有顯著貢獻(xiàn)(圖3C)。心臟切片免疫染色也證實了此結(jié)果(圖3D-F)。
同樣,在成體心臟和骨骼肌中,通過MI和BaCl2造模來觀察非心肌細(xì)胞的命運轉(zhuǎn)化(圖3G)。分離的心肌細(xì)胞的流式細(xì)胞分析(圖3H)和熒光顯微鏡(圖3I)分別結(jié)果也都顯示沒有tdTomato+心肌細(xì)胞。在形態(tài)上,這些tdTomato+細(xì)胞與ZsGreen+心肌細(xì)胞也明顯不同(圖3J)。
tdTomato和TNNI3免疫染色顯示這些tdTomato+細(xì)胞在MI心臟的梗塞區(qū)、邊界區(qū)和遠(yuǎn)端區(qū)均不會轉(zhuǎn)化為TNNI3+心肌細(xì)胞(圖3K)。來自5個Tnnt2-Cre;R26-DreER;IR3小鼠心臟的超過600個組織切片中均未檢測到tdTomato+TNNI3+心肌細(xì)胞。RT-PCR結(jié)果也同樣指出分離的心肌細(xì)胞只表達(dá)ZsGreen,不表達(dá)tdTomato(圖3L)。
相反,在陽性對照實驗中,TA肌損傷模型中他莫昔芬誘導(dǎo)后可以很容易地檢測到tdTomato+ZsGreen-肌細(xì)胞(箭頭,圖3M),而假手術(shù)組沒有。
圖3.
綜合上述結(jié)果,第2種策略使用Tnnt2-Cre;R26-DreER;IR3也顯示出與策略1一致的結(jié)果:非心肌細(xì)胞在胚胎心臟和成體骨骼肌中轉(zhuǎn)化為肌細(xì)胞,但在成體心臟中對肌細(xì)胞沒有貢獻(xiàn)。
策略3 Tnni3-Dre;R26-iCre;IR1
為了進(jìn)一步驗證上述發(fā)現(xiàn),使用另一種肌細(xì)胞Marker——TNNI3來驅(qū)動Dre重組酶。 Tnni3-Dre在成體心臟中有效且特異性標(biāo)記肌細(xì)胞,但不標(biāo)記非肌細(xì)胞。利用Tnni3-Dre;R26-iCre;IR1小鼠,分別標(biāo)記肌細(xì)胞和非肌細(xì)胞(圖4A)。
圖4. A
通過ZsGreen、tdTomato和不同心臟細(xì)胞譜系marker的免疫染色顯示肌細(xì)胞表達(dá)tdTomato、非肌細(xì)胞(例如內(nèi)皮細(xì)胞、成纖維細(xì)胞等)表達(dá)ZsGreen(補(bǔ)充材料)。不給予Dox誘導(dǎo)的情況下,在Tnni3-Dre;R26-iCre;IR1小鼠中未觀察到ZsGreen+細(xì)胞組織(圖4B)。
給予Dox后兩周,進(jìn)行MI或BaCl2注射(圖4C),結(jié)果發(fā)現(xiàn)在假手術(shù)的心臟中,Dox誘導(dǎo)后使tdTomato+心臟細(xì)胞也被標(biāo)記上ZsGreen綠色熒光(圖4D)。tdTomato、ZsGreen和TNNI3的免疫染色顯示所有心肌細(xì)胞均為tdTomato+ZsGreen-(圖4E)。MI造模后,梗塞的心臟組織中tdTomato+肌細(xì)胞數(shù)量明顯減少,被ZsGreen+非肌細(xì)胞替代(圖4F)。
分離MI造模后的心肌細(xì)胞體外觀察均為tdTomato+ZsGreen-細(xì)胞(圖4G)。 tdTomato、ZsGreen和TNNI3免疫染色顯示ZsGreen+細(xì)胞在損傷后并沒有轉(zhuǎn)向心肌細(xì)胞命運(圖4H,I)。通過分流式細(xì)胞分析和RT-PCR沒有檢測到MI心臟中有任何ZsGreen+tdTomato-肌細(xì)胞(圖4J,K)。
相反,在陽性對照實驗中,在損傷的TA肌肉中可以檢測到ZsGreen+tdTomato-肌細(xì)胞(箭頭,圖4L),表明非肌細(xì)胞新生為肌細(xì)胞。
圖4.
所以,基于Tnni3-Dre;R26-iCre;IR1的第3種模型也揭示了在成體心臟中非肌細(xì)胞并不轉(zhuǎn)化為肌細(xì)胞。
策略4 Tnnt2-Dre;Actb-Cre;NR1 通過NR1系統(tǒng)研究非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化
雖然利用廣泛型啟動子驅(qū)動的可誘導(dǎo)Cre或Dre可以有效標(biāo)記大多數(shù)非肌細(xì)胞,但實際上標(biāo)記效率并未達(dá)到100%。少數(shù)未標(biāo)記的非肌細(xì)胞在損傷后在成體心臟中產(chǎn)生新的肌細(xì)胞也仍舊是有可能的,雖然可能性并不大,因為在譜系示蹤期間的標(biāo)記過程是完全隨機(jī)的。為了達(dá)到100%的非肌細(xì)胞標(biāo)記效率,利用NR報告基因小鼠(見下圖),設(shè)計了第4種策略。
在這個系統(tǒng)中,ZsGreen標(biāo)記小鼠所有的細(xì)胞,除了被tdTomato標(biāo)記的新形成的肌細(xì)胞。Actb-Cre-loxP重組之后NR1小鼠中的所有細(xì)胞首先被標(biāo)記為ZsGreen綠色熒光,只有新的肌細(xì)胞在形成時由于第二個Tnnt2-Dre-rox的重組而開啟tdTomato紅色熒光的標(biāo)記(圖5A)。綠色熒光蛋白在哺乳動物細(xì)胞中有12-24小時的半衰期,所以盡管肌細(xì)胞中的Dre-rox重組會導(dǎo)致tdTomato表達(dá),但ZsGreen蛋白在降解前仍有穩(wěn)定的標(biāo)記時間。因此可以在非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞轉(zhuǎn)化期間檢測到雙陽性細(xì)胞。
圖5. A
首先分析之前實驗中的胚胎心臟(圖5B)來測試這個系統(tǒng)。很容易在E8.5天發(fā)育的心臟流出道中檢測到tdTomato+ZsGreen+肌細(xì)胞(箭頭,圖5C),這與以前的研究結(jié)果一致,表明第二心區(qū)祖細(xì)胞在這個階段分化成心肌細(xì)胞。
然后,在MI造模28天期間每12小時間隔收集小鼠心臟樣本進(jìn)行分析(圖5B)。對于ZsGreen、tdTomato和TNNI3免疫染色,結(jié)果顯示在梗塞心肌中沒有ZsGreen+tdTomato+肌細(xì)胞(圖5D)。所有56個時間點的Tnnt2-Dre;Actb-Cre;NR1小鼠心臟樣本,超過6000個心臟切片中未檢測到任何ZsGreen+tdTomato+肌細(xì)胞。類似地,分離心肌細(xì)胞進(jìn)行流式細(xì)胞分析在ZsGreen+細(xì)胞中也沒有發(fā)現(xiàn)肌細(xì)胞(圖5E)。
相反,陽性對照實驗中很容易在受損TA肌肉中檢測到ZsGreen+tdTomato+肌細(xì)胞(圖5F)。在Tnnt2-Dre;Actb-Cre;NR1小鼠心臟切片中非肌細(xì)胞100%被ZsGreen標(biāo)記(補(bǔ)充材料)。
圖5.
綜上所述,使用基于Tnnt2-Dre;Actb-Cre;NR1的第4種譜系示蹤策略的結(jié)果顯示,非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化只在胚胎期而不在成體心臟中出現(xiàn)。
除了成體心臟中的心肌細(xì)胞外,還有多種具有已知分子標(biāo)記的非肌細(xì)胞細(xì)胞譜系。對于這些不同的細(xì)胞群,用不同的Marker啟動子驅(qū)動重組酶構(gòu)建工具鼠,來追蹤非肌細(xì)胞的細(xì)胞命運,如:
內(nèi)心細(xì)胞:Npr3-CreER;
間充質(zhì)干細(xì)胞或成纖維細(xì)胞:Sox9-CreER、Vim-CreER、Postn-CreER;
內(nèi)皮細(xì)胞:Cdh5-CreER;
周細(xì)胞或平滑肌細(xì)胞:Myh11-CreER、Pdgfrb-CreER、NG2-CreER;
心外膜細(xì)胞:Wt1-CreER;
作為對照,用aMHC-MerCreMer來示蹤心肌細(xì)胞。
對這10種工具鼠進(jìn)行他莫昔芬誘導(dǎo),兩周后進(jìn)行MI造模或假手術(shù),并在心臟損傷4周后收集心臟組織樣本(見下圖B)。在這10個小鼠品系的心臟切片上的tdTomato和肌細(xì)胞標(biāo)記TNNI3染色顯示,在假手術(shù)或MI后除了來自已存在的心肌細(xì)胞外,并沒有來自上述這些不同細(xì)胞譜系對肌細(xì)胞的貢獻(xiàn)(下圖C,D)。這些結(jié)果表明,所有這些非肌細(xì)胞都不參與向新的肌細(xì)胞轉(zhuǎn)化,而aMHC-MerCreMer示蹤數(shù)據(jù)顯示,受損心肌中的所有心肌細(xì)胞均來源于已有的心肌細(xì)胞(下圖C,D)。
圖6. A-D
因此,綜合所有的實驗結(jié)果,心肌再生中肌細(xì)胞生成肌細(xì)胞,而不存在非肌細(xì)胞向肌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化。
利用新建立的雙同源重組技術(shù)系統(tǒng)的這項研究,由哪些臨床意義呢?
表明假定的Sca1+,Bmi1+,Isl1+,Abcg2+或其他干細(xì)胞群體在成體階段對于心臟再生并不具備生肌潛能。
心肌細(xì)胞是心臟再生的主要細(xì)胞來源。
這種新的遺傳學(xué)系統(tǒng)提供了前所未有的策略,來研究假定的成體干細(xì)胞對組織修復(fù)和多器官系統(tǒng)再生的貢獻(xiàn)。