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動(dòng)物組織基因組DNA提取試劑盒使用說明

瀏覽次數(shù):5460 發(fā)布日期:2018-4-16  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

動(dòng)物組織基因組DNA提取試劑盒

一、 

    動(dòng)物組織基因組DNA提取試劑盒(DePure Tissue DNA Kit)適用于動(dòng)物組織、培養(yǎng)細(xì)胞、抗凝血液、體液、分泌液等生物樣品的DNA提取。試劑盒基于硅膠柱純化技術(shù),提取過程中無需使用有毒的酚氯仿抽提,也無需進(jìn)行耗時(shí)的醇類沉淀,整個(gè)提取過程只需30分鐘(不含消化時(shí)間)。動(dòng)物組織基因組DNA提取試劑盒一次可處理1~20mg組織樣品、1~200µl抗凝血液或體液樣品、5 x 106個(gè)培養(yǎng)細(xì)胞,得到的DNA可直接用于PCR、Southern blot、LAMP、Real-Time PCR等下游實(shí)驗(yàn)。

 

二、 

    動(dòng)物組織基因組DNA提取試劑盒基于硅膠柱純化方式。樣品在裂解液(Buffer MTL)和蛋白酶作用下裂解消化,DNA釋放到裂解液中。加入Buffer AL和乙醇后,轉(zhuǎn)移至柱子中過濾,DNA被吸附上柱子的膜上,而蛋白質(zhì)則不被吸附而隨溶液濾出去除。柱子經(jīng)Buffer GW1洗滌蛋白質(zhì)和其它雜質(zhì),經(jīng)Buffer GW2洗滌去除鹽分,最后DNA被低鹽緩沖液(Buffer AE)洗脫,洗脫的DNA可直接用于PCR、Southern blot、LAMP、Real-Time PCR等下游實(shí)驗(yàn)。

     DePure硅膠柱是采用高結(jié)合力的玻璃纖維濾膜為基質(zhì)。濾膜在高濃度離子化劑(如鹽酸胍或異硫氰酸胍)條件下,可通過氫鍵和靜電等物理作用吸附核酸,而蛋白質(zhì)或其它雜質(zhì)不被吸附而去除。吸附了核酸的濾膜經(jīng)洗滌去除蛋白質(zhì)和鹽,最后可以用低鹽緩沖液(Buffer AE)洗脫出濾膜上吸附的核酸。得到的核酸純度高,可直接用于各種下游實(shí)驗(yàn)。

 

三、 

DePure Tissue DNA Kit

產(chǎn)品編號(hào)

071041M

提取次數(shù)

48次

DePure gDNA Mini Columns

48個(gè)

2ml Collection Tubes

48個(gè)

Buffer MTL

40 ml

Buffer AL

40 ml

Buffer GW1

14 ml

Buffer GW2

20 ml

Proteinase K

24 mg

Protease Dissolve Buffer

32ml

RNase Solution

300 µl

Buffer AE

325ml

說明書

1

 

四、 質(zhì) 

動(dòng)物組織基因組DNA提取試劑盒除Proteinase K外,可在室溫下(15-25℃)干燥保存12個(gè)月。長期保存時(shí)需置于2-8℃。低溫下,Buffer MTL可能會(huì)有沉淀形成,需37℃水浴讓沉淀完全溶解。Proteinase K干粉和RNase Solution室溫運(yùn)輸,收到試劑盒后請保存于2~8℃或-20℃。

 

五、  準(zhǔn)      

  • 無水乙醇(96%-100%)
  • 滅菌的離心管和吸頭
  • 小型離心機(jī)(13,000rpm)
  • 水浴鍋或金屬浴
  • 按瓶子標(biāo)簽所示,加入適量的Protease Dissolve Buffer至Proteinase K干粉中至終濃度為20mg/ml,顛倒混勻讓蛋白酶K充分溶解,于-20℃保存。

071041M, 48次

加入1.2ml Protease Dissolve Buffer至Proteinase K管子中,顛倒混勻使蛋白酶K充分溶解,保存于-20℃。

  • Buffer GW1使用前,須按瓶子標(biāo)簽所示,加入無水乙醇進(jìn)行稀釋。

071041M, 48次

加入28 ml 無水乙醇

  • Buffer GW2使用前,須按瓶子標(biāo)簽所示,加入無水乙醇進(jìn)行稀釋。

071041M, 48次

加入80ml 無水乙醇

 

六、方案1. 動(dòng)物組織DNA提取

    該方案適合于從1~20mg動(dòng)物組織,如肝臟、脾臟、腎臟、老鼠尾巴等組織樣品中提取DNA,以下離心操作都在室溫進(jìn)行。

  • 把1~20 mg組織樣品(或10 mg肝臟、肺或脾臟)剪切成盡量小的碎片,并轉(zhuǎn)移至1.5ml離心管中。加入230µl Buffer MTL和20µl Proteinase K,渦旋混勻。55℃水浴1~3小時(shí)或過夜消化樣品。水浴期間需偶爾渦旋混勻,或放置于振蕩水浴渦中。

注:適當(dāng)?shù)慕M織用量才能獲得理想的提取結(jié)果,樣品過多會(huì)降低產(chǎn)量和純度。脾臟、肝臟、腎臟等組織樣品富含DNA,不宜超過10mg。肌肉和皮膚等樣品用量可用到30mg以提高產(chǎn)量。將組織塊盡量剪切成小碎片可縮短消化時(shí)間。采用液氮研磨,勻漿器處理組織樣品可達(dá)到縮短消化時(shí)間的目的。小鼠尾巴最大用量為1.2cm,大鼠尾巴最大用量為0.6cm。消化時(shí)間取決于樣品的類型和勻漿效果。一般組織樣品需1-3小時(shí),老鼠尾巴需6-8小時(shí)。過夜消化沒有負(fù)面影響。

  • 加入5µl RNase Solution至消化液中混勻。室溫或37℃水浴鍋中放置15~60分鐘降解RNA。

注:RNase Solution消化時(shí)間取決于樣品類型。肝臟和腎臟富含RNA,需較長的消化時(shí)間。

  • (可選)10,000rpm離心3分鐘。轉(zhuǎn)移上清液至新的1.5ml離心管中。

注:若消化液比較渾濁或存在明顯的顆粒,不要省略此步。

  • 加入250µl Buffer AL至消化液中。最高速度渦旋混勻30秒。70℃水浴10分鐘。
  • 加入250µl無水乙醇至消化液中。最高速度渦旋混勻30秒。

注:處理肝臟或脾臟等組織時(shí),加入乙醇時(shí)會(huì)有沉淀形成,屬正,F(xiàn)象。用移液槍吸打10-15次盡量打散沉淀團(tuán)。

  • 把DePure gDNA Mini Column裝在2ml收集管中。轉(zhuǎn)移第五步獲得的混合液(包括沉淀)至柱子中。10,000rpm離心1分鐘。

注:若柱子出現(xiàn)堵塞,延長離心時(shí)間。

  • 倒棄流出液,把柱子重新裝回收集管中。加入500µl Buffer GW1(已用乙醇稀釋)至柱子上。10,000rpm離心1分鐘。

注:Buffer GW1須用無水乙醇稀釋。按瓶子標(biāo)簽或說明書指示進(jìn)行稀釋。

  • 倒棄濾液,把柱子重新裝回收集管中。加入500 µl Buffer GW2(已用乙醇稀釋)至柱子中。10,000rpm離心1分鐘。

注:Buffer GW2須用無水乙醇稀釋。按瓶子標(biāo)簽或說明書指示進(jìn)行稀釋。

  • 倒棄濾液,把柱子重新裝回收集管中。再加入500 µl Buffer GW2(已用乙醇稀釋)至柱子中。10,000rpm離心1分鐘。
  • 倒棄流出液,把柱子重新裝回收集管中。10,000 × g離心2分鐘去除柱子中殘留的乙醇。
  • 將柱子裝在新的1.5ml離心管中。加入30~100µl預(yù)熱至70℃ Buffer AE至柱子的膜中央。放置3分鐘。10,000 rpm離心1分鐘。
  • (可選)再加入30~100µl預(yù)熱至70℃ Buffer AE至柱子的膜中央。放置3分鐘。10,000 × g離心1分鐘。

注: 處理DNA含量很低的樣品無需第二次洗脫。

  • 丟棄DNA結(jié)合柱,DNA保存于2-8℃,長期保存需保存于-20℃。

 

七、方案2. 體液/細(xì)胞DNA提取

    該方案適合于從動(dòng)物血液,血清,血漿,唾液等液體樣品中直接提取DNA,以下離心操作都在室溫進(jìn)行。

  • 樣品的處理
    • 紅細(xì)胞帶核的血液樣品:鳥類/魚類等非哺乳類動(dòng)物血液的紅細(xì)胞帶細(xì)胞核,其DNA含量極為豐富。在1.5ml離心管中,加入1-10µl抗凝血液樣品。用Buffer PBS或滅菌水調(diào)整總體積為200 µl,渦旋混勻,按第2步進(jìn)行。
    • 紅細(xì)胞不帶核的血液樣品:在1.5ml離心管中,1-200µl抗凝血液樣品。用Buffer PBS或滅菌水調(diào)整總體積為200 µl,按第2步進(jìn)行。
    • 唾液或其它液體樣品:在1.5ml離心管中,加入1-200µl唾液或其它液體樣品,用Buffer PBS或滅菌水調(diào)整總體積為200 µl,按第2步進(jìn)行。
    • 培養(yǎng)細(xì)胞(5 x 106):500 rpm離心收集細(xì)胞,倒棄培養(yǎng)液。加入200µl Buffer PBS或滅菌水渦旋重懸細(xì)胞。
  • 加入20µl Proteinase K至樣品中,輕輕拍打幾次混勻。
  • 加入200µl Buffer AL至樣品中,最高速度渦旋混勻30秒。65℃水浴30分鐘。

注:若需去除RNA,加入5ul RNase A至消化液中,室溫靜置15~30分鐘。

  • 加入200µl無水乙醇至消化液中。最高速度渦旋混勻30秒。

注:若加入乙醇后有沉淀形成,用移液槍吸打5次打散沉淀團(tuán)。

  • 按方案1的第6~13步進(jìn)行操作。

 

八、     

該列表可能有利于您解決在提取過程中所碰到的問題。若您對(duì)試劑盒存在疑問或有良好的建議,又或者您在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中碰到問題,都請您聯(lián)系我們。我們將竭盡所能為您排擾解難。

現(xiàn) 象

原 因

解 決 方 法

柱子堵塞

樣品消化不充分

用液氮或勻漿器對(duì)樣品進(jìn)行研磨和勻漿,提高樣品的消化效果。延長Proteinase K消化時(shí)間或過夜消化。

樣品用量太多

減少樣品用量。富含核酸的樣品如肝臟,脾臟,肺臟等樣品,組織用量不要超過10mg。

需要離心去除不消化物質(zhì)

若樣品消化后仍存在明顯的顆粒,于10,000rpm離心5分鐘去除末消化的物質(zhì)。

用移液槍打散沉淀

加入乙醇后,消化液可能會(huì)有沉淀析出,用移液槍吸打盡量打散沉淀團(tuán)。

Proteinase K活性下降

重新制備Proteinase K。分裝保存Proteinase K,避免反復(fù)凍融,Proteinase K與Buffer AL不能預(yù)先混合。

DNA產(chǎn)量低

樣品DNA含量低

組織樣品本身含量低,用富含核酸的肝臟,脾臟來提取

柱子堵塞

參照上述情況

洗脫效率不夠

增加洗脫體積和洗脫次數(shù)。由于基因組DNA片段大,水溶性較差。建議進(jìn)行第三次洗脫以提高產(chǎn)量或提高洗脫液的體積。

Buffer GW1/GW2中乙醇沒有加入或加入量不夠

按說明書或瓶子標(biāo)簽所示,加入適量的無水乙醇至Buffer GW1和Buffer GW2中。

柱子沒有空甩

柱子必須空甩2-3分鐘以去除膜上殘留的乙醇。

RNA污染

延長RNase消化時(shí)間

動(dòng)物的內(nèi)臟如肝臟和腎臟,以及培養(yǎng)細(xì)胞富含RNA,延長RNase消化時(shí)間至60分鐘。

OD260/OD280比值不正常

RNA污染

加入RNase酶消化,或延長RNase酶的消化時(shí)間

Proteinase K活性下降

重新制備Proteinase K。使用后Proteinase K必須立即保存于-20℃。分裝保存Proteinase K,避免反復(fù)凍融。

加入Buffer AL后混勻不充分

重新提取,加入Buffer AL后立即顛倒混勻3-5次,然后以最高速度渦旋讓樣品與Buffer AL充分混勻。

Buffer GW1/GW2中乙醇沒有加入或加入量不夠

按說明書或瓶子標(biāo)簽所示,加入正確的乙醇。

若以上的解答還是無法解決您的問題,請您聯(lián)系我們。

 

九、企業(yè)信息

上海一基實(shí)業(yè)有限公司

電話:021-61119791

來源:上海一基實(shí)業(yè)有限公司
聯(lián)系電話:021-60536261
E-mail:2851717098@qq.com

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