BY 陸思嘉 博士:
單細胞測序是生命科學(xué)研究的極致所在
億康基因總經(jīng)理兼聯(lián)合創(chuàng)始人
MALBAC®發(fā)明人,共發(fā)表SCI首輪論文數(shù)十篇
測序中國對話了生殖健康領(lǐng)域著名企業(yè)億康基因總經(jīng)理兼聯(lián)合創(chuàng)始人陸思嘉博士。陸思嘉博士是MALBAC®單細胞全基因組擴增技術(shù)的發(fā)明人,這一技術(shù)目前在輔助生殖、產(chǎn)前診斷、優(yōu)生優(yōu)育、腫瘤篩查等領(lǐng)域取得了重要進展并已成功投入臨床應(yīng)用。在專訪中,陸思嘉暢談了他的跨界科研經(jīng)歷、他對生命的理解以及他對科學(xué)極致的追求。
「我是一個典型的跨界科學(xué)研究者」
陸思嘉博士的本科就讀于復(fù)旦大學(xué),其專業(yè)為物理與光學(xué)技術(shù),從事激光系統(tǒng)、超快光學(xué)、顯微鏡等精準檢測相關(guān)領(lǐng)域的研究。在當時,正值二代測序技術(shù)剛剛起步,如何將光學(xué)的精準檢測運用到當時剛起步的二代測序中,成了陸博士前往哈佛求學(xué)的一個最大動力。
畢業(yè)后,陸博士如愿來到哈佛大學(xué),并師從國際知名化學(xué)家、美國科學(xué)院院士謝曉亮教授。進入哈佛后,正逢謝院士負責(zé)的單細胞擴增研究項目啟動,陸思嘉博士的研究領(lǐng)域從光學(xué)物理領(lǐng)域逐漸轉(zhuǎn)到了基因領(lǐng)域,并在長達5年的碩博生涯中開始了二代測序方面的研究。
陸博士幽默地回應(yīng)道,自己是一個典型的跨界科學(xué)研究者,暢游于物理、化學(xué)、超快光學(xué)、基因組學(xué)、遺傳學(xué)、胚胎學(xué)等領(lǐng)域之間。而基因組學(xué)和基因測序本身就是跨界的,不屬于任何傳統(tǒng)的研究方向。從化學(xué)反應(yīng)的鑒別、光學(xué)的可視化到貫穿測序過程中的工程和算法支撐,都是基因測序必不可少的科技因素。
對于自己的科研經(jīng)歷以及本世紀前二十年這一場基因測序技術(shù)的浪潮,陸思嘉博士也頗有感觸,“我覺得以后的科學(xué)進步,從NGS到基因組學(xué),都將是一個多學(xué)科的交融過程。基于這一點,我認為國內(nèi)的教育體制和產(chǎn)業(yè)體制都需要進一步改革,以適應(yīng)新環(huán)境和新變化。國外的實驗室大多具有多學(xué)科融合的特點,例如我們組里面有工程、物理、化學(xué)、計算機等各種成員,但是國內(nèi)這種情況較為少見。中國的測序產(chǎn)業(yè)只有在教育體制、科研體制和產(chǎn)業(yè)體制發(fā)生變革后,才能加速登上新的臺階!
此外,陸博士格外強調(diào)了“產(chǎn)學(xué)研”合作對科技成果轉(zhuǎn)化的重要性。他表示:“從中國的各行業(yè)發(fā)展上來看,‘產(chǎn)學(xué)研’的基礎(chǔ)并不是很好。在美國,很多高校的學(xué)生會接受企業(yè)的聯(lián)合培養(yǎng),他們也會更加理解產(chǎn)業(yè)的特點和需求,產(chǎn)業(yè)界也會積極與高校的教授進行合作,共同進行研發(fā),加速科技成果的轉(zhuǎn)化。國內(nèi)應(yīng)該建立產(chǎn)學(xué)研各部門聯(lián)合培養(yǎng)學(xué)生、共同研發(fā)、共享科研成果的機制,共同推進高端人才的培養(yǎng)和產(chǎn)學(xué)研的協(xié)作,推進科研水平和臨床診療水平的提高!
在其看來,企業(yè)應(yīng)該與科研院所、醫(yī)療機構(gòu)建立廣泛合作。企業(yè)可以利用自己的技術(shù)優(yōu)勢幫助科研院所或醫(yī)療機構(gòu)建立技術(shù)平臺,將產(chǎn)品和服務(wù)提供給興趣和研究方向不同的研究者,最大效益地開發(fā)新技術(shù)的應(yīng)用并推廣其價值。
「單細胞測序:探索生命的一扇窗」
細胞是生物體最小的結(jié)構(gòu)和功能的基本單元,其中的DNA攜帶了除其他體細胞突變外所有表征該生命體特點的信息;此外,細胞也是突變和遺傳的載體單元。因此,理解一個生物體,理解一個生命過程,最直接的手段就是研究單細胞層面上發(fā)生的事情。他認為,單細胞測序是當前生命科學(xué)研究的極致所在,相關(guān)研究對于胚胎發(fā)育、神經(jīng)發(fā)育等領(lǐng)域有決定性的推動作用。而單細胞或者少量細胞的測序的主要困難在于,測序的第一步需要先將樣本擴增,一旦復(fù)制中出現(xiàn)微小的錯誤,在接下來的指數(shù)復(fù)制過程中,錯誤會被不斷放大,最終導(dǎo)致我們無法區(qū)分這種錯誤是來自“副本”還是來自“母本”的。
MALBAC®技術(shù)利用某種環(huán)狀結(jié)構(gòu)將副本的復(fù)制鎖定,讓拷貝無法復(fù)制自己,所有的拷貝只能來自母本。歷時兩年,在無數(shù)次的失敗中不斷改進,成熟的MALBAC®技術(shù)最終被研究出來,與傳統(tǒng)技術(shù)比起來,準確性和覆蓋度都要好很多,對腫瘤細胞的DNA檢測覆蓋度高達93%,通常的技術(shù)手段只能做到50%~70%。據(jù)悉,陸思嘉博士已成功將該技術(shù)運用于了輔助生殖、腫瘤研究等領(lǐng)域,并推動了單細胞測序的研發(fā)和應(yīng)用。
「從實驗室走向臨床,我所做的只是追求極致」
從科研走向創(chuàng)業(yè),將科研成果投入應(yīng)用,是很多科學(xué)家的選擇。陸思嘉博士表示,最初的想法就是希望自己的成果能為人類健康事業(yè)的進步做出貢獻,而非僅僅停留于紙面的科學(xué)論文。MALBAC®的相關(guān)文章發(fā)表后,實驗室收到一名患者家屬來信,詢問其科研成果能否讓其罹患遺傳性多發(fā)性骨軟骨瘤遺傳病的家人得到健康的下一代。這個契機觸動了謝教授及其團隊,他們意識到自己的成果可以幫助中國廣大的遺傳病患病群體,該技術(shù)的落地或?qū)⒋蠓纳葡乱淮慕】禒顩r和生活水平。
“沒想到這么快就從實驗室走向臨床應(yīng)用。我們早就預(yù)測這種技術(shù)可應(yīng)用的空間很大,但具體用在哪些方面,我們并未多想。當時只是想追求科學(xué)上的極致。誰也沒有料到,MALBAC®技術(shù)這么快就能夠造;颊,”陸思嘉博士笑談道。
2014年9月,全球首例MALBAC-PGD™健康寶寶出生,體重4030克,身長53厘米,隨后的臍血基因檢測再次證明,寶寶不攜帶遺傳性多發(fā)性骨軟骨瘤的致病位點。截至2017年,億康基因運用該項技術(shù)成功阻斷遺傳病150余種,已幫助2000多個家庭獲得健康的寶寶。
「“已來”和“未來”是應(yīng)該抓緊的“將來”」
談及當前行業(yè)的突出問題,陸思嘉博士指出,中國基因行業(yè)的第一個問題在于大部分企業(yè)處在產(chǎn)業(yè)鏈的服務(wù)端,即提供測序服務(wù)階段。而實力強大的企業(yè)應(yīng)該走到基因產(chǎn)業(yè)的最上游,即測序儀的研發(fā)和生產(chǎn)、測序新技術(shù)的開發(fā)等環(huán)節(jié)。從完整的、健康的產(chǎn)業(yè)鏈的角度上來說,如果中國企業(yè)對測序儀生產(chǎn)這樣上游環(huán)節(jié)沒有足夠的把控力,整個產(chǎn)業(yè)將置身于危險之中。因為整個國內(nèi)產(chǎn)業(yè)將受限于國外廠家,任何商業(yè)的問題都將對國內(nèi)的基因產(chǎn)業(yè)帶來無法彌補的損失。他強調(diào),國家應(yīng)該大力支持有實力的企業(yè),并把這一部分產(chǎn)業(yè)的基礎(chǔ)打牢。
第二點在于臨床應(yīng)用,也就是整個產(chǎn)業(yè)鏈的最下游。他認為,除了NIPT以外,大部分臨床檢測都不敢自稱從技術(shù)到審批等全部環(huán)節(jié)都較為成熟;也有很多有價值的技術(shù)沒有落地,沒有在實際應(yīng)用中體現(xiàn)科技的價值,更沒有為人類健康事業(yè)的前進發(fā)揮其應(yīng)有的作用。
面對目前國內(nèi)的基因行業(yè)上下游存在的問題,陸博士預(yù)言,未來國內(nèi)應(yīng)該會出現(xiàn)有實力的測序儀生產(chǎn)商。目前國內(nèi)已有企業(yè)在相關(guān)領(lǐng)域取得初步成果,而未來誰將獨占鰲頭尚有待觀察;其次,將會涌現(xiàn)出很好的大數(shù)據(jù)企業(yè),IT和互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展將會促成基因行業(yè)數(shù)據(jù)庫的建立,大數(shù)據(jù)推動科研和臨床的發(fā)展已經(jīng)成為新常態(tài);最后,基因測序服務(wù)也將會進一步細分,并為病人提供病前、治療中和治療后全方位的、個體化的診療服務(wù)。
過去、現(xiàn)在和可以預(yù)見的將來,這里是一片藍海。
轉(zhuǎn)自——測序中國