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全自動(dòng)化DNA文庫(kù)構(gòu)建技術(shù)簡(jiǎn)介

瀏覽次數(shù):5120 發(fā)布日期:2016-8-3  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

在二代測(cè)序中,基因文庫(kù)的構(gòu)建是一項(xiàng)十分耗時(shí)耗力的工作,需要熟練的科研技術(shù)人員在整個(gè)操作過程中保持需高度注意力,花費(fèi)大量時(shí)間和精力才能完成建庫(kù)工作。因此,大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室有將文庫(kù)構(gòu)建工作自動(dòng)化的需求,以節(jié)省人力。

應(yīng)文庫(kù)構(gòu)建自動(dòng)化的需求,派瑪.迪格(PrimaDiag)公司研發(fā)了ACSIA NGSLibPrep自動(dòng)建庫(kù)平臺(tái),該平臺(tái)移液精準(zhǔn),重復(fù)性高,使用了創(chuàng)新專利技術(shù)APIM(感應(yīng)磁化吸引技術(shù))處理磁珠,根據(jù)需求通電或斷電產(chǎn)生磁力和去磁化,溫度控制精準(zhǔn)到0.1℃,震蕩速度200 - 3000 rpm范圍可調(diào)。

歸功于ACSIA平臺(tái)的靈活性,派瑪.迪格公司的科研人員將NEBNext Ultra DNA kit的文庫(kù)構(gòu)建操作步驟在ACSIA文庫(kù)構(gòu)建平臺(tái)上實(shí)現(xiàn)了全自動(dòng)化。派瑪.迪格公司將提供優(yōu)化好的預(yù)設(shè)程序,中途不需要人工干預(yù),一次實(shí)現(xiàn)96個(gè)文庫(kù)的全自動(dòng)化構(gòu)建。3小時(shí)的人手建庫(kù)工作,使用自動(dòng)化平臺(tái),只需人手操作10分鐘。

經(jīng)過優(yōu)化的操作步驟允許使用最少的槍頭數(shù)來完成整個(gè)建庫(kù)工作,大大節(jié)約試劑和耗材成本。例如構(gòu)建48個(gè)DNA文庫(kù)僅需要3盒槍頭,而人工操作使用的槍頭數(shù)會(huì)達(dá)到14盒之多。

比較ACSIA全自動(dòng)化和人工建立的文庫(kù),DNA片段大小分別是338 bp 和 340 bp,結(jié)果十分相近,而使用ACSIA建庫(kù)得到文庫(kù)質(zhì)量比人工建庫(kù)高將近30%。

減少人手操作時(shí)間,極大的節(jié)省槍頭成本,文庫(kù)得率顯著增加,使得NEBNextUltra DNA kit 在ACSIA NGSLibPrep自動(dòng)文庫(kù)構(gòu)建平臺(tái)上完美實(shí)現(xiàn)全自動(dòng)化建庫(kù)。

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