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定量蛋白質(zhì)組表達(dá)譜分析技術(shù)---iTRAQ/TMT

瀏覽次數(shù):3924 發(fā)布日期:2016-4-14  來(lái)源:南京厚百電子商務(wù)有限公司

iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技術(shù)是分別由美國(guó)AB Sciex公司和Thermo公司研發(fā)的多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。這兩種技術(shù)采用2-10種穩(wěn)定同位素標(biāo)簽,通過(guò)特異性 標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán),然后進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析,可同時(shí)比較多達(dá)10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對(duì)含量。

iTRAQ/TMT試劑由三部分組成:報(bào)告基團(tuán)、平衡基團(tuán)和反應(yīng)基團(tuán)。反應(yīng)基團(tuán)形成2-10種等質(zhì)量同位素標(biāo)簽。iTRAQ/TMT試劑標(biāo)記酶解后的肽段,可與氨基酸N端及側(cè)鏈的伯胺基團(tuán)發(fā)生反應(yīng)。在一級(jí)譜圖中,來(lái)自于不同樣本的同一肽段,標(biāo)記后表現(xiàn)為相同的質(zhì)荷比。在二級(jí)譜圖中,報(bào)告基團(tuán)、平衡基團(tuán)和反應(yīng)基團(tuán)之間的鍵斷裂,帶不同同位素標(biāo)簽的同一肽段產(chǎn)生質(zhì)量不同的報(bào)告離子,根據(jù)報(bào)告離子的豐度可獲得樣本間相同肽段的定量信息,再經(jīng)過(guò)軟件處理得到蛋白質(zhì)的定量信息。其基本原理與技術(shù)流程如下圖所示:

    Thermo Scientific Q Exactive/Thermo Scientific Q Exactive Plus/Thermo Scientific Orbitrap Fusion

    平行比較2-10個(gè)樣本;蛋白通量高,覆蓋度高;可用于各種類(lèi)型生物樣本。

    各種脅迫、生理、病理?xiàng)l件下細(xì)胞、組織樣品中高通量蛋白表達(dá)譜分析

    各種物種的蛋白質(zhì)組草圖的構(gòu)建

參考文獻(xiàn)

[1]Yang QS, Wu JH, et al. Quantitative proteomic analysis reveals that antioxidation mechanisms contribute to cold tolerance in plantain (Musa paradisiacal L.; ABB Group) seedlings. Mol Cell Proteomics. 2012; 11(12): 1853-69.

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