美國(guó)及歐洲NIPT市場(chǎng)情況
在美國(guó),NIPT市場(chǎng)主要為4家公司所覆蓋,分別為Sequenom, Verinata Health(2013年被Illumina收購(gòu)),Ariosa Diagnostics 和Natera 其相應(yīng)NIPT產(chǎn)品登陸市場(chǎng)時(shí)間也集中在2011年底到2012年底[1],在此期間NIPT商業(yè)化模式正式拉開帷幕。
從檢測(cè)的技術(shù)來(lái)看,提供NIPT服務(wù)的公司主要分為兩類,1)采用高通量全基因測(cè)序的方法對(duì)樣本進(jìn)行檢測(cè)的Sequenom和Verinata,2)采用靶向區(qū)域測(cè)序的方法對(duì)染色體多倍性進(jìn)行分析的Ariosa和Natera。由于進(jìn)行染色體多倍性分析所選擇的區(qū)段大小不同,所需要的測(cè)序數(shù)據(jù)量也不盡相同。采用高通量全基因組測(cè)序方法的Sequenom和 Verinata公司所提供的檢測(cè)產(chǎn)品,需要的測(cè)序數(shù)據(jù)量相對(duì)較大,每個(gè)檢測(cè)樣本需要獲得的Reads數(shù)需要達(dá)到1300萬(wàn)條以上[2,3]。Christina Fan 在其研究中描述到“采用高通量全基因組測(cè)序進(jìn)行NIPT檢測(cè),檢測(cè)的靈敏度和準(zhǔn)確性直接和數(shù)據(jù)量相關(guān),推薦使用reads數(shù)大于10M的數(shù)據(jù)進(jìn)行檢測(cè)分析”[4]。而通過(guò)靶向區(qū)域信息獲得的染色體倍性信息的Ariosa及Natera公司,則需要相對(duì)較少測(cè)序通量,其需要測(cè)序序列分別為1.1M及6.5M[5,6]。在測(cè)序平臺(tái)的選擇上,這些公司都選擇了通量高、測(cè)序成本低的HiSeq2000(Illumina)測(cè)序平臺(tái)[2,7,8,9]。不管采用何種技術(shù)路線,4家公司都已驗(yàn)證其檢驗(yàn)結(jié)果的可信性,并在相應(yīng)的學(xué)術(shù)雜志上報(bào)道了從幾百例到幾千例不等的高可信度的檢驗(yàn)結(jié)果(表1)[2,3,7,8,10,11]。檢測(cè)周期上,除Natera公司需要15天外,其他3家公司均需要8-10天完成檢測(cè)[1]。
從監(jiān)管層面上來(lái)看,四家公司都獲得了CAP(美國(guó)病理學(xué)家學(xué)會(huì))和CLIA(臨床實(shí)驗(yàn)室改進(jìn)修正案)的認(rèn)證,并且Sequenom和Verinata計(jì)劃提交IVD(體外診斷產(chǎn)品),PMA(上市前批準(zhǔn)管理)的申請(qǐng)[1]。另外,illumina在獲得了MiSeqDx的FDA認(rèn)證后,計(jì)劃在今年年底向FDA提交HiSeq 2500 NIPT 檢測(cè)試劑盒的申請(qǐng)[12],如果獲得審批將對(duì)整個(gè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的建立和完善意義重大。
在費(fèi)用支付上,美國(guó)的NIPT檢測(cè)公司大都采用兩種方式,個(gè)人自費(fèi)或個(gè)人及保險(xiǎn)共擔(dān)的形式。個(gè)人自費(fèi)所需要支付的費(fèi)用從295美金到1700美金不等。美國(guó)NIPT服務(wù)公司積極尋求與保險(xiǎn)公司合作[1],Genomeweb 今年2月19日曽報(bào)道:Verinata在美國(guó)已拿到1.3億人次的保險(xiǎn)合同,而Sequenom也已拿到1.13億人次的保險(xiǎn)合同[13]。
在歐洲,NIPT市場(chǎng)主要為一家公司所占有,LifeCodexx[14]。該公司是唯一一家獲得歐洲NIPT IVDD(體外診斷指令)認(rèn)證的公司。公司與Sequenom合作,技術(shù)路線采納了Sequenom的高通量全基因組測(cè)序的方法,單個(gè)樣本的檢測(cè)數(shù)據(jù)量達(dá)到10-30M[15],檢測(cè)費(fèi)用需要985歐元。
表1:國(guó)外NIPT公司概況
|
Sequenom |
Verinata Health(Illumina) |
Ariosa Diagnostics |
Natera |
LifeCodexx |
產(chǎn)品名 |
MaterniT21 |
Verifi |
Harmony Prenatal Test |
Panorama Prenatal Test |
PrenaTest |
國(guó)家 |
美國(guó) |
美國(guó) |
美國(guó) |
美國(guó) |
德國(guó)、瑞士 |
上市時(shí)間 |
2011.10 |
2012.3 |
2012.5 |
2012.12 |
2012.08 |
檢測(cè)技術(shù) |
高通量全基因組測(cè)序 |
高通量全基因組測(cè)序 |
數(shù)字靶向區(qū)域選擇及靶向區(qū)域測(cè)序 |
基于SNP的靶向區(qū)域測(cè)序 |
高通量全基因組測(cè)序 |
檢測(cè)平臺(tái) |
HiSeq2000 |
HiSeq2000 |
HiSeq2000 |
HiSeq2000 |
HiSeq2000 |
測(cè)序數(shù)據(jù)量(Read) |
19M |
13-26M |
1.1M |
>6.5M |
10-30M |
收費(fèi) |
自費(fèi) $1700, 保險(xiǎn)與個(gè)人共擔(dān): 個(gè)人:$235 需要向保險(xiǎn)公司繳納健康保費(fèi):$2900 |
自費(fèi) $295, 保險(xiǎn)與個(gè)人共擔(dān): 個(gè)人:$200 需要向保險(xiǎn)公司繳納健康保費(fèi):$1200 |
自費(fèi) $795, 保險(xiǎn)與個(gè)人共擔(dān): 個(gè)人:$95 |
自費(fèi):未知 保險(xiǎn)與個(gè)人共擔(dān):直接向保險(xiǎn)公司繳納健康保費(fèi):$1495 |
自費(fèi): 985 歐元[14] |
周期 |
8-10 天 |
8-10 天 |
8-10天 |
15天 |
10個(gè)工作日 |
監(jiān)管狀況 |
CAP 認(rèn)可, CLIA 認(rèn)證, 計(jì)劃提交 IVD,PMA申請(qǐng) |
CAP 認(rèn)可, CLIA 認(rèn)證, 計(jì)劃提交 IVD,PMA,F(xiàn)DA申請(qǐng) |
CAP 認(rèn)可, CLIA 認(rèn)證 |
CAP 認(rèn)可, CLIA 認(rèn)證 |
IVDD 認(rèn)證 |
注:CLIA, 臨床實(shí)驗(yàn)室改進(jìn)修正案; CAP, 美國(guó)病理學(xué)家學(xué)會(huì);IVD, 體外診斷產(chǎn)品;IVDD,體外診斷指令(歐洲) ;PMA, 上市前批準(zhǔn)管理; SNP, 單核苷酸多態(tài)性.
我國(guó)NIPT市場(chǎng)狀況
我國(guó)NIPT市場(chǎng)主要為兩家公司所壟斷,分別為華大基因(BGI)和貝瑞和康。檢測(cè)產(chǎn)品從2012年底陸續(xù)開始上市,其所采用的檢測(cè)技術(shù)路線為高通量全基因組測(cè)序的方法,相應(yīng)的文獻(xiàn)也對(duì)其技術(shù)路線進(jìn)行詳細(xì)報(bào)道。其中BGI對(duì)11263個(gè)樣本進(jìn)行檢測(cè),使用GAIIx和HiSeq2000完成檢測(cè)[18],檢測(cè)過(guò)程中,HiSeq2000 一個(gè)Lane檢測(cè)12個(gè)樣本,單個(gè)樣本的數(shù)據(jù)量約為15M的reads。貝瑞和康進(jìn)行兩期臨床實(shí)驗(yàn),第一期完成435個(gè)樣本的檢測(cè)[19],第二期完成了1916個(gè)樣本的檢測(cè)[20]。其技術(shù)路線及測(cè)序數(shù)據(jù)量 與BGI類似,也采用高通量全基因組測(cè)序的方法,使用HiSeq2000平臺(tái)一個(gè)Lane完成12對(duì)樣本的檢測(cè)。今年年初,達(dá)安基因旗下的愛建生物采用Themo Fisher的Proton測(cè)序平臺(tái)完成前期樣本的測(cè)試,在其相應(yīng)的研究論文中提到,已完成2275個(gè)樣本的檢測(cè)[21],每個(gè)樣本的需要的數(shù)據(jù)量約為5.6M reads。
關(guān)于檢測(cè)價(jià)格,國(guó)內(nèi)NIPT的樣本檢測(cè)終端價(jià)格為280-560美金[22],不同公司及不同的區(qū)域也會(huì)略有不同。就監(jiān)管狀況來(lái)看,我國(guó)NIPT市場(chǎng)正處于市場(chǎng)規(guī)范化程度不斷提升的過(guò)程中,隨著正在申請(qǐng)的試點(diǎn)逐步開放,我國(guó)NIPT行業(yè)將迎來(lái)爆發(fā)性的增長(zhǎng)。也有媒體指出BGI正在使用Complete genomes和Ion Proton 平臺(tái)進(jìn)行國(guó)內(nèi)SFDA的申請(qǐng),希望通過(guò)收購(gòu)國(guó)外公司和貼牌的形式得到審批。另外兩家公司貝瑞和康及愛建生物則分別尋求與Illumina和Themo Fisher合作,來(lái)獲取監(jiān)管部門的審批[23]。
表二:我國(guó)NIPT市場(chǎng)情況概述
|
BGI |
貝瑞和康 |
愛建生物 |
檢測(cè)技術(shù) |
高通量全基因組測(cè)序 |
高通量全基因組測(cè)序 |
高通量全基因組測(cè)序 |
測(cè)序平臺(tái)* |
GAIIx/HiSeq2000 |
HiSeq2000 |
Proton |
上市時(shí)間* |
2012.12 |
2013.1 |
2014.3 |
收費(fèi) |
$280-560 |
$400-500 |
未知 |
測(cè)序數(shù)據(jù)量(Read) |
~15M |
~15M |
~5.6M |
監(jiān)管狀況 |
衛(wèi)生部叫停,CFDA申請(qǐng)中 |
衛(wèi)生部叫停,CFDA申請(qǐng)中 |
衛(wèi)生部叫停CFDA申請(qǐng) |
*根據(jù)其正式發(fā)表無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前診斷論文時(shí)間及論文中所使用測(cè)序平臺(tái)
我國(guó)NIPT企業(yè)與國(guó)外企業(yè)的差異
與國(guó)外NIPT市場(chǎng)相同,國(guó)內(nèi)企業(yè)幾乎都采用高通量全基因組測(cè)序的方法開展NIPT服務(wù),檢測(cè)平臺(tái)選擇上主要以Illumina測(cè)序平臺(tái)為主,Illumina基本處于市場(chǎng)壟斷的地位;但也有本土企業(yè)大膽嘗試不同的技術(shù)路線,如果愛建生物選擇Themo Fisher(前LIFE Technologies)的Ion Proton平臺(tái)開發(fā)其檢測(cè)產(chǎn)品,但由于儀器通量所限,目前只能采用大幅減少reads數(shù)的方法進(jìn)行檢測(cè),但由于其起步較晚,積累的臨床數(shù)據(jù)有限,在可靠性和成本上還有待市場(chǎng)的檢驗(yàn)。若該reads數(shù)的方法可行,由于illumina擁有通量以及通量所帶來(lái)的成本上的巨大優(yōu)勢(shì), 那么NIPT的檢測(cè)成本還可能進(jìn)一步的降低,這無(wú)疑對(duì)受檢孕婦,對(duì)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展更為有利。從產(chǎn)品上市時(shí)間來(lái)看,NIPT企業(yè)推出產(chǎn)品雖然較美國(guó)企業(yè)晚一年,但發(fā)展速度快,并且新的企業(yè)不斷涌現(xiàn),這也導(dǎo)致NIPT市場(chǎng)缺乏明確的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),如不同企業(yè)市場(chǎng)定價(jià)差別大,對(duì)企業(yè)無(wú)明確的準(zhǔn)入門檻,對(duì)該類企業(yè)監(jiān)管力度小等,這些問(wèn)題都直接導(dǎo)致衛(wèi)計(jì)委對(duì)基因臨床服務(wù)檢測(cè)的叫停。后期,隨著試點(diǎn)的開放,行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的不斷完善,以及新的法律、法規(guī)對(duì)NIPT行業(yè)的約束和管理,都將有助于整個(gè)NIPT行業(yè)在我國(guó)健康、穩(wěn)定、持續(xù)的發(fā)展。
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