NanoString技術(shù)由于其高靈敏度，高重復(fù)性并且檢測(cè)過程中不需要進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和擴(kuò)增，一經(jīng)推出便受到了廣泛的關(guān)注和認(rèn)可�，F(xiàn)在這項(xiàng)技術(shù)廣泛的應(yīng)用在基因表達(dá)（mRNA），小RNA（miRNA），拷貝數(shù)變異（CNV），長(zhǎng)鏈非編碼RNA（lncRNA）等方面的檢測(cè)，但是這些檢測(cè)的對(duì)象都是核酸，對(duì)于細(xì)胞蛋白的表達(dá)還無能為力。最近，在Science Translational Medicine 雜志上刊登了一篇題為“Cancer Cell Profiling by Barcoding Allows Multiplexed Protein Analysis in Fine-Needle Aspirates”的研究論文，報(bào)道了Adeeti V. Ullal和他的同事開發(fā)的一種基于NanoString技術(shù)的新的檢測(cè)蛋白質(zhì)表達(dá)的方法。該方法利用NanoString技術(shù)的高靈敏度和不需反轉(zhuǎn)錄的特點(diǎn)，可以準(zhǔn)確的檢測(cè)用微創(chuàng)穿刺（Fine-needle aspirates，F(xiàn)NAs）方法取得的微量樣本中的細(xì)胞表面蛋白的表達(dá)情況。

 

在理想的狀況下，臨床樣本應(yīng)該在疾病發(fā)展不同階段連續(xù)取材，用以跟蹤關(guān)鍵蛋白的變化情況。但是這種取材方式費(fèi)用高，損傷大。而用微創(chuàng)穿刺方法則可以進(jìn)行連續(xù)的取材，但是由于這種方法取到的細(xì)胞數(shù)量很少，限制了可分析蛋白的數(shù)量。盡管復(fù)用流式細(xì)胞儀（multiplexed flow cytometry）和質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)（mass cytometry）可以用于檢測(cè)少量的細(xì)胞。但是，復(fù)用流式細(xì)胞儀由于光譜重疊，可以檢測(cè)的標(biāo)志物（marker）很有限。而質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)在樣品制備過程中會(huì)損失很多的樣品，因此這兩種技術(shù)都不適用于檢測(cè)微量樣本來源的蛋白質(zhì)組信息。

 

Adeeti V. Ullal和他的同事設(shè)計(jì)ABCD檢測(cè)平臺(tái)（antibody barcoding with photocleavable DNA，ABCD）該平臺(tái)用一種帶有DNA標(biāo)簽的抗體對(duì)細(xì)胞表面蛋白進(jìn)行檢測(cè)，這種DNA標(biāo)簽由一段化學(xué)性質(zhì)穩(wěn)定且可被光裂解的小分子連接片段連接到抗體分子上，這樣每一種蛋白對(duì)應(yīng)唯一的一種抗體，每一種抗體對(duì)應(yīng)唯一的DNA標(biāo)簽，我們只需要檢測(cè)DNA標(biāo)簽就可以知道細(xì)胞表面蛋白的表達(dá)情況。在與目的細(xì)胞結(jié)合后，洗去多余未結(jié)合的抗體，并且用光脈沖把DNA標(biāo)簽解離下來，再用NanoString提供的報(bào)告探針和捕獲探針進(jìn)行檢測(cè)，就可以得到目的細(xì)胞蛋白的表達(dá)情況。而其他的一些技術(shù)，例如測(cè)序、qPCR等也可以用于這種方法的檢測(cè)，但是測(cè)序和qPCR會(huì)產(chǎn)生由擴(kuò)增偏好（amplification bias）所導(dǎo)致的誤差，而NanoString技術(shù)不需要擴(kuò)增的特點(diǎn)可以很好的還原蛋白表達(dá)情況因此被該研究所選用。他們用該技術(shù)對(duì)乳腺癌細(xì)胞系和肺癌臨床樣本進(jìn)行了檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)同一癌腫內(nèi)部的細(xì)胞樣本蛋白表達(dá)的非均一性以及不同病例間蛋白表達(dá)的非均一性很高，說明同一癌腫內(nèi)部和不同病例間的細(xì)胞個(gè)體差異很大，因此該技術(shù)可以為腫瘤患者的預(yù)后預(yù)測(cè)和腫瘤的個(gè)體化醫(yī)療提供依據(jù)。

 

圖：技術(shù)原理

A． 細(xì)胞分離；B. 帶有DNA標(biāo)簽的抗體與細(xì)胞共同孵育；C. 光脈沖使DNA標(biāo)簽解離下來，用報(bào)告探針和捕獲探針檢測(cè)DNA標(biāo)簽，得到蛋白表達(dá)情況。

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