目標(biāo)
ACQUITY UPLC ® H- Class 系統(tǒng)采用四元溶劑混合的自動(dòng)化優(yōu)化方案,對(duì)肽譜分析條件進(jìn)行系統(tǒng)性優(yōu)化。
背景
肽譜分析用于確認(rèn)某種蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu),識(shí)別翻譯后修飾(PTM),并分析雜質(zhì)。任何蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)差異反映在含有該修飾的肽保留時(shí)間的變化中。
某種蛋白質(zhì)的完整結(jié)構(gòu)定性,需要能夠分辨 100 或者 100 個(gè)以上的多肽分辨率,這些多肽的分子大小和分子特性跨度范圍很大。當(dāng)開發(fā)分離這些肽段的分離條件時(shí),包括改變流動(dòng)相組成和有機(jī)溶劑組成的變化。而且每項(xiàng)測(cè)定條件要求制備一對(duì)混合溶劑,該溶劑涉及兩項(xiàng)或者三項(xiàng)準(zhǔn)確的量度。
采用 ACQUITY UPLC H- Class 系統(tǒng)進(jìn)行四元溶劑的混合,混合溶劑的產(chǎn)生是由系統(tǒng)從純?nèi)軇┢恐谐槌龌旌隙。此方式減少了制備許多溶劑混合物的工作量,而且使得出錯(cuò)的可能性最小化。同時(shí)能夠簡(jiǎn)易地測(cè)定中間組分。
ACQUITY UPLC H- Class 系統(tǒng)簡(jiǎn)化了可用于定性蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)的肽圖譜分析方法的開發(fā)和優(yōu)化。
ACQUITY UPLC H-Class 系統(tǒng)以及它的四元溶劑混合能力旨在幫助客戶關(guān)注分析的質(zhì)量 , 高效地獲取可靠的結(jié)果。
溶液
采用 ACQUITY UPLC BEH 300 C 18 色譜柱和多重流動(dòng)相溶劑分離 MassPREP TM 烯醇酶的胰蛋白酶酶解肽段標(biāo)準(zhǔn)品。在 ACQUITY UPLC H-Class 系統(tǒng)中,我們?cè)O(shè)置水為 A 路溶劑,乙腈為 B 路溶劑,異丙醇為 C 路溶劑, 1% 的 TFA 水溶液作為 D 路溶劑。為了評(píng)估酸濃度的效果,三種相同梯度的乙腈升高洗脫梯度分別在 2.5% , 5% 和 10% 的 D 條件下運(yùn)行,象對(duì)應(yīng)的 TFA 的濃度分別為 0.025% , 0.05% ,以及 0.1% 。
烯醇酶多肽消化標(biāo)準(zhǔn)
柱:多肽分離技術(shù) BEH 300 C 18 , 2.1X 100mm , 1.7 μm
溶劑: A: 水, B: 乙腈, C :異丙醇, D:1% TFA
圖 1. 溶劑組成可使用 ACQUITY UPLC H- Class 系統(tǒng)的 Aut o · Blend TM 功能簡(jiǎn)易地進(jìn)行調(diào)節(jié)。在本例中,肽圖譜的 TFA 最佳濃度僅僅通過改變從 D 線取得的流量百分比的變化而確定的。沒有必要制備更多瓶的溶劑,而且可花費(fèi)最少的勞動(dòng)測(cè)定中間值。
圖 2. 使用 ACQUITY UPLC H- Class 系統(tǒng)的自動(dòng)混合功能從純?nèi)軇┢恐刑崛〖內(nèi)軇┗旌铣扇軇┗旌衔铩?
圖 1 中的色譜層析結(jié)果顯示了隨著酸濃度的變化,色譜選擇性的顯著變化。該實(shí)驗(yàn)可以通過重復(fù)相同的實(shí)驗(yàn)但使用遞增的異丙醇梯度進(jìn)行拓展,其能夠通過運(yùn)行溶劑 A (水)到溶劑 C (異丙醇)的梯度方便地實(shí)施,而溶劑 D 的濃度保持恒定,與先前實(shí)驗(yàn)中的濃度一致。溶劑從乙腈變?yōu)楫惐伎s短了留柱時(shí)間 , 同時(shí)也顯著改變了選擇性。
該系統(tǒng)實(shí)驗(yàn)評(píng)價(jià)了六種不同的流動(dòng)相配方以確認(rèn)最佳的肽圖譜。選擇性的改變可用于獲得混合物中的關(guān)鍵多肽的最佳分辨率。如果使用二元體系或者使用開關(guān)閥進(jìn)行這些實(shí)驗(yàn),科學(xué)家們需要制備 12 瓶流動(dòng)相溶液,至少需要 24 項(xiàng)體積量度。當(dāng)采用 ACQUITY UPLC H- Class 系統(tǒng)時(shí),僅使用了一種混合物,使用與三瓶純?nèi)軇┫嗦?lián)系的兩種度量體積(圖 2 )。 ACQUITY UPLC H- Class 系統(tǒng)可減少工作量,工作的時(shí)間,以及錯(cuò)誤存在的可能性,以達(dá)到優(yōu)化的分離條件。
總結(jié)
生物化學(xué)家能夠采用 ACQUITY UPLC H- Class 系統(tǒng)有效地開發(fā)用于定性蛋白質(zhì)的肽圖譜分析方法。該系統(tǒng)使用便捷的四溶劑混合能力輔助用戶關(guān)注于分析的質(zhì)量,使其能夠有效地開發(fā)完備的 , 可靠的分離方法。 ACQUITY UPLC H- Class 系統(tǒng)結(jié)合了 UPLC 分離原理和靈活的設(shè)備操作,以獲取最佳的生物分離結(jié)果。