蛋白質(zhì)組學(xué)研究系列儀器及軟件
瀏覽次數(shù):6704 發(fā)布日期:2008-3-24
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人體內(nèi)真正發(fā)揮作用的是蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)扮演著構(gòu)筑生命大廈的“磚塊”角色,隨著破譯生命密碼的人類(lèi)基因組計(jì)劃進(jìn)入尾聲,一個(gè)以蛋白質(zhì)和藥物基因?qū)W為研究重點(diǎn)的后基因組時(shí)代已經(jīng)拉開(kāi)序幕,蛋白質(zhì)將是今后的重點(diǎn)研究方向之一。然而,蛋白質(zhì)的分離和鑒定非常費(fèi)時(shí),目前測(cè)定蛋白質(zhì)的技術(shù)遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后于破譯基因組的工具,最好的實(shí)驗(yàn)室每天只能分離和識(shí)別出100種蛋白質(zhì)。據(jù)估計(jì),人體內(nèi)可能有幾十萬(wàn)種蛋白質(zhì),這大概需要10年時(shí)間進(jìn)行識(shí)別。
為了加快蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)程,以專(zhuān)業(yè)生產(chǎn)蛋白質(zhì)組學(xué)研究設(shè)備而著稱(chēng)的美國(guó)Genomic Solution Inc.公司開(kāi)發(fā)了完整的蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案,由一系列機(jī)械手臂與軟件,并結(jié)合了二維電泳實(shí)驗(yàn)設(shè)備與質(zhì)譜儀,可以進(jìn)行高效、自動(dòng)化且具重復(fù)性的試驗(yàn)分析。在Genomic solution值得信賴(lài)的技術(shù)平臺(tái)上,你的研究工作將更富成效,重復(fù)性更好。在這一整套Investigator平臺(tái)上,各儀器之間配合無(wú)隙,由于它的整合性及標(biāo)準(zhǔn)性,使得研究進(jìn)程大大加快,原來(lái)需要9—12個(gè)月才能獲得數(shù)據(jù)結(jié)果發(fā)表的時(shí)間減少到9—12周。這套完整的系統(tǒng)具備蛋白質(zhì)組研究所需的眾多功能:2-D電泳、圖像獲取、2-D膠分析、蛋白樣品切割、蛋白消化、MALDI樣品準(zhǔn)備、消化及點(diǎn)樣、數(shù)據(jù)分析整合,再加上制備好的膠、試劑及附件,使研究工作可以立即展開(kāi)。此套設(shè)備為進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)研究的利器,大大加速了蛋白質(zhì)分離和鑒定的速度。該系統(tǒng)主要由以下幾部分組成:
一、2-D電泳系統(tǒng)(Investigator™ 2-D Electophoresis System)
該系統(tǒng)主要進(jìn)行2D
PAGE第一向等電聚焦凝膠電泳和第二向SDS-PAGE電泳,設(shè)備包括2-D電泳系統(tǒng)所需的各種設(shè)備,如pHaser™(IPG膠條電泳)、管狀制膠設(shè)備、二維電泳裝置、電源設(shè)備、半導(dǎo)體冷卻器及各種相關(guān)的蛋白純化試劑盒。
產(chǎn)品特征:
* 提供2D PAGE電泳所需的各種設(shè)備,使電泳更加簡(jiǎn)便,大大節(jié)約研究時(shí)間
* 高分辨率:有效的第一向等電聚焦凝膠電泳和23cm X
23cm第二向SDS-PAGE大面積板膠提供清晰的電泳圖像,有效提高單體、磷酸化和糖基化蛋白的分離
* 大容量:可同時(shí)容納15塊1mm一維管狀膠,或8塊2-3mm管狀膠;10塊IPG膠條和10塊二維電泳板膠
* 靈活性:該系統(tǒng)用于管狀膠、IPG 膠條、預(yù)制膠、自制膠和SDS PAGE膠使用
* 恒溫:高效的半導(dǎo)體制冷裝置保證電泳體系溫度恒定,溫度變化< 0.5℃
* 專(zhuān)門(mén)為高分辨率2D PAGE而設(shè)計(jì)的電源系統(tǒng)
* 提供超純的相關(guān)化學(xué)試劑和藥品
二、蛋白凝膠成像系統(tǒng)(Investigator™ ProImage)
ProImage專(zhuān)業(yè)的蛋白凝膠成像系統(tǒng)提供高靈敏度、高分辨率的大面積蛋白凝膠成像和分析。
產(chǎn)品特征:
* 高靈敏度,高分辨率數(shù)字成像系統(tǒng)
* 12 bit冷CCD數(shù)碼相機(jī)系統(tǒng),大大提高圖像信噪比
* 提供白光和紫外光源,可對(duì)銀染、熒光、膠片、考馬斯亮藍(lán)、EB染色圖像進(jìn)行數(shù)字化
* 可以配合HT PC Analyzer蛋白質(zhì)組學(xué)分析軟件進(jìn)行各種圖像分析
* 多用途暗箱,保證無(wú)任何光線(xiàn)泄漏,免除實(shí)驗(yàn)室的暗房設(shè)備
* 對(duì)高靈敏蛋白熒光染色劑SYPRO® Ruby染色圖像進(jìn)行最優(yōu)化
* 光照均勻,最大成像面積達(dá)25 x 28 cm
三、蛋白質(zhì)點(diǎn)自動(dòng)切取機(jī)器人平臺(tái)(Investigator™ ProPic Workstation)
Investigator™ ProPic工作站主要用于2-D蛋白凝膠上蛋白質(zhì)點(diǎn)的自動(dòng)切取,可對(duì)考馬斯亮藍(lán)、銀染、熒光染色的蛋白凝膠進(jìn)行操作,廣泛應(yīng)用于制藥公司、大學(xué)和重點(diǎn)研究所等進(jìn)行高通量蛋白質(zhì)組學(xué)研究的單位。Investigator ProPic是第一個(gè)將2-D凝膠成像分析和蛋白質(zhì)點(diǎn)自動(dòng)切取兩個(gè)功能整合在一起的機(jī)器人工作站,主要為蛋白質(zhì)組學(xué)研究的后續(xù)分析采集和提供樣品,該產(chǎn)品市場(chǎng)占有率在同類(lèi)產(chǎn)品中最高。
產(chǎn)品組成:
*硬件部分:密閉暗箱及帶有XYZ機(jī)器人手臂,具有100mm的切割精度,內(nèi)置可換光源(白光和紫外光源),能容納8塊96微孔樣品板的樣品盤(pán),并裝配Gilson泵系統(tǒng)和12位高分辨率冷CCD數(shù)碼相機(jī)的成像系統(tǒng)。凝膠成像和蛋白質(zhì)點(diǎn)切取功能的整合,使得成像后凝膠不必移動(dòng)而原位切取,避免移動(dòng)過(guò)程中產(chǎn)生的位移和污染;切取結(jié)束后,可再次原位成像,檢查切取結(jié)果準(zhǔn)確性;可對(duì)操作過(guò)程實(shí)時(shí)監(jiān)控。切取速度達(dá)120個(gè)/小時(shí);全封閉的操作環(huán)境,有效防止角蛋白污染;超聲水浴清洗和泵沖洗兩種方式清洗槍頭,有效防止樣品交叉污染;污染最小化。內(nèi)置水合裝置,有效避免操作過(guò)程中因凝膠變干而影響切取準(zhǔn)確性和樣品回收率。
* 軟件: HT Investigator PC Analyzer and
Database,能進(jìn)行高通量的蛋白凝膠圖像分析,功能強(qiáng)大,處理量大;專(zhuān)業(yè)軟件ProPic能自動(dòng)控制數(shù)碼相機(jī)曝光和切割機(jī)器人的采樣操作;可由軟件分析自動(dòng)生成蛋白質(zhì)點(diǎn)切取列表,亦可通過(guò)手動(dòng)的point-click模式生成切取列表,在8小時(shí)的操作周期內(nèi)無(wú)需專(zhuān)人管理,完全自動(dòng)化,結(jié)果可靠。操作系統(tǒng):Microsoft
Windows 98/NT。
四、蛋白凝膠圖像分析專(zhuān)業(yè)軟件(Investigator™ HT PC Analyzer)
該軟件適用于大規(guī)模、高通量蛋白質(zhì)組學(xué)研究實(shí)驗(yàn)室,能快速處理大量2-D蛋白電泳凝膠圖像,能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)點(diǎn)進(jìn)行自動(dòng)識(shí)別、定量和比較;軟件功能強(qiáng)大、界面友好,容易使用。
產(chǎn)品特征:
* 能自動(dòng)識(shí)別、定量和比較2-D蛋白凝膠圖像;
* 自動(dòng)計(jì)算2-D凝膠上蛋白質(zhì)點(diǎn)的分子量和pI值;
* 能自動(dòng)生成蛋白表達(dá)量變化曲線(xiàn)或柱形圖
* 自動(dòng)化、批處理和強(qiáng)大的編輯功能大大加快研究進(jìn)程
* 通過(guò)創(chuàng)建True Average Gels克服樣品和試驗(yàn)誤差
* 能進(jìn)行半自動(dòng)或全自動(dòng)蛋白質(zhì)點(diǎn)匹配,不需用戶(hù)提供標(biāo)記
* 可對(duì)多塊相應(yīng)凝膠上的蛋白質(zhì)點(diǎn)數(shù)據(jù)進(jìn)行T-檢驗(yàn)或其它統(tǒng)計(jì)分析;
* 數(shù)據(jù)可以傳送給Investigator ProPic™自動(dòng)工作站進(jìn)行蛋白質(zhì)點(diǎn)自動(dòng)切割;
* 帶有HT PC 數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng),可以方便進(jìn)行蛋白研究的數(shù)據(jù)查詢(xún)和數(shù)據(jù)管理;
五、自動(dòng)化蛋白酶解工作站(Investigator™ ProGest)
Investigator ProGest自動(dòng)化蛋白酶解工作站是進(jìn)行全自動(dòng)蛋白酶解的最佳選擇,適合于從2D或SDS-PAGE膠上切取膠塊的自動(dòng)化酶解。通過(guò)觸摸式顯示屏界面方便地進(jìn)行反應(yīng)程序的設(shè)定,從而實(shí)現(xiàn)酶解過(guò)程中的自動(dòng)清洗,加酶和恒溫孵育步驟循環(huán)。
產(chǎn)品特征:
* 進(jìn)行自動(dòng)化、高通量的蛋白斑點(diǎn)酶解
* 自動(dòng)化操作和溫控反應(yīng)系統(tǒng)節(jié)約反應(yīng)時(shí)間,提高反應(yīng)效率,微處理器精確控制酶解反應(yīng)條件
* 內(nèi)置加熱平臺(tái)
* 專(zhuān)利的Flow-through技術(shù),提高反應(yīng)效率
* 能夠同時(shí)進(jìn)行96個(gè)樣品反應(yīng),每輪反應(yīng)時(shí)間為6.5小時(shí)
* 自動(dòng)控制酶解反應(yīng)循環(huán)時(shí)間,每天可進(jìn)行兩輪反應(yīng)
* 氮?dú)庹龎,超凈環(huán)境
六、自動(dòng)化MALDI點(diǎn)樣工作站(Investigator™ ProMS MALDI Spotting Workstation)
Investigator™ ProMS 系統(tǒng)用于蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析前的樣品濃縮、脫鹽和MALDI點(diǎn)樣,點(diǎn)樣的多肽可以進(jìn)行后續(xù)的質(zhì)譜分析,ProMS適用于大多數(shù)商業(yè)化的MALDI target。
產(chǎn)品特征:
* 軟件操作方便,可根據(jù)用戶(hù)需要進(jìn)行定制,應(yīng)用靈活,可遠(yuǎn)程控制,高通量。
* 溶液反應(yīng)體系可對(duì)反應(yīng)精確控制,多肽的反向洗脫增加檢測(cè)靈敏度。
* 提供正壓的干凈空氣
* 可以使用ZipTips™或類(lèi)似產(chǎn)品
* 96孔規(guī)格
* 單泵分裝
* 低流速(20 µl/min)增加純化效率
七、自動(dòng)化蛋白質(zhì)酶解點(diǎn)樣工作站(Investigator™ ProPrep Workstation)
Investigator™ ProPrep Workstation將能夠自動(dòng)完成凝膠蛋白質(zhì)點(diǎn)酶解及酶解后樣品的濃縮,脫鹽和MALDI點(diǎn)樣等一系列過(guò)程,通過(guò)4個(gè)樣品針頭同時(shí)操作使得實(shí)驗(yàn)結(jié)果高效和自動(dòng)化。該儀器簡(jiǎn)化了蛋白質(zhì)組學(xué)研究的繁瑣步驟,大大加快了研究的實(shí)驗(yàn)進(jìn)程。酶解后的樣品適用于多種后續(xù)分析,包括LC(液相色譜)和CE(毛細(xì)管電泳),尤其適用于質(zhì)譜分析,如MALDI
TOF和MS/MS。該系統(tǒng)的酶解和MALDI點(diǎn)樣兩個(gè)操作過(guò)程可以分開(kāi)單獨(dú)進(jìn)行,也可以整合成一個(gè)完整的過(guò)程進(jìn)行自動(dòng)化操作。
產(chǎn)品特征:
* 多功能:同時(shí)具有自動(dòng)化蛋白質(zhì)酶解和MALDI點(diǎn)樣功能
* 高通量:酶解樣品處理能力達(dá)1536個(gè)/天或更多;MALDI點(diǎn)樣速度因方法和介質(zhì)不同而不同
* 無(wú)污染:獨(dú)特的反應(yīng)槽設(shè)計(jì)有效地防止樣品交叉污染,HEPA濾過(guò)的干凈操作環(huán)境,有效防止角蛋白污染;自動(dòng)化操作減少了手動(dòng)接觸污染
* 靈活性:提供4*96和8*96的樣品盤(pán)滿(mǎn)足不同通量的需求
* 操作方便:Window
2000系統(tǒng)和15寸平面液晶顯示屏使得操作更舒適方便;軟件•操作簡(jiǎn)單,PC內(nèi)置軟驅(qū)和CD-ROM及10/100M網(wǎng)卡,使數(shù)據(jù)交換和共享更容易。
* 靈敏度達(dá)125 fmol
八、RADARS/MS™快速數(shù)據(jù)管理和檢索系統(tǒng)(Rapid Data Archival and Retrieval System )
作為Genomic Solutions Inc.公司旗艦產(chǎn)品的RADARS/MS™快速數(shù)據(jù)管理和檢索軟件系統(tǒng),是一個(gè)完整的蛋白質(zhì)組學(xué)研究智能平臺(tái)。它整合了客戶(hù)機(jī)/服務(wù)器,數(shù)據(jù)庫(kù)和外聯(lián)網(wǎng)(extranet)應(yīng)用軟件,可以方便地進(jìn)行蛋白質(zhì)的分析鑒定和傳輸。它提供目前最快、最可信和最完整的蛋白鑒定解決方案。通過(guò)RADARS/MS系統(tǒng)可以方便分析大量的蛋白質(zhì)組學(xué)研究數(shù)據(jù),快速發(fā)現(xiàn)和確認(rèn)藥靶及疾病標(biāo)志物,尤其適合于蛋白質(zhì)組學(xué)研究中心、重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和制藥公司。
特點(diǎn):
* 能自動(dòng)化分析大量質(zhì)譜數(shù)據(jù)
* 蛋白序列和質(zhì)譜數(shù)據(jù)自動(dòng)對(duì)應(yīng)
* 快速分析蛋白翻譯后修飾位點(diǎn)
* 蛋白組研究的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和分析結(jié)果能進(jìn)行快速數(shù)據(jù)庫(kù)儲(chǔ)存
* 對(duì)MS和MS/MS結(jié)果數(shù)據(jù)能進(jìn)行快速自動(dòng)化的數(shù)據(jù)庫(kù)查詢(xún)和蛋白鑒定
* 提供清晰、有效的結(jié)果可視化和注釋工具
Genomic Solution Inc.系列儀器及軟件為蛋白質(zhì)組學(xué)研究提供了完整的解決方案,大大加快了研究進(jìn)程,提高了實(shí)驗(yàn)效率。該系統(tǒng)非常靈活,用戶(hù)可以根據(jù)自己現(xiàn)有的設(shè)備情況,有選擇性地配備Genomic Solution Inc.系列儀器及軟件,形成適合自己的一整套完整蛋白組學(xué)研究系統(tǒng)。
Genomic Solutions references:
http://www.genomicsolutions.com
http://www.luhs.org/depts/path/
molecular/genomics.htm#PROTEOMICS
http://www.abdn.ac.uk/~gen069/proteomics.htm
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