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STRs分析

STRs分析


short tandem repeat, STR
短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat, STR)是基因組染色體上一種可遺傳的、體細(xì)胞穩(wěn)定性的、且具有高度多態(tài)性的短核苷酸重復(fù)序列,具有種類多,分布廣等特點(diǎn)。
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最后更新:2009-12-8半年訪問:23
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STRs分析 
       短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat, STR)是基因組染色體上一種可遺傳的、體細(xì)胞穩(wěn)定性的、且具有高度多態(tài)性的短核苷酸重復(fù)序列,具有種類多,分布廣等特點(diǎn)。這種多態(tài)性標(biāo)志已廣泛用于遺傳多樣性分析、連鎖圖譜制作、疾病連鎖分析和家系標(biāo)識(shí)等研究。

     作為主要的STRs分析手段,GeneScan是一種用途廣泛的DNA片斷分析技術(shù),與傳統(tǒng)方法相比,GeneScan具有快捷、精確度高和通量大的優(yōu)點(diǎn)。諾賽基因通過ABI3700型測(cè)序儀為國(guó)內(nèi)外客戶提供高品質(zhì)的基于GeneScan技術(shù)的STRs分析相關(guān)服務(wù)。

全基因組掃描 
     我們使用ABI全基因組掃描試劑盒提供全基因組掃描服務(wù),該項(xiàng)技術(shù)選用ABI-Perlin-Elmer公司提供的382個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記,覆蓋了人類基因組(22條常染色體,2條性染色體)的所有區(qū)域。

特定區(qū)域位點(diǎn)的掃描 

特點(diǎn):

     針對(duì)某一染色體的可疑區(qū)域,選取部分微衛(wèi)星位點(diǎn)進(jìn)行掃描服務(wù),具體項(xiàng)目包括實(shí)驗(yàn)方案設(shè)計(jì)、根據(jù)方案進(jìn)行PCR、ABI 3700型測(cè)序儀數(shù)據(jù)采集、利用專業(yè)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和最終的連鎖分析等。

Ø    技術(shù)平臺(tái):ABI3100和3730,基因型分析軟件,熒光標(biāo)記OLIGO的化學(xué)合成

Ø    若您研究的位點(diǎn)較多,為了節(jié)約您的成本,我們一個(gè)泳道可以同時(shí)檢測(cè)三種不同的熒光

實(shí)驗(yàn)流程:

Ø    客戶收集標(biāo)本,提取DNA

Ø    確定STR位點(diǎn),設(shè)計(jì)試驗(yàn)方案,包括熒光標(biāo)記的選擇、引物的設(shè)計(jì)、合成和標(biāo)記,熒光分子量?jī)?nèi)標(biāo)的選用等

Ø    PCR,并瓊脂糖電泳檢測(cè),若PCR產(chǎn)物特異性不夠,將進(jìn)行優(yōu)化

Ø    PCR產(chǎn)物通過測(cè)序儀電泳檢測(cè),獲得擴(kuò)增片斷大小的數(shù)據(jù)

Ø    數(shù)據(jù)處理

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