454測(cè)序技術(shù)服務(wù)(GS FLX系統(tǒng)超高通量測(cè)序)

特色 

Ø    支持各種不同來源的樣品：包括基因組DNA，PCR產(chǎn)物 
Ø    BAC，cDNA，小分子RNA等等 

Ø    提供了完整的從樣品制備到后續(xù)的生物信息學(xué)分析解決方案 

Ø    為目前遺傳分析和功能基因組等熱門研究領(lǐng)域的部分熱門課題 

Ø    提出了全新的應(yīng)用方案。針對(duì)不同客戶的不同需求，量身定做不同的測(cè)序解決方案

原理  

       454 GS FLX 基因組測(cè)序儀的原理是通過焦磷酸鹽測(cè)序原理與微流體技術(shù)的整合。它是一種新的依賴生物發(fā)光進(jìn)行 DNA 序列分析的技術(shù)，在 DNA 聚合酶、 ATP 硫酸化酶、熒光素酶和雙磷酸酶的協(xié)同作用下，將引物上每一個(gè) dNTP 聚合與一次熒光信號(hào)釋放偶聯(lián)起來，通過檢測(cè)熒光的釋放和強(qiáng)度，達(dá)到實(shí)時(shí)測(cè)定 DNA 序列的目的，此技術(shù)不需要熒光標(biāo)記的引物或核酸探針，也不需要進(jìn)行電泳，具有分析結(jié)果快速、準(zhǔn)確、靈敏度高和自動(dòng)化的特點(diǎn)。 

服務(wù)流程 

Ø    剪切、連接：基因組DNA“剪切”成300－800個(gè)堿基的片斷，然后和兩個(gè)銜接子A、B進(jìn)行平端連接。A、B 銜接子各自含有20個(gè)堿基的PCR 引物序列、20個(gè)堿基的測(cè)序引物序列和4個(gè)堿基的對(duì)照序列（TACG），除此之外，B銜接子的5’端還標(biāo)記有一個(gè)生物素基團(tuán)，供后續(xù)的分離合適的測(cè)序模板使用 

Ø    單鏈DNA模板的分離 

Ø    emPCR （emulsion PCR）：僅含有A、B銜接子單鏈DNA模板和過量的DNA 捕捉珠子退火結(jié)合，并被吸附到一種用于PCR反應(yīng)的油-水混合物的小滴上，以單鏈的DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增，結(jié)果得到大量同一序列的DNA鏈 
Ø    測(cè)序反應(yīng) 

提供服務(wù) 

Ø     全基因組測(cè)序 

（1）多達(dá)120 Mb的未知基因組的測(cè)序  
－生成基因組結(jié)構(gòu)概圖 
－研究DNA序列的組織，分布和信息 
－基因篩查：尋找新基因，定位和功能 
－和其他基因組進(jìn)行比較研究   
－識(shí)別單堿基突變 
－識(shí)別突變熱點(diǎn)和保守區(qū)域 
－識(shí)別插入或者缺失的基因 
－斷定基因型和表型之間的相關(guān)關(guān)系（比如，研究藥物抗性的遺傳基礎(chǔ)）  
－基于基因測(cè)序變化進(jìn)行毒性預(yù)測(cè) 
－進(jìn)行流行病學(xué)分析 
－了解工業(yè)生產(chǎn)菌株和它們的親代菌株序列上的差異作為進(jìn)行工業(yè)生產(chǎn)菌株開發(fā)的遺傳基礎(chǔ) 
－進(jìn)行宏基因組 （metagenomics）研究 
－古代化石DNA 測(cè)序研究 
（2）比較基因組及分子進(jìn)化分析：序列同源比對(duì)、通過相鄰物種的比較基因組研究進(jìn)行進(jìn)化分析、基因注釋、功能分類等        
（3）利用配對(duì)末端方法（Pair-End Tag）將Contigs拼接成Scaffolds。 
  
Ø    轉(zhuǎn)錄組和基因調(diào)節(jié)研究 

（1）基于短Tags，ESTs, ChIP，或者GIS-PET序列的高通量轉(zhuǎn)錄組分析，或者miRNA 序列的基因組范圍識(shí)別，小分子和非編碼RNA的測(cè)序。 
（2）研究DNA的甲基化模式來進(jìn)行基因調(diào)節(jié)的研究。  
Ø    擴(kuò)增產(chǎn)物分析 

PCR產(chǎn)物的超精細(xì)測(cè)序（應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究的重測(cè)序）  
－在混合的腫瘤樣本中識(shí)別體細(xì)胞突變 
－在群體水平上發(fā)現(xiàn)高可信度的SNP位點(diǎn)   
Ø    信息分析 

（1）基本信息分析：圖像識(shí)別，basecalling，過濾接頭序列，檢測(cè)可能的樣品污染。  
（2）高級(jí)信息分析  
A 基因組注釋：包括基因組組分分析、基因預(yù)測(cè)、重復(fù)序列注釋、Non-coding RNA預(yù) 測(cè)和假基因（Pseudogene）注釋等。 
B 基因的功能注釋及分類: 通過比對(duì)軟件（Blast系列軟件包）與公共數(shù)據(jù)中序列做同源性聯(lián)配，在保證嚴(yán)格置信度標(biāo)準(zhǔn)前提下，對(duì)基因進(jìn)行功能注釋。最全面數(shù)據(jù)庫的使用，保證所得數(shù)據(jù)與國際同步，最大限度挖掘基因組信息。

北京諾賽基因組研究中心有限公司（諾賽基因）是基于基因組學(xué)研究的生物高科技企業(yè)，公司的發(fā)展目標(biāo)是實(shí)現(xiàn)最新生物醫(yī)藥研究成果的產(chǎn)業(yè)化。諾賽基因致力于自有知識(shí)產(chǎn)權(quán)的創(chuàng)新藥物的開發(fā)，生物標(biāo)志的鑒定與疾病診斷/預(yù)警檢測(cè)技術(shù)的研發(fā)，生物制品與試劑的生產(chǎn)，中國人群遺傳資源和臨床資源的收集、保護(hù)、利用與開發(fā)，以及生物科技領(lǐng)域相關(guān)技術(shù)的培訓(xùn)、咨詢和服務(wù)。

1998年9月，北京諾賽基因組研究中心有限公司由北京生物技術(shù)和新醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)促進(jìn)中心和北京博大科技投資開發(fā)有限公司投資，中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院/中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)、北京大學(xué)、中國科學(xué)院、軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院等單位參與組建成立。

諾賽基因開展與人類疾病相關(guān)的基因組學(xué)、功能基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究。1998年10月，國家科技部批準(zhǔn)在諾賽基因的基礎(chǔ)上成立國家人類基因組北方研究中心，作為國家級(jí)研究基地。

諾賽基因自成立以來，整合以北京為中心的科研院所以及臨床醫(yī)院在基因組學(xué)及相關(guān)領(lǐng)域的科研力量，建立了具有世界級(jí)水平的生物學(xué)研究實(shí)驗(yàn)室，組建了包括8位院士在內(nèi)的、由26位生物和醫(yī)藥領(lǐng)域資深科學(xué)家組成的智囊團(tuán)，組織并培養(yǎng)了一支由近百名科技人員組成的具有豐富研發(fā)經(jīng)驗(yàn)的科研團(tuán)隊(duì)。

諾賽基因現(xiàn)已成功完成和正在進(jìn)行863、973等國家重點(diǎn)課題及合作項(xiàng)目74項(xiàng)，參與并完成了1%國際人類基因組測(cè)序項(xiàng)目，承擔(dān)了致病微生物基因組測(cè)序、中國人群?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性（SNP）檢測(cè)及疾病基因組學(xué)研究等多項(xiàng)國家科研項(xiàng)目。截止目前，諾賽基因已申請(qǐng)專利28族。