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大片斷DNA測(cè)序
文庫(kù)構(gòu)建;大規(guī)模測(cè)序;生物信息分析(諾賽擁有ABI3730xl測(cè)序平臺(tái)和齊全的配套設(shè)施,其鳥槍法測(cè)序(Shotgun Sequencing),采用直接將整個(gè)基因組打成2KB左右的DNA片段,把這些DNA片斷裝入適當(dāng)?shù)妮d體,構(gòu)建Shotgun文庫(kù),從中隨機(jī)挑選克隆片斷進(jìn)行測(cè)序,最后運(yùn)用生物信息學(xué)方法將測(cè)序片段拼接成全基因組序列。)
服務(wù)類別:測(cè)序/合成總訪問(wèn):1887
最后更新:2009-12-7半年訪問(wèn):51
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大片斷DNA測(cè)序

     諾賽擁有ABI3730xl測(cè)序平臺(tái)和齊全的配套設(shè)施,其鳥槍法測(cè)序(Shotgun Sequencing),采用直接將整個(gè)基因組打成2KB左右的DNA片段,把這些DNA片斷裝入適當(dāng)?shù)妮d體,構(gòu)建Shotgun文庫(kù),從中隨機(jī)挑選克隆片斷進(jìn)行測(cè)序,最后運(yùn)用生物信息學(xué)方法將測(cè)序片段拼接成全基因組序列。我們具有成熟的文庫(kù)構(gòu)建平臺(tái),專業(yè)的實(shí)驗(yàn)人員,嚴(yán)格的庫(kù)檢流程。
特色
  Ø     服務(wù)內(nèi)容:文庫(kù)構(gòu)建;大規(guī)模測(cè)序;生物信息分析 
       Ø     應(yīng)用范圍:任何物種基因組、fosmid、cosmid、BAC、病毒、線粒體、葉綠體等   

服務(wù)流程
  Ø      用物理方法對(duì)純化的大片斷DNA進(jìn)行切斷處理,隨后建立高度隨機(jī)、插入片段大小為2kb左右的基因組文庫(kù)。 
  Ø     高效、大規(guī)模的末端測(cè)序。 
  Ø       應(yīng)用生物信息學(xué)軟件將相互重疊的讀出序列組裝成連續(xù)的最小重疊群。 
  Ø       填補(bǔ)缺口。采用傳統(tǒng)的Primer walking、PCR測(cè)序和新一代454或solex測(cè)序技術(shù)相結(jié)合的方式來(lái)完成補(bǔ)洞。 
  Ø        基因注釋。提供基因組分析和已知功能基因注釋等生物信息學(xué)分析。 
客戶提供
  Ø      對(duì)植物、動(dòng)物、微生物組織,請(qǐng)?zhí)峁┳懔康男迈r樣品(4℃保存,不超過(guò)一天)或?qū)⑿迈r樣品立即存于液氮或-80℃,在一周內(nèi)寄樣 
  Ø         若用植物樣品建基因組文庫(kù),為了減少文庫(kù)中的葉綠體污染,樣品須是植物的黃化苗嫩芽 
質(zhì)量
  Ø         精細(xì)圖,基因組覆蓋度大于95%,基因區(qū)覆蓋達(dá)到98%以上,單堿基錯(cuò)誤率低于十萬(wàn)分之一 
  Ø         完成圖,填補(bǔ)gaps,序列覆蓋率和準(zhǔn)確率在99.99%以上
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