一箭三雕，一張芯片同時檢測 lncRNA、circRNA、mRNA。

1、ceRNA 芯片設計了 173011 個探針，其中 mRNA 探針 34549 個，lncRNA 探針 32953 個，circRNA 探針 105509 個。mRNA 來源于 refseq（25830）和 ensembl（8719）；lncRNA 分別來源于 Ensembl（28130）、lncipedia（4822）、genecode（1）3 個數據庫。circRNA 探針有 105509 條。
2、LncRNA 主要包含 lincRNA，antisense lncRNA，bi-directional lncRNA 三大類，避免了 lncRNA 和 mRNA 的相互干擾，提高了 lncRNA 的檢測有效性和準確性。該版本芯片也剔除了上一版本中沒有明確注釋信息的 lncRNA。
3、CircRNA 依然是該芯片主要的檢測對象，與 V2.0 版本相比，circRNA 的探針數目由 88750 增加到了 105509，除了涵蓋 2.0 版本的 ciccFRNA 外，還增加了與 miRNA 有多個結合位點的 circRNA，提升了 circRNA 作為 ceRNA 參與疾病調控的機制研究的效率。circRNA 特異性高：circRNA - 特異的反向剪接位點探針設計，保證每個探針檢測的特異性，避免與母基因之間的冗余影響。
4、ceRNA 芯片 采用 Agilent eArray 平臺設計，使用 Agilent SurePrint 技術合成，探針長 60mer，檢出率高，技術重復性高于 99%，穩(wěn)定性好；能夠比高通量測序技術更靈敏、穩(wěn)定地對表達豐度較低的 circRNA、lncRNA 進行檢測分析。
5、ceRNA 芯片 覆蓋 circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片數據同時提供三個層面的表達信息，circRNA 和 lncRNA 作為典型的內源競爭性 RNA（ceRNA 機制），此款芯片更適合 ceRNA 調控研究。
6、除了常規(guī)的組織和細胞樣本以外，還適用于外泌體，血清，血漿等特殊樣本的檢測。


1、更適合檢測微量樣本：特異性檢測血清、血漿、外泌體等微量特殊樣本中 lncRNA 和 circRNA，避免 rRNA 或外源性序列干擾。
2、更全面的 circRNA 信息：涵蓋截至 2020 年 6 月全球主流數據庫中的 circRNA 序列 105509 條，并進行了細致注釋。
3、更適合檢測 lncRNA：芯片比測序更適合檢測低表達豐度的 lncRNA 分子。
4、更豐富的芯片實驗經驗：擁有超過十五年的芯片實驗經驗，輕松應對各種來源的樣本。
5、更系統(tǒng)的實驗服務：篩選出候選 lncRNA 和 circRNA 后，配套豐富的 lncRNA 功能驗證實驗服務。


Agilent 芯片平臺


1、成熟的服務平臺：穩(wěn)定而系統(tǒng)的芯片實驗全面解決方案，可為客戶提供總 RNA 抽提、樣品質檢、RNA 標記、雜交、洗脫、圖像掃描、數據分析等一系列服務。
2、專業(yè)的實驗人員：從 RNA 抽提到芯片雜交均配備有專業(yè)的實驗人員，具有豐富的芯片實驗操作經驗，遵循嚴格的質控標準，層層把關確保高質量完成實驗。
3、強大的分析團隊：實戰(zhàn)經驗豐富的分析團隊，除能快速完成基礎分析外，還能根據客戶需求完成個性化分析，提供各類高大上的圖表。
4、穩(wěn)健的支持團隊：一對一服務，為您解決項目全過程中的各類問題，包括但不限于項目方案制定、樣本收集、數據結果解讀、數據深度挖掘及文章發(fā)表支持等。

 

膠質母細胞瘤（GBM) 是常見的原發(fā)性惡性腦腫瘤，多發(fā)生于中樞神經系統(tǒng)，是人類致命的癌癥之一。傳統(tǒng)的 GBM 治療方法術后易復發(fā)，預后差，平均存活期約為 15 個月，而個性化治療往往存在成功率低且副作用大的問題。因此，急需開發(fā)新的特別是那些針對復雜基因調控網絡的治療方法。

本研究利用 ceRNA 芯片（上海伯豪提供）篩選 GBM 中差異表達的非編碼 RNA，通過 TargetScan 預測和 pulldown 實驗，鎖定了研究目標 circRNA—circNT5E。體內外表型研究結果顯示 circNT5E 不僅對 GBM 細胞的增殖、凋亡、遷移及侵襲有影響，還能有效促進體內 GBM 腫瘤的形成。功能研究實驗結果顯示 circNT5E 通過與 miRNA-422a 的結合，解除 miRNA-422a 對其下游靶基因的抑制作用，激活 Akt、Smad2 等信號通路來影響 GBM 細胞的增殖、凋亡、遷移及侵襲。

作       者：Wang R, Zhang S, Chen XY, Li N, Li JW, Jia RC, Pan YQ, Liang HQ.
項目發(fā)文：CircNT5E acts as a sponge of microRNA-422a topromote glioblastoma tumorigenesis. Cancer Res. 2018. 78(17):4812-4825.

肺癌是常見的癌癥，80-85% 的人類肺癌是非小細胞肺癌（NSCLC），其中肺鱗癌（LUSC）和肺腺癌（LUAD）是主要的亞型。目前用于特定基因突變的靶向藥物的開發(fā)極大地改善了晚期 LUAD 患者的治療效果，但這一方法對 LUSC 見效甚微。因此，進一步了解 LUSC 發(fā)展的分子機制對于開發(fā)更有效的治療方案至關重要。

研究人員利用 ceRNA 芯片（上海伯豪提供）對 LUSC 及其臨近正常組織進行了 circRNA 檢測，通過共表達分析及 qPCR 驗證，確定目標 circRNA-circTP63。體內外敲減及過表達實驗表明 circTP63 能夠促進腫瘤細胞增殖和腫瘤生長，且與細胞周期進展相關。共表達分析及 circTP63 敲減 / 過表達分析，確定 FOXM1 為 circTP63 靶基因。進一步生信分析及功能獲得 / 缺失實驗確定 circTP63 是通過 miR-873-3p 作用于 FOXM1 及下游基因 CENPA 和 CENPB，促進細胞周期的進展，進而促進 LUSC 細胞的增殖和腫瘤生長。

作       者：Cheng Zhuoan, Yu Chengtao, Cui Shaohua et al.
項目文章：circTP63 functions as a ceRNA to promote lung squamous cell carcinoma progression by upregulating FOXM1.[J] .Nat Commun, 2019, 10:3200.

上海伯豪生物技術有限公司（簡稱：伯豪生物，英文名：Shanghai Biotechnology Corporation）2008 年 12 月成立，是生物芯片國家工程研究中心的有機組成部分，專注于提供專業(yè)的生物醫(yī)藥和疾病診斷創(chuàng)新技術、產品和優(yōu)質服務。

伯豪生物自成立以來獲得了國家基因檢測技術應用示范中心、國家工信部專精特新“小巨人”企業(yè)、院士專家工作站、高新技術企業(yè)、上海市研發(fā)公共服務平臺（負責“上海市高通量疾病標志物服務平臺”和“上海市基因芯片專業(yè)服務平臺”的運營）、上海市服務外包公共平臺、上�？萍夹【奕似髽I(yè)、浦東新區(qū)企業(yè)研發(fā)機構、聯(lián)合實驗室建設等一系列資質，擁有醫(yī)療機構執(zhí)業(yè)許可證、醫(yī)療器械經營許可證。

伯豪生物于 2016 年入選國家發(fā)展和改革委員會首批基因檢測技術應用示范中心，與復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院、上海市胸科醫(yī)院、上海市兒童醫(yī)院、上海生物信息技術研究中心等單位共同承擔運行“高發(fā)腫瘤及遺傳性疾病基因檢測示范中心”。

伯豪生物建立了規(guī)范化的質量控制體系，通過了 ISO9001:2015 質量技術體系的認證，并參照 GLP- L 的標準，通過 156 個 SOP 文件對項目、樣品、實驗過程、生物信息分析過程、數據信息管理、保密等進行嚴格質控。

伯豪生物累計技術服務 10 余年，承接項目數超 10000 個，用戶單位 3000 家以上，累計處理樣品超過 30 萬份，協(xié)助客戶發(fā)表論文 2000 余篇，總影響因子（IF）超 10000 分，平均影響因子（IF）大于 5 分。全面推動中國基因組學服務產業(yè)發(fā)展�？煽康馁|量已經得到了國內及國際科研領域的認可！伯豪生物秉承著“服務科技創(chuàng)新，護航人類健康！”的使命，為每一位伯豪生物客戶提供專注、專業(yè)、高效的科研技術服務。

伯豪生物經過十多年不斷投入和持續(xù)打造，伯豪生物已經成長為一家硬件精良，人才合理，技術專業(yè)，管理規(guī)范，理念先進，符合國際標準的以技術開發(fā)和技術服務見長的生物技術公司。