二維凝膠電泳技術(shù)中要求最高，最重要的部分，是對(duì)得到的蛋白質(zhì)圖像進(jìn)行分析，圖像信息將被比較及自動(dòng)化分析。比較二維凝膠圖像以檢測(cè)單個(gè)樣品或不同群體之間蛋白質(zhì)的定性和/或定量表達(dá)變化。二維凝膠的成像分析可以提供各種類(lèi)型的信息，以檢測(cè)新型、缺失或修飾的蛋白質(zhì)，蛋白質(zhì)斑點(diǎn)的定量，蛋白質(zhì)斑點(diǎn)的pI和Mr值測(cè)定，酶解和質(zhì)譜檢測(cè)。

蛋白質(zhì)圖像分析

為了分析和比較復(fù)雜的二維圖像，需要使用掃描儀或相機(jī)將凝膠圖像信息轉(zhuǎn)換為數(shù)字信息，以便使用計(jì)算機(jī)軟件進(jìn)行深入分析。在圖像分析過(guò)程中，一般使用100 mm的像素進(jìn)行掃描，較高的像素分辨率并不能改善圖像分析質(zhì)量，反而導(dǎo)致圖像文件太大而無(wú)法在合理的時(shí)間內(nèi)處理完畢，且會(huì)占用大量硬盤(pán)空間。