金開瑞生物擁有分子生物學、蛋白質組學、蛋白表達、抗體制備、試劑盒合作開發(fā)、檢測分析等六大服務平臺,專業(yè)為生物技術領域的科研人員提供高質量的生物技術外包服務。
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SILAC ( Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture)技術是利用哺乳動物細胞增殖對必需氨基酸的依賴性原理而設計的代謝標記蛋白質的方法。SILAC技術應用于定量蛋白質組研究,為全面、系統(tǒng)地定性和定量分析復雜哺乳動物細胞蛋白質組提供了有效的方案,是目前的、進行細胞中蛋白質相互作用和蛋白質表達差異的定量蛋白質組學技術。
金開瑞提供SILAC定量蛋白質組技術服務,可用于多個樣品或同一樣品不同條件下全細胞蛋白或亞細胞蛋白的差異比較,直接判定蛋白質表達水平差異、區(qū)分特異性和非特異性相互作用等。與其他相對定量的質譜技術相比,存在靈敏度高、定量準確,且實驗誤差小等優(yōu)勢。
一、服務特色
技術特點
1、高效性:SILAC是體內標記技術,標記效率可高達100%;
2、定量精確,線性范圍廣,降低由于樣品制備、實驗操作和儀器設備造成的實驗誤差,定量重復性好;
3、體內代謝標記與SDS-PAGE或色譜分離技術相結合,兼容疏水性蛋白和偏堿性蛋白,不受蛋白性質限制;
4、由于該技術屬于體內標記,標記效果穩(wěn)定,其標記效率不受裂解液的影響,不僅適合于進行全細胞蛋白的分析,還適合于膜蛋白的鑒定和定量;
5、與化學標記相比,SILAC方法蛋白需要量明顯減少,通常每個樣品只需要幾十微克的蛋白量;
6、活體標記,更接近樣品真實狀態(tài);
7、相容性:可以對多種在DMEM或RPMI 1640培養(yǎng)基中能夠培養(yǎng)的細胞或細菌中表達的蛋白進行標記。
適用范圍
只適用于活體培養(yǎng)的細胞,對于生物醫(yī)學研究中常用的組織樣品,體液樣品等無法分析,對于動物模型的標記成本太大,無法實現物種已知基因組序列、ESTs或蛋白質組全庫序列。
二、服務說明
服務流程
接受訂單及樣品——蛋白提取——SDS-PAGE分離——蛋白酶解——HPLC分離——LC-MS/MS——數據解析——結果交付
客戶提供
需鑒定的樣品;
樣品信息單,需詳細填寫樣品來源、含量、狀態(tài)及其他基本信息。
最終交付
實驗報告一份,含具體實驗流程及蛋白質組鑒定及定量結果(生物信息學分析)。
生物信息學分析內容包括:
SWATH 參考譜圖數據庫構建:通過DDA模式的掃描結果,譜圖數據庫構建、全譜鑒定及結果可靠性評估
SWATH定量:根據二級碎片離子的全掃描結果實現二級離子的定量;SWATH結果可靠性分析;差異表達分析;層次聚類;PCA分析等。
蛋白質功能注釋:包括GO注釋、COG分類和KEGG Pathway分析
差異蛋白功能富集:包括GO富集、Pathway富集
差異蛋白網絡互作:基于STRING 數據庫的PPI分析,基于Cytoscape的可視化展示
三、服務周期及報價
服務周期
自送樣起45個工作日。
服務報價
請詢價。
如您對SILAC定量感興趣或者需要技術支持,請您與我聯系QQ:3013422302 ,或者瀏覽我們公司的網站http://www.genecreate.cn/,可以搜索到您想要的服務信息,武漢金開瑞生物有限公司期待和您的合作。