PCR ARRAY介紹
PCR ARRAY又稱PCR芯片,運(yùn)用高通量熒光定量PCR方法,在一張96孔或384孔板上同時對某個信號通路或疾病相關(guān)基因的表達(dá)量變化進(jìn)行檢測,芯片上的基因包括了與研究對象有確定關(guān)系的基因或者待考證的基因;目前啟因生物針對不同的信號通路和疾病相關(guān)基因設(shè)計了150多款功能分類PCR芯片,涵蓋生命科學(xué)研究的各個領(lǐng)域。
人腫瘤micRNA PCR芯片介紹
MicroRNA (miRNA)是一類內(nèi)源性非編碼小RNA,廣泛存在于多種生物聽,通過調(diào)控靶基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)影響各種生命活動。啟因生物現(xiàn)有多種腫瘤相關(guān)micRNA PCR ARRAY,如肝癌,卵巢癌,胃癌,乳腺癌,前列腺癌等。
產(chǎn)品說明
產(chǎn)品名稱 |
人腫瘤micRNA PCR芯片 |
貨 號 |
sp-TWCPAHM-0013 |
基因數(shù)目 |
84個 |
基因名稱 |
見基因列表 |
檢測費(fèi)用 |
900元/樣 |
樣本類型 |
細(xì)胞,組織等 |
項目周期 |
2周(不含節(jié)假日) |
實驗結(jié)果 |
原始數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)分析 |
技術(shù)原理 |
*相對定量,SYBR Green法 |
*相對定量:用于測定一個測試樣本中目標(biāo)基因與校正樣本中同一基因表達(dá)的相對變化。校正樣本可以是一個未經(jīng)處理的對照或者是在一個實驗研究中處于零時的樣本。
服務(wù)特點
- 只需提供樣品
- 數(shù)據(jù)分析多樣性選擇
- 中低通量,一次性檢測多個相關(guān)基因的表達(dá)水平
- 周期短
- 結(jié)果不需要qPCR驗證
服務(wù)流程
- 確定實驗方案,簽合同
- 樣品寄出(-80℃順豐寄出)
- 收樣后進(jìn)行質(zhì)控
- 質(zhì)控過關(guān),上機(jī)檢測
- 數(shù)據(jù)分析
樣品預(yù)處理方法
為了避免樣品中RNA降解,需對樣品進(jìn)行預(yù)處理。
樣品類型 |
處理方法 |
送樣量 |
貼壁細(xì)胞 |
①倒出培養(yǎng)液,用 1×PBS 清洗一次。
② 每 10 cm2生長的培養(yǎng)細(xì)胞中加入 1-2 ml 的trizol,輕微晃動,確保使裂解液均勻分布于細(xì)胞表面。③ 將內(nèi)含細(xì)胞的裂解液轉(zhuǎn)移至離心管中,-80℃保存 |
至少1×106個細(xì)胞 |
懸浮細(xì)胞 |
①將懸浮培養(yǎng)細(xì)胞連同培養(yǎng)液一起倒入離心管中,8,000 g 4℃離心2 分鐘,棄上清。
② 向細(xì)胞中加入 1 ml 的 trizol,-80℃保存 |
至少1×106個細(xì)胞 |
組織(動物器官類) |
離心管中加1 ml 的 trizol,確保浸沒組織,-80℃保存 |
至少20mg,約小黃豆大小 |
檢測流程:
- 樣品總RNA提取
- RNA質(zhì)量檢測,檢測RNA純度及完整度,提供RNA質(zhì)量報告;
- cDNA合成,使用逆轉(zhuǎn)錄酶,將樣品RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA;
- 實時定量PCR反應(yīng);
- 數(shù)據(jù)分析,計算PCR芯片中的各個Ct值,采用ΔΔCt方法比較基因的表達(dá)變化,并利用公司自主開發(fā)的數(shù)據(jù)分析軟件進(jìn)行比較。
基因列表
hsa-let-7a-5p |
hsa-miR-145-5p |
hsa-miR-214-3p |
hsa-miR-373-3p |
hsa-let-7b-5p |
hsa-miR-147a |
hsa-miR-22-3p |
hsa-miR-375 |
hsa-let-7c-5p |
hsa-miR-152-3p |
hsa-miR-221-3p |
hsa-miR-376a-3p |
hsa-let-7d-5p |
hsa-miR-154-5p |
hsa-miR-222-3p |
hsa-miR-377-3p |
hsa-let-7i-5p |
hsa-miR-154-3p |
hsa-miR-223-3p |
hsa-miR-379-5p |
hsa-miR-1-3p |
hsa-miR-155-5p |
hsa-miR-224-5p |
hsa-miR-410-3p |
hsa-miR-100-5p |
hsa-miR-15a-5p |
hsa-miR-26a-5p |
hsa-miR-424-5p |
hsa-miR-101-3p |
hsa-miR-16-5p |
hsa-miR-27a-3p |
hsa-miR-429 |
hsa-miR-103a-3p |
hsa-miR-182-5p |
hsa-miR-29a-3p |
hsa-miR-432-5p |
hsa-miR-105-5p |
hsa-miR-195-5p |
hsa-miR-29c-3p |
hsa-miR-487b-3p |
hsa-miR-106b-5p |
hsa-miR-199a-3p |
hsa-miR-302b-3p |
hsa-miR-492 |
hsa-miR-10b-5p |
hsa-miR-199a-5p |
hsa-miR-302b-5p |
hsa-miR-493-3p |
hsa-miR-125b-5p |
hsa-miR-200a-3p |
hsa-miR-30a-5p |
hsa-miR-507 |
hsa-miR-125b-1-3p |
hsa-miR-200b-3p |
hsa-miR-30a-3p |
hsa-miR-514a-3p |
hsa-miR-126-3p |
hsa-miR-200c-3p |
hsa-miR-30e-5p |
hsa-miR-519d-3p |
hsa-miR-133a-3p |
hsa-miR-203a-3p |
hsa-miR-325 |
hsa-miR-519e-3p |
hsa-miR-134-5p |
hsa-miR-204-5p |
hsa-miR-335-5p |
hsa-miR-520e |
hsa-miR-137 |
hsa-miR-205-5p |
hsa-miR-346 |
hsa-miR-637 |
hsa-miR-140-5p |
hsa-miR-206 |
hsa-miR-34b-3p |
hsa-miR-9-5p |
hsa-miR-141-3p |
hsa-miR-21-5p |
hsa-miR-365a-3p |
hsa-miR-93-5p |
hsa-miR-143-3p |
hsa-miR-211-5p |
hsa-miR-370-3p |
hsa-miR-99a-5p |
(更多芯片基因列表可上www.pcrarray.cn查詢)
客戶文獻(xiàn)節(jié)選
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)
Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)
Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.(IF6.065)
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