PCR ARRAY介紹
PCR ARRAY又稱PCR芯片,運(yùn)用高通量熒光定量PCR方法,在一張96孔或384孔板上同時(shí)對(duì)某個(gè)信號(hào)通路或疾病相關(guān)基因的表達(dá)量變化進(jìn)行檢測(cè),芯片上的基因包括了與研究對(duì)象有確定關(guān)系的基因或者待考證的基因;目前啟因生物針對(duì)不同的信號(hào)通路和疾病相關(guān)基因設(shè)計(jì)了150多款功能分類PCR芯片,涵蓋生命科學(xué)研究的各個(gè)領(lǐng)域。
人腫瘤circRNA PCR芯片介紹
circRNA 與腫瘤 TNM 分型密切相關(guān)。circRNA 通過調(diào)控大量信號(hào)通路與腫瘤細(xì)胞的增殖、凋亡以及轉(zhuǎn)移密切關(guān)聯(lián),另外還能通過細(xì)胞外囊泡(e.g. 外泌體,納米微粒)進(jìn)行轉(zhuǎn)運(yùn),并且circRNA 具有低分子量、較好的穩(wěn)定性與保守性的特點(diǎn),因此,circRNA 具有作為治療腫瘤的藥物靶點(diǎn)或載體的潛能。啟因生物的人腫瘤circRNA PCR ARRAY含有94個(gè)人腫瘤circRNA 相關(guān)基因,包含乳腺癌,食管癌,非小細(xì)胞肺癌,肝癌,胃癌,膀胱癌,骨肉瘤,膠質(zhì)瘤等數(shù)十種腫瘤或癌癥類型。
產(chǎn)品說明
產(chǎn)品名稱 |
人腫瘤circRNA PCR芯片 |
貨 號(hào) |
sp-TWCPAHM-0012 |
基因數(shù)目 |
94個(gè) |
基因名稱 |
見基因列表 |
檢測(cè)費(fèi)用 |
1000元/樣 |
樣本類型 |
細(xì)胞,組織等 |
項(xiàng)目周期 |
2周(不含節(jié)假日) |
實(shí)驗(yàn)結(jié)果 |
原始數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)分析 |
技術(shù)原理 |
*相對(duì)定量,SYBR Green法 |
*相對(duì)定量:用于測(cè)定一個(gè)測(cè)試樣本中目標(biāo)基因與校正樣本中同一基因表達(dá)的相對(duì)變化。校正樣本可以是一個(gè)未經(jīng)處理的對(duì)照或者是在一個(gè)實(shí)驗(yàn)研究中處于零時(shí)的樣本。
服務(wù)特點(diǎn)
- 只需提供樣品
- 數(shù)據(jù)分析多樣性選擇
- 中低通量,一次性檢測(cè)多個(gè)相關(guān)基因的表達(dá)水平
- 周期短
- 結(jié)果不需要qPCR驗(yàn)證
服務(wù)流程
- 確定實(shí)驗(yàn)方案,簽合同
- 樣品寄出(-80℃順豐寄出)
- 收樣后進(jìn)行質(zhì)控
- 質(zhì)控過關(guān),上機(jī)檢測(cè)
- 數(shù)據(jù)分析
樣品預(yù)處理方法
為了避免樣品中RNA降解,需對(duì)樣品進(jìn)行預(yù)處理。
樣品類型 |
處理方法 |
送樣量 |
貼壁細(xì)胞 |
①倒出培養(yǎng)液,用 1×PBS 清洗一次。
② 每 10 cm2生長(zhǎng)的培養(yǎng)細(xì)胞中加入 1-2 ml 的trizol,輕微晃動(dòng),確保使裂解液均勻分布于細(xì)胞表面。③ 將內(nèi)含細(xì)胞的裂解液轉(zhuǎn)移至離心管中,-80℃保存 |
至少1×106個(gè)細(xì)胞 |
懸浮細(xì)胞 |
①將懸浮培養(yǎng)細(xì)胞連同培養(yǎng)液一起倒入離心管中,8,000 g 4℃離心2 分鐘,棄上清。
② 向細(xì)胞中加入 1 ml 的 trizol,-80℃保存 |
至少1×106個(gè)細(xì)胞 |
組織(動(dòng)物器官類) |
離心管中加1 ml 的 trizol,確保浸沒組織,-80℃保存 |
至少20mg,約小黃豆大小 |
檢測(cè)流程:
- 樣品總RNA提取
- RNA質(zhì)量檢測(cè),檢測(cè)RNA純度及完整度,提供RNA質(zhì)量報(bào)告;
- cDNA合成,使用逆轉(zhuǎn)錄酶,將樣品RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA;
- 實(shí)時(shí)定量PCR反應(yīng);
- 數(shù)據(jù)分析,計(jì)算PCR芯片中的各個(gè)Ct值,采用ΔΔCt方法比較基因的表達(dá)變化,并利用公司自主開發(fā)的數(shù)據(jù)分析軟件進(jìn)行比較。
基因列表
hsa_circ_0001445 |
hsa_circ_0001189 |
hsa_circ_0003222 |
hsa_circ_0001283 |
hsa_circ_0002111 |
hsa_circ_0002260 |
hsa_circ_0003707 |
hsa_circ_0001824 |
hsa_circ_0004458 |
hsa_circ_0024108 |
hsa_circ_0006022 |
hsa_circ_0001875 |
hsa_circ_0004771 |
hsa_circ_0036722 |
hsa_circ_0006633 |
hsa_circ_0004619 |
hsa_circ_0015278 |
hsa_circ_0058106 |
hsa_circ_0014717 |
hsa_circ_0006054 |
hsa_circ_0021553 |
hsa_circ_0058107 |
hsa_circ_0047905 |
hsa_circ_0006528 |
hsa_circ_0064557 |
hsa_circ_0007874 |
hsa_circ_0054971 |
hsa_circ_0008717 |
hsa_circ_0067103 |
hsa_circ_0000130 |
hsa_circ_0057104 |
hsa_circ_0008945 |
hsa_circ_0078738 |
hsa_circ_0000497 |
hsa_circ_0058766 |
hsa_circ_0018293 |
hsa_circ_0079891 |
hsa_circ_0001649 |
hsa_circ_0060108 |
hsa_circ_0005273 |
hsa_circ_0016347 |
hsa_circ_0001727 |
hsa_circ_0063561 |
hsa_circ_0007158 |
hsa_circ_0013339 |
hsa_circ_0003570 |
hsa_circ_0069131 |
hsa_circ_0041103 |
hsa_circ_0000284 |
hsa_circ_0004018 |
hsa_circ_0081146 |
hsa_circ_0061265 |
hsa_circ_0023404 |
hsa_circ_0005075 |
hsa_circ_0084720 |
hsa_circ_0082582 |
hsa_circ_0013958 |
hsa_circ_0005986 |
hsa_circ_0085553 |
hsa_circ_0002768 |
hsa_circ_0003028 |
hsa_circ_0000594 |
hsa_circ_0089548 |
hsa_circ_0075825 |
hsa_circ_0007915 |
hsa_circ_0004383 |
hsa_circ_0091742 |
hsa_circ_0075828 |
hsa_circ_0013255 |
hsa_circ_0000026 |
hsa_circ_0138960 |
hsa_circ_0075829 |
hsa_circ_0054345 |
hsa_circ_0000140 |
hsa_circ_0000069 |
hsa_circ_0004136 |
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hsa_circ_0000181 |
hsa_circ_0020397 |
hsa_circ_0017446 |
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hsa_circ_0000190 |
hsa_circ_0000098 |
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hsa_circ_0071410 |
hsa_circ_0000745 |
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hsa_circ_0001895 |
hsa_circ_0000893 |
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hsa_circ_0072765 |
hsa_circ_0003159 |
hsa_circ_0000911 |
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(更多芯片基因列表可上www.pcrarray.cn查詢)
客戶文獻(xiàn)節(jié)選
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)
Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)
Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.(IF6.065)
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