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Plant metabolomics(植物代謝組學(xué))
植物代謝組學(xué)是對植物的某一組織或細(xì)胞在一特定生理時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時進(jìn)行定性和定量分析。
服務(wù)類別:芯片與生物信息學(xué)總訪問:1480
最后更新:2022-3-24半年訪問:86
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植物代謝組學(xué)是對植物的某一組織或細(xì)胞在一特定生理時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時進(jìn)行定性和定量分析。它是以組群指標(biāo)分析為基礎(chǔ),以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理為手段,以信息建模與系統(tǒng)整合為目標(biāo), 從宏觀角度研究生物機(jī)體的生化變化,從而監(jiān)控或者評價基因功能。目前已知植物代謝產(chǎn)物達(dá)20萬種之多,相比之下, 微生物僅有1500 種代謝物,動物也只有2500種代謝物。我公司全二維GC-MS平臺為解決海量植物代謝產(chǎn)物帶來的科學(xué)研究困難提供了巨大助力。

技術(shù)路線和方法:

該服務(wù)方案是從樣本預(yù)處理到結(jié)果分析一整套全面解決方案,客戶只需要提供足夠的樣本就可以及時獲得科學(xué)結(jié)果。我們也可以針對客戶的實(shí)際情況量身定做方案,客戶也可以選取其中幾項(xiàng)服務(wù)。我們將竭誠為客戶解決問題。首先您跟我們溝通您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康呐c實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),或者讓我們專業(yè)的技術(shù)人員根據(jù)您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康膸椭O(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)。然后提供樣品,我們?yōu)槟瓿伤械膶?shí)驗(yàn)操作,并提供完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告和數(shù)據(jù)分析報(bào)告。 特別的,在項(xiàng)目結(jié)束后6個月的時間內(nèi)我們提供一次免費(fèi)報(bào)告修回和7×24h的問題答疑服務(wù)。根據(jù)您的需要,我們?yōu)槟扑]最合適的實(shí)驗(yàn)方案。

植物代謝組學(xué)平臺:
 

 

代謝組學(xué)平臺 型號 廠商 貨號
LC-MS ACQUITY UPLC/Micromass Q-TOF Premier MS Waters BT4000211
GC-Q-MS 7890A GC/5975C MS Agilent BT4000221
GC-TOF-MS Pegasus HT LECO(USA) BT4000223
GC×GC-TOF MS Pegasus 4D LECO (USA) BT4000222

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

樣品采集原則
 我們處理過各種類型的植物樣品,包括水稻,大麥,小麥,海帶,楊樹,柳樹,煙草,玉米,甘蔗,三角褐指藻等
植物樣本:采集后迅速冷凍(液氮),然后轉(zhuǎn)入-80 ℃ 保存
樣品采集步驟
A、 取樣,稱取100mg,液氮冰凍;
B、 勻漿化,球磨機(jī) 2min 20Hz,保持在-60℃環(huán)境下(低溫勻漿后,可以在-80℃保存至少3個月);
C、 酶滅活:加入1.4mL 100%甲醇(-20℃預(yù)冷),渦旋10s。再加入 60μL核糖醇(0.2mg/ml,in dH2O),再渦旋10s混勻;
D、 在thermomixer儀器上震蕩樣品10min, 950rpm, 70℃;
E、  離心10min,11000g;
F、  轉(zhuǎn)移上清到Schott GL14玻璃瓶中;
G、 加入750μL CHCl3(-20℃預(yù)冷) +1400μL dH2O(4℃預(yù)冷),渦旋混勻;
H、 離心15min 2200g;
I、   轉(zhuǎn)移150μL上清到1.5mL 反應(yīng)管中;
J、   在真空濃縮器中干燥提取物;
K、  儲存到-80℃(最好在儲存管中充滿氬氣或其他惰性氣體,在-80℃下可以保存至少3個月);干冰寄送。
 
 
如直接送凍存的植物樣品,請保證樣品大于200mg,避免反復(fù)凍融。

數(shù)據(jù)分析內(nèi)容:
基本數(shù)據(jù)分析
Part01:數(shù)據(jù)預(yù)處理
Part02:PCA分析
Part03:PLS-DA分析
Part04:OPLS-DA分析
Part05:差異化合物篩選
Part06:差異化合物鑒定
 
高級數(shù)據(jù)分析
Part07:代謝通路分析
Part08:代謝網(wǎng)絡(luò)分析
Part09:多組學(xué)數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析(具備多組學(xué)數(shù)據(jù))
 

 

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售后服務(wù)
售后服務(wù)包括:技術(shù)服務(wù)、數(shù)據(jù)處理和分析服務(wù)。
可關(guān)注我司微信公眾號:阿趣代謝,查看相關(guān)技術(shù)答疑。
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