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Agilent比較基因組雜交(CGH)芯片
aCGH芯片(array-based Comparative Genomic Hybridization,aCGH)平臺能夠支持研究人員精確掃描所研究物種的全基因組染色體的微小變化。
服務(wù)類別:芯片與生物信息學(xué)總訪問:1732
最后更新:2013-12-22半年訪問:1
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  • 公司簡介

  CGH芯片(array-based Comparative Genomic Hybridization,aCGH)是2005年安捷倫推出一種突破性的生物芯片平臺,這種平臺能夠支持研究人員精確掃描所研究物種的全基因組染色體的微小變化。安捷倫提供多種規(guī)格的CGH芯片,以人類CGH芯片為例,有以下8種芯片格式可供客戶選擇:

 

Agilent CGH Microarray

Format

SurePrint G3 Human CGH Microarray

1x1M,2x400K,4x180K,8x60K

Human Genome CGH Microarray

1x244K,2x105K,4x44K,8x15K

 

此外,安捷倫還提供其他多種物種的CGH芯片,如小鼠、大鼠以及各種模式生物等等。

 

 

技術(shù)特點(diǎn)

  • 開放式的系統(tǒng)設(shè)計(jì)

安捷倫執(zhí)行的是全球統(tǒng)一的芯片標(biāo)準(zhǔn),既可以為客戶提供全套解決方案,又可與其它技術(shù)平臺或客戶的自有技術(shù)銜接,為客戶提供最大的自由空間。

  • 獨(dú)特的制作技術(shù)

無需“光掩膜”的噴墨化學(xué)原位合成專利技術(shù)提供了芯片制作極大的穩(wěn)定性和靈活性,安捷倫可以提供高質(zhì)量的各種密度和規(guī)格的芯片(244K, 4x44K, 2x105K, 8x15K等),滿足客戶的各種需求。

  • 靈敏的檢測能力

60mer的探針設(shè)計(jì)賦予安捷倫芯片極佳的檢測性能,這對低豐度基因的檢測顯得尤為重要。在美國FDA組織的全球基因芯片質(zhì)量評估計(jì)劃(MAQC)中,在所有參與評估的當(dāng)今基因芯片主流產(chǎn)品中,安捷倫基因芯片能檢測出最多的基因數(shù)。

  • 方便的定制服務(wù)

安捷倫推出唯一的免費(fèi)芯片探針設(shè)計(jì)工具----eArray?蒲锌蛻糁恍韬唵蔚卿浖纯稍L問安捷倫公司的各種物種、不同應(yīng)用類型的基因芯片探針數(shù)據(jù)庫,在其中選擇符合自己要求的探針設(shè)計(jì)芯片。客戶也可以上載自己專有的基因序列信息來設(shè)計(jì)芯片,安捷倫根據(jù)您提交的設(shè)計(jì)方案為您量身定制您獨(dú)有的芯片產(chǎn)品。

 

檢測原理

aCGH的基本原理是用不同的熒光染料(常用Cyanine 3-dUTP和Cyanine 5-dUTP)分別標(biāo)記對照樣本基因組DNA與實(shí)驗(yàn)樣本基因組DNA,然后與制備好的aCGH微陣列芯片進(jìn)行雜交,通過掃描芯片檢測染色體上兩種熒光(紅、綠)的相對強(qiáng)度比率,兩組DNA相異的部分會顯出顏色偏移,可以計(jì)算出DNA的缺失與擴(kuò)增,從而了解實(shí)驗(yàn)樣本基因組DNA拷貝數(shù)的改變情況,并能同時(shí)在染色體上進(jìn)行精確定位。aCGH技術(shù)能在一次實(shí)驗(yàn)中實(shí)現(xiàn)全基因組掃描,檢測出所有染色體的不平衡變化,并且具有較高的分辨率。

應(yīng)用領(lǐng)域

  • CNV的檢測
  • 檢測正常人中的基因組拷貝數(shù)變化(CNV)。
  • 檢測和一些復(fù)雜疾病有關(guān)的常見或稀有的基因組拷貝數(shù)變化(CNV),如與心血管疾病、糖尿病、精神分裂癥、發(fā)育遲滯、自閉癥、自身免疫疾病等疾病相關(guān)聯(lián)的CNV。
  • 驗(yàn)證或確認(rèn)已經(jīng)鑒別的疾病關(guān)聯(lián)CNV。
    • 遺傳學(xué)/細(xì)胞遺傳學(xué)研究
  • 遺傳疾病的產(chǎn)前診斷及產(chǎn)后篩查研究。
  • 檢測致病性CNV(分辨率可達(dá)到外顯子水平)。
  • 檢測研究病人的染色體變異情況。
  • 鑒定由CNV引發(fā)的遺傳性疾病,如22q11微缺失綜合征、貓叫綜合征、Angelman綜合征、Prader-Willi綜合征、Wolf-Hirschhorn綜合征等等。
    • 癌癥研究
  • 對腫瘤病人中的染色體異常進(jìn)行全基因組范圍的研究。
  • 尋找癌癥易感性區(qū)域。
  • 尋找可用于腫瘤分類或分級的標(biāo)志性CNV。
  • 尋找新的治療靶向區(qū)域。
    • 模式生物研究
  • 鑒定正常的基因組變異(如進(jìn)化和品系發(fā)育研究)。
  • 在人類疾病的動物模型中鑒定疾病特異性的區(qū)域。

 

 

后續(xù)服務(wù)

1、針對客戶報(bào)告中各項(xiàng)內(nèi)容進(jìn)行解釋;

2、針對客戶疑問進(jìn)行實(shí)驗(yàn)原理、操作流程、數(shù)據(jù)分析方面的解答;

3、針對客戶需要提供定制芯片方面的信息咨詢。

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