成功研發(fā)出一種具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)且方便實(shí)用的miRNA定量檢測(cè)技術(shù)(RAM),這種方法具有高靈敏度、高特異性、低成本等特點(diǎn),目前已得到一定程度的應(yīng)用。
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miRNA(microRNA)是一類長(zhǎng)度約20-24nt的具有調(diào)控功能的非編碼單鏈RNA,在細(xì)胞增殖、凋亡、器官發(fā)生、發(fā)育、造血以及腫瘤發(fā)生等若干途徑中發(fā)揮重要作用。miRNA表達(dá)的定量分析是生物功能研究的基礎(chǔ),細(xì)胞、組織或血液中的miRNA的檢測(cè)有助于發(fā)現(xiàn)新的早期診斷和預(yù)測(cè)療效及患者預(yù)后的生物標(biāo)志物。但是在對(duì)成熟的miRNA檢測(cè)中,由于自身堿基數(shù)過(guò)少,同族miRNA之間通常只有一到兩個(gè)堿基的差別,而且絕大部分miRNA在細(xì)胞中的表達(dá)水平都比較低,這些特性使傳統(tǒng)檢測(cè)方法受到很大限制。目前常用的檢測(cè)miRNA方法有:
1、Northern Blot標(biāo)準(zhǔn)檢測(cè)方法,缺點(diǎn)是靈敏度低,需要幾十微克總RNA,費(fèi)時(shí)費(fèi)力
2、實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)基于實(shí)時(shí)熒光定量PCR和等溫放大的方法,優(yōu)點(diǎn)是靈敏度高
3、微陣列芯片檢測(cè)方法基于基因芯片的方法,優(yōu)點(diǎn)是通量高;缺點(diǎn)是有背景和雜信號(hào)干擾,特異性和準(zhǔn)確度較差
4、大規(guī)模測(cè)序方法利用Solexa等大規(guī)模測(cè)序技術(shù),進(jìn)行高通量多樣本的miRNA表達(dá)圖譜的分析,但是成本較高。
miRNA檢測(cè)方法
目前市場(chǎng)占主導(dǎo)地位的商品是Invitrogen公司(原ABI公司)開(kāi)發(fā)的實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法(TaqMan miRNA檢測(cè)方法)該方法在一定程度上克服了上述缺陷,但是仍具有高成本的缺點(diǎn)。我們通過(guò)自主創(chuàng)新,成功研發(fā)出一種具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)且方便實(shí)用的miRNA定量檢測(cè)技術(shù)(RAM),這種方法具有高靈敏度、高特異性、低成本等特點(diǎn),目前已得到一定程度的應(yīng)用。
RAM檢測(cè)方法的技術(shù)特點(diǎn)
1、靈敏度高:該方法的檢測(cè)靈敏度高達(dá)1000個(gè)拷貝數(shù),檢測(cè)范圍為103到1010拷貝數(shù),該方法足以檢測(cè)單個(gè)細(xì)胞中miRNA狀況的變化
2、特異性好:能對(duì)miRNA中只有一個(gè)堿基差別的同族序列進(jìn)行特異性檢測(cè)。獨(dú)特的RT-primer、bridge probes以及amplification primers(mainly P1)設(shè)計(jì)能夠區(qū)分3′、5′及中間區(qū)域的堿基差異(Figure3)。更為獨(dú)特的是,當(dāng)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)目的為檢測(cè)成熟miRNA時(shí),即使pre-miRNA的含量高達(dá)100倍,對(duì)檢測(cè)目標(biāo)的干擾并不會(huì)比背景干擾高
3、樣品處理簡(jiǎn)單:只需從樣品中提取總RNA,無(wú)需特殊處理,可對(duì)其中的miRNA進(jìn)行直接檢測(cè)?梢詸z測(cè)約單個(gè)細(xì)胞的miRNA(每個(gè)細(xì)胞的總RNA量約為0.02ng),以及不同組織的miRNA。
4、成本較低,無(wú)須TaqMan探針等昂貴試劑
5、多種內(nèi)參檢測(cè):我們方法可以對(duì)目前通用的內(nèi)參U6 snoRNA檢測(cè),也可檢測(cè)在組織中普遍穩(wěn)定表達(dá)的mir-191等miRNA內(nèi)參,可以方便的根據(jù)客戶的需求設(shè)計(jì)不同的內(nèi)參檢測(cè)
我們提供的miRNA檢測(cè)服務(wù)內(nèi)容包含
miRNA相對(duì)定量檢測(cè)
miRNA絕對(duì)定量檢測(cè)
另外,我們也提供對(duì)mRNA的檢測(cè)服務(wù)