全基因組表達(dá)譜芯片技術(shù)服務(wù)

全基因組基因表達(dá)譜的檢測對疾病研究有非常重要的意義。一方面，基因表達(dá)譜的檢測可以應(yīng)用于疾病生物標(biāo)記物的篩選。另一方面，基因表達(dá)譜的檢測可以為基因功能研究提供線索，有助于揭示疾病發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制。

Agilent表達(dá)譜芯片產(chǎn)品列表

Agilent還提供多類物種的表達(dá)譜芯片：
動物：兔、豬、斑馬魚、果蠅等            植物：水稻、玉米、擬南芥、煙草等           
微生物：大腸桿菌、酵母等

Agilent表達(dá)譜芯片特點(diǎn)
● 原位噴墨合成技術(shù)：原位合成的探針使得芯片平臺具有極高的穩(wěn)定性，噴墨合成技術(shù)可以大規(guī)模、靈活地合成探針，為客戶提供最新的芯片設(shè)計。
● 60mer的長探針：與短探針相比，具有更高的信噪比、靈敏度和特異性。
● 權(quán)威公認(rèn)：2006年美國FDA發(fā)表的主流芯片平臺評估報告MAQC中，Agilent array 的C-V值、檢測基因數(shù)目、與Taqman探針的重復(fù)性均處于國際同行業(yè)領(lǐng)先水平。

康成生物全基因組表達(dá)譜芯片主要實驗流程
1. 樣品RNA抽提：
    a. 實驗對象為組織樣品，取適量（50-100mg）新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品，使用BioPulverizerTM冰凍粉碎組織，加1ml的RNA抽提試劑TRIzol（Invitrogen），使用Mini- Bead-Beater-16勻漿后抽提RNA
    b. 實驗對象為細(xì)胞樣品，每份樣品取1×106～1×107細(xì)胞，加1ml的RNA抽提試劑TRIzol（樣品為貼壁細(xì)胞，每10cm2培養(yǎng)皿TRIzol使用量為1ml），裂解后抽提RNA
2. RNA質(zhì)量檢測：
    a. 使用Nanodrop測定RNA 在分光光度計260nm、280nm和230nm的吸收值，以計算濃度并評估純度
    b. 用甲醛電泳試劑進(jìn)行變性瓊脂糖凝膠電泳，檢測RNA純度及完整性
    c. 提供RNA QC報告
    注意：用于芯片檢測的RNA樣品，必須是高質(zhì)量的，完整的，沒有RNase污染（降解的樣品不能用于標(biāo)記和芯片檢測），沒有基因組污染。
3. cDNA/aRNA樣品合成和標(biāo)記
4. 標(biāo)記效率質(zhì)量檢測：
    使用Nanodrop檢測熒光標(biāo)記效率，標(biāo)記效率合格以保證后續(xù)芯片實驗結(jié)果的可靠性
5. 芯片雜交：
    在標(biāo)準(zhǔn)條件下將標(biāo)記好的探針和高密度基因組芯片進(jìn)行雜交
6. 圖像采集和數(shù)據(jù)分析：
    使用GenePix 4000B芯片掃描儀掃描芯片的熒光強(qiáng)度，并將實驗結(jié)果轉(zhuǎn)換成數(shù)字型數(shù)據(jù)保存，使用配套軟件對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行分析運(yùn)算
7. 提供實驗報告 包括詳細(xì)的實驗方法以及芯片實驗數(shù)據(jù)和圖表，以雙色標(biāo)記實驗為例：
    Scanning Image: Cy3、Cy5熒光掃描圖像
    Scatter Plot: 散點(diǎn)圖，X軸為Control（Cy3）數(shù)據(jù)值，Y軸為Exp(Cy5)數(shù)據(jù)值，表示芯片上兩通道數(shù)據(jù)總體分布集中趨勢；
    MA-plot: MA圖，X軸為A值[log2(Exp)+log2(Control)]/2，代表點(diǎn)的整體信號強(qiáng)度，Y軸為M 值log2(Exp)－log2(Control)表示點(diǎn)的兩通道信號差，可由MA圖觀察芯片數(shù)據(jù)是否存在強(qiáng)度依賴的系統(tǒng)偏移以及信號差異點(diǎn)的比例
    Raw Data: 探針的掃描熒光信號強(qiáng)度原始數(shù)據(jù)
    Normalized Ratio: 原始數(shù)據(jù)經(jīng)過統(tǒng)計學(xué)方法標(biāo)準(zhǔn)化后的比值的對數(shù)，log2(Exp/ Control)
    p –value: T-test統(tǒng)計分析顯著差異表達(dá)的基因，p-value越小，該基因在兩樣本間差異表達(dá)越顯著
    Significant Up & Down Regulated Gene List: 給出Fold Change>=2，p-value<0.05的基因列表

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上海康成生物工程有限公司自2002年起專注于生物科研技術(shù)服務(wù)，是國內(nèi)最早一批專業(yè)提供生命科學(xué)前沿研究技術(shù)服務(wù)的高科技企業(yè)。為進(jìn)一步拓展在醫(yī)學(xué)科研服務(wù)領(lǐng)域業(yè)務(wù)的深度和廣度，向多譜領(lǐng)域發(fā)展，重塑品牌 Aksomics（數(shù)譜生物）。Aksomics全面整合公司在非編碼RNA（lncRNA、circRNA、small RNA等）、表觀遺傳學(xué)、蛋白組學(xué)等檢測方向的核心技術(shù)，依靠自身優(yōu)秀的研發(fā)、技術(shù)、營銷和服務(wù)團(tuán)隊，憑借國際領(lǐng)先的技術(shù)平臺和高標(biāo)準(zhǔn)的質(zhì)控體系，形成了涵蓋表觀基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)等各個研究領(lǐng)域的一站式技術(shù)平臺。

【表觀基因組學(xué)】 DNA甲基化芯片、DNA羥甲基化芯片、染色質(zhì)免疫共沉淀芯片、DNA甲基化測序、DNA羥甲基化測序、染色質(zhì)免疫共沉淀測序、MeDIP-PCR、hMeDIP-PCR、ChIP-PCR等

【轉(zhuǎn)錄組學(xué)】LncRNA芯片、LncPath™芯片、環(huán)狀RNA芯片、T-UCR芯片、microRNA芯片、piRNA芯片、全基因組表達(dá)譜芯片、RNA測序、RNA m6A甲基化測序、small RNAs測序系列（microRNA測序、tRF&tiRNA測序、snoRNA測序、piRNA測序等）、LC-MS tRNA修飾檢測、 nrStar™ ncRNA PCR芯片（tRF&tiRNA，tRNA，snoRNA，F(xiàn)unctional LncRNA）、miRStar™癌癥特異性microRNA PCR芯片、NuRNATM mRNA PCR芯片、功能分類PCR芯片、LncRNA實時定量PCR、環(huán)狀RNA實時定量PCR、tRF&tiRNA實時定量PCR、microRNA實時定量PCR、mRNA實時定量PCR

【蛋白組學(xué)平臺】TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)服務(wù)、Lable-free定量蛋白組學(xué)服務(wù)、磷酸化修飾蛋白組學(xué)服務(wù)、泛素化修飾蛋白組學(xué)服務(wù)、N-糖基化修飾蛋白組學(xué)服務(wù)、乙�；�修飾蛋白組學(xué)服務(wù)、蛋白-蛋白相互作用組學(xué)

【代謝組學(xué)】靶向代謝組學(xué)、非靶向代謝組學(xué)

【外泌體組學(xué)】外泌體轉(zhuǎn)錄組學(xué)、外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)、外泌體代謝組學(xué)
康成生物為Agilent、Arraystar、Exiqon、Illumina、Qiagen、Thermo Fisher等國際知名品牌提供技術(shù)服務(wù)�？党煽蛻舨捎酶黝惣夹g(shù)服務(wù)發(fā)表的SCI論文已超560篇。康成生物將持續(xù)聚焦生命科學(xué)發(fā)展的挑戰(zhàn)，提供有競爭力的產(chǎn)品和服務(wù)，持續(xù)為客戶創(chuàng)造最大價值。

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