該芯片可一次雜交12個(gè)樣本,以提供高通量的,價(jià)格低廉的,以及不需要特殊設(shè)備的樣本檢測(cè)。該芯片旨在使檢測(cè)更加靈活以適用不同實(shí)驗(yàn)的要求。
※小鼠MouseWG-6 v2.0全基因組表達(dá)譜微珠芯片
每張芯片可同時(shí)檢測(cè)6個(gè)樣本,每樣本分析超過(guò)45200個(gè)轉(zhuǎn)錄本,基因信息來(lái)自于NCBI RefSeq database (Build 36, Release 22)、RIKEN FANTOM2 database、RefSeq Release 5(Build 33.1)以及MEEBO(Mouse Exonic Evidence Based Oligonucleotide)
※小鼠MouseRef-8 v2.0全基因組表達(dá)譜微珠芯片
每張芯片可同時(shí)檢測(cè)8個(gè)樣本,每樣本分析超過(guò)25600個(gè)轉(zhuǎn)錄本,基因信息來(lái)自于NCBI RefSeq database(Build 36, Release 22)
※大鼠RatRef-12全基因組表達(dá)譜微珠芯片
每張芯片可同時(shí)檢測(cè)12個(gè)樣本,每樣本分析超過(guò)22000個(gè)轉(zhuǎn)錄本,基因信息來(lái)自于NCBI RefSeq database(Release 16)
※Illumina定制芯片
根據(jù)用戶要研究的基因列表,進(jìn)行生物信息學(xué)分析及實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證挑選動(dòng)力學(xué)反應(yīng)最好的探針,用BeadArrayTM技術(shù)制成可同時(shí)檢測(cè)16個(gè)樣本的Sentrix Bead Chip芯片或同時(shí)檢測(cè)96個(gè)樣本的Sentrix Array Matrix芯片,每樣本可分析1400個(gè)人、小鼠、大鼠基因或700個(gè)其他物種基因
為了提供更多有生物學(xué)意義的結(jié)果,該芯片按照最新的數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)計(jì)了覆蓋全基因組范圍的檢測(cè)探針,主要包括已知基因,候選基因和不同的剪切體。
每張芯片上包含了31000多個(gè)來(lái)自最新的NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)(NCBI) RefSeq Release 38 (November 7, 2009)的基因信息并為這些基因設(shè)計(jì)了超過(guò)47000個(gè)探針。
——一次檢測(cè)12樣本使得大規(guī)模的表達(dá)譜可以以更快的速度和更低廉的價(jià)格進(jìn)行
——在芯片采用直接雜交法進(jìn)行檢測(cè),并用iScan, BeadArray Reader或HiScanSQ進(jìn)行掃描
——樣品標(biāo)記最少只需50ng總RNA即可完成
探針信息:
HumanHT-12 v4
RefSeq content (Release 38)
NM(成熟的mRNA) 28688
XM(轉(zhuǎn)錄序列) 11121
NR(不編碼的RNA,假基因或其他) 1752
XR(不編碼的轉(zhuǎn)錄序列) 2029
其他來(lái)源
Unigene數(shù)據(jù)庫(kù) 3461
總計(jì) 47231