生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)分析

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蛋白互作網(wǎng)絡(luò)，轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，micoRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，貝葉斯網(wǎng)絡(luò)

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網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建根據(jù)數(shù)據(jù)的不同和生物學(xué)實驗設(shè)計的不同，可以構(gòu)建多種生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)：轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，microRNA靶標(biāo)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，基因/蛋白互作網(wǎng)絡(luò)，代謝網(wǎng)絡(luò)，疾病網(wǎng)絡(luò)，……，等等。同時也可以構(gòu)建各種網(wǎng)絡(luò)的相互交叉和整合。

模塊(module)檢索蛋白質(zhì)間互作的發(fā)生依賴于特定的實驗條件,但是，由于目前互作鑒別技術(shù)內(nèi)在的局限性，互作信息還不能提供互作發(fā)生對應(yīng)的時空信息,現(xiàn)有的互作信息是靜態(tài)的信息，一組基因間的互作是多個實驗條件下互作關(guān)系的一種累積.因此，我們的目的是借助于基因表達(dá)譜提供的基因表達(dá)信息反映基因的活性然后對原始的互作網(wǎng)絡(luò)進(jìn) 行篩選，從而得到實驗條件下的應(yīng)答子網(wǎng).

網(wǎng)絡(luò)模塊的功能分析對于搜索出的模塊進(jìn)行生物學(xué)功能分析，有助于發(fā)現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)的具體生物學(xué)功能，并結(jié)合到已知的pathway或者process。

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